LY96

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E56, 2E59, 2Z65, 3FXI, 3ULA, 4G8A

Ідентифікатори

Символи

LY96, ESOP-1, MD-2, MD2, ly-96, lymphocyte antigen 96

Зовнішні ІД

OMIM: 605243 MGI: 1341909 HomoloGene: 9109 GeneCards: LY96

Онтологія гена
Молекулярна функція	• coreceptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipopolysaccharide immune receptor activity • lipopolysaccharide binding • Toll-like receptor 4 binding
Клітинна компонента	• intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • extracellular region • lipopolysaccharide receptor complex • endosome membrane • міжклітинний простір
Біологічний процес	• toll-like receptor 4 signaling pathway • процес імунної системи • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • cellular defense response • cell surface receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • positive regulation of tumor necrosis factor production • inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • detection of lipopolysaccharide • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • apoptotic signaling pathway • toll-like receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23643


17087

Ensembl


ENSG00000154589


ENSMUSG00000025779

UniProt


Q9Y6Y9


Q9JHF9

RefSeq (мРНК)


NM_001195797 NM_015364


NM_001159711 NM_016923

RefSeq (білок)


NP_001182726 NP_056179


NP_001153183 NP_058619

Локус (UCSC)

Хр. 8: 73.99 – 74.03 Mb

Хр. 1: 16.76 – 16.78 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LY96 (англ. Lymphocyte antigen 96) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 160 амінокислот, а молекулярна маса — 18 546^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPFLFFSTL	FSSIFTEAQK	QYWVCNSSDA	SISYTYCDKM	QYPISINVNP
CIELKRSKGL	LHIFYIPRRD	LKQLYFNLYI	TVNTMNLPKR	KEVICRGSDD
DYSFCRALKG	ETVNTTISFS	FKGIKFSKGK	YKCVVEAISG	SPEEMLFCLE
FVILHQPNSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
da Silva Correia J., Soldau K., Christen U., Tobias P.S., Ulevitch R.J. (2001). Lipopolysaccharide is in close proximity to each of the proteins in its membrane receptor complex. transfer from CD14 to TLR4 and MD-2. J. Biol. Chem. 276: 21129—21135. PMID 11274165 DOI:10.1074/jbc.M009164200
Dziarski R., Wang Q., Miyake K., Kirschning C.J., Gupta D. (2001). MD-2 enables Toll-like receptor 2 (TLR2)-mediated responses to lipopolysaccharide and enhances TLR2-mediated responses to Gram-positive and Gram-negative bacteria and their cell wall components. J. Immunol. 166: 1938—1944. PMID 11160242 DOI:10.4049/jimmunol.166.3.1938
Visintin A., Mazzoni A., Spitzer J.A., Segal D.M. (2001). Secreted MD-2 is a large polymeric protein that efficiently confers lipopolysaccharide sensitivity to Toll-like receptor 4. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 12156—12161. PMID 11593030 DOI:10.1073/pnas.211445098
Ohto U., Fukase K., Miyake K., Satow Y. (2007). Crystal structures of human MD-2 and its complex with antiendotoxic lipid IVa. Science. 316: 1632—1634. PMID 17569869 DOI:10.1126/science.1139111
Kato K., Morrison A.M., Nakano T., Tashiro K., Honjo T. (2000). ESOP-1, a secreted protein expressed in the hematopoietic, nervous, and reproductive systems of embryonic and adult mice. Blood. 96: 362—364. PMID 10891475

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17156 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6Y9 (англ.) . Архів оригіналу за 14 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.