LIG1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LIG1, DNA ligase 1, LIGI, hLig1, IMD96 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 126391 MGI: 101789 HomoloGene: 197 GeneCards: LIG1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • DNA ligase (ATP) activity • зв'язування з іоном металу • ligase activity • ATP binding • DNA ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA recombination • DNA biosynthetic process • anatomical structure morphogenesis • Okazaki fragment processing involved in mitotic DNA replication • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • реплікація ДНК • V(D)J-рекомбінація • DNA mismatch repair • DNA ligation involved in DNA repair • клітинний цикл • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair • DNA ligation • lagging strand elongation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000234 NM_001289063 NM_001289064 NM_001320970 NM_001320971 |
| | NM_001083188 NM_001199310 NM_010715 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_000225 NP_001275992 NP_001275993 NP_001307899 NP_001307900 |
| | NP_001076657 NP_001186239 NP_034845 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 48.12 – 48.17 Mb | Хр. 7: 13.01 – 13.05 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LIG1 (англ. DNA ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 101 736[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQRSIMSFFH | | PKKEGKAKKP | | EKEASNSSRE | | TEPPPKAALK | | EWNGVVSESD |
SPVKRPGRKA | | ARVLGSEGEE | | EDEALSPAKG | | QKPALDCSQV | | SPPRPATSPE |
NNASLSDTSP | | MDSSPSGIPK | | RRTARKQLPK | | RTIQEVLEEQ | | SEDEDREAKR |
KKEEEEEETP | | KESLTEAEVA | | TEKEGEDGDQ | | PTTPPKPLKT | | SKAETPTESV |
SEPEVATKQE | | LQEEEEQTKP | | PRRAPKTLSS | | FFTPRKPAVK | | KEVKEEEPGA |
PGKEGAAEGP | | LDPSGYNPAK | | NNYHPVEDAC | | WKPGQKVPYL | | AVARTFEKIE |
EVSARLRMVE | | TLSNLLRSVV | | ALSPPDLLPV | | LYLSLNHLGP | | PQQGLELGVG |
DGVLLKAVAQ | | ATGRQLESVR | | AEAAEKGDVG | | LVAENSRSTQ | | RLMLPPPPLT |
ASGVFSKFRD | | IARLTGSAST | | AKKIDIIKGL | | FVACRHSEAR | | FIARSLSGRL |
RLGLAEQSVL | | AALSQAVSLT | | PPGQEFPPAM | | VDAGKGKTAE | | ARKTWLEEQG |
MILKQTFCEV | | PDLDRIIPVL | | LEHGLERLPE | | HCKLSPGIPL | | KPMLAHPTRG |
ISEVLKRFEE | | AAFTCEYKYD | | GQRAQIHALE | | GGEVKIFSRN | | QEDNTGKYPD |
IISRIPKIKL | | PSVTSFILDT | | EAVAWDREKK | | QIQPFQVLTT | | RKRKEVDASE |
IQVQVCLYAF | | DLIYLNGESL | | VREPLSRRRQ | | LLRENFVETE | | GEFVFATSLD |
TKDIEQIAEF | | LEQSVKDSCE | | GLMVKTLDVD | | ATYEIAKRSH | | NWLKLKKDYL |
DGVGDTLDLV | | VIGAYLGRGK | | RAGRYGGFLL | | ASYDEDSEEL | | QAICKLGTGF |
SDEELEEHHQ | | SLKALVLPSP | | RPYVRIDGAV | | IPDHWLDPSA | | VWEVKCADLS |
LSPIYPAARG | | LVDSDKGISL | | RFPRFIRVRE | | DKQPEQATTS | | AQVACLYRKQ |
SQIQNQQGED | | SGSDPEDTY |
Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Petrini J.H.J., Huwiler K.G., Weaver D.T. (1991). A wild-type DNA ligase I gene is expressed in Bloom's syndrome cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7615—7619. PMID 1881902 DOI:10.1073/pnas.88.17.7615
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Pascal J.M., O'Brien P.J., Tomkinson A.E., Ellenberger T. (2004). Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA. Nature. 432: 473—478. PMID 15565146 DOI:10.1038/nature03082
- Barnes D.E., Tomkinson A.E., Lehmann A.R., Webster A.D.B., Lindahl T. (1992). Mutations in the DNA ligase I gene of an individual with immunodeficiencies and cellular hypersensitivity to DNA-damaging agents. Cell. 69: 495—503. PMID 1581963 DOI:10.1016/0092-8674(92)90450-Q
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6598 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P18858 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |