LITAF
LITAF | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | LITAF, PIG7, SIMPLE, TP53I7, lipopolysaccharide induced TNF factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603795 MGI: 1929512 HomoloGene: 37974 GeneCards: LITAF | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Charcot-Marie-Tooth disease type 1C[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 11.55 – 11.64 Mb | Хр. 16: 10.78 – 10.88 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
LITAF (англ. Lipopolysaccharide induced TNF factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 17 107[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSVPGPYQAA | TGPSSAPSAP | PSYEETVAVN | SYYPTPPAPM | PGPTTGLVTG | ||||
PDGKGMNPPS | YYTQPAPIPN | NNPITVQTVY | VQHPITFLDR | PIQMCCPSCN | ||||
KMIVSQLSYN | AGALTWLSCG | SLCLLGCIAG | CCFIPFCVDA | LQDVDHYCPN | ||||
CRALLGTYKR | L |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- Polyak K., Xia Y., Zweier J.L., Kinzler K.W., Vogelstein B. (1997). A model for p53-induced apoptosis. Nature. 389: 300—306. PMID 9305847 DOI:10.1038/38525
- Myokai F., Takashiba S., Lebo R., Amar S. (1999). A novel lipopolysaccharide-induced transcription factor regulating tumor necrosis factor alpha gene expression: molecular cloning, sequencing, characterization, and chromosomal assignment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4518—4523. PMID 10200294 DOI:10.1073/pnas.96.8.4518
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shirk A.J., Anderson S.K., Hashemi S.H., Chance P.F., Bennett C.L. (2005). SIMPLE interacts with NEDD4 and TSG101: evidence for a role in lysosomal sorting and implications for Charcot-Marie-Tooth disease. J. Neurosci. Res. 82: 43—50. PMID 16118794 DOI:10.1002/jnr.20628
- Tang X., Marciano D.L., Leeman S.E., Amar S. (2005). LPS induces the interaction of a transcription factor, LPS-induced TNF-alpha factor, and STAT6(B) with effects on multiple cytokines. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 5132—5137. PMID 15793005 DOI:10.1073/pnas.0501159102
- Tang X., Metzger D., Leeman S., Amar S. (2006). LPS-induced TNF-alpha factor (LITAF)-deficient mice express reduced LPS-induced cytokine: Evidence for LITAF-dependent LPS signaling pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 13777—13782. PMID 16954198 DOI:10.1073/pnas.0605988103
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LITAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16841 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q99732 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 16
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |