MARF1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2DGX, 2DIU | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MARF1, LKAP, PPP1R34, KIAA0430, LMKB, meiosis regulator and mRNA stability factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614593 MGI: 2444505 HomoloGene: 40967 GeneCards: MARF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • RNA binding • nucleic acid binding • молекулярна функція |
---|
Клітинна компонента | • пероксисома • мембрана • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of phosphatase activity • регуляція експресії генів • диференціація клітин • GO:0007126 мейоз • female meiotic nuclear division • double-strand break repair • Оогенез |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000166783 ENSG00000277140 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001184998 NM_001184999 NM_014647 NM_019081 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001171927 NP_001171928 NP_055462 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 15.59 – 15.64 Mb | Хр. 16: 13.93 – 13.98 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MARF1 (англ. Meiosis regulator and mRNA stability factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 742 амінокислот, а молекулярна маса — 192 859[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMEGNGTENS | | CSRTRGWLQQ | | DNDAKPWLWK | | FSNCFSRPEQ | | TLPHSPQTKE |
YMENKKVAVE | | LKDVPSPLHA | | GSKLFPAVPL | | PDIRSLQQPK | | IQLSSVPKVS |
CCAHCPNEPS | | TSPMRFGGGG | | GGSGGTSSLI | | HPGALLDSQS | | TRTITCQVGS |
GFAFQSASSL | | QNASARNNLA | | GIASDFPSMC | | LESNLSSCKH | | LPCCGKLHFQ |
SCHGNVHKLH | | QFPSLQGCTS | | AGYFPCSDFT | | SGAPGHLEEH | | ISQSELTPHL |
CTNSLHLNVV | | PPVCLKGSLY | | CEDCLNKPAR | | NSIIDAAKVW | | PNIPPPNTQP |
APLAVPLCNG | | CGTKGTGKET | | TLLLATSLGK | | AASKFGSPEV | | AVAGQVLENL |
PPIGVFWDIE | | NCSVPSGRSA | | TAVVQRIREK | | FFKGHREAEF | | ICVCDISKEN |
KEVIQELNNC | | QVTVAHINAT | | AKNAADDKLR | | QSLRRFANTH | | TAPATVVLVS |
TDVNFALELS | | DLRHRHGFHI | | ILVHKNQASE | | ALLHHANELI | | RFEEFISDLP |
PRLPLKMPQC | | HTLLYVYNLP | | ANKDGKSVSN | | RLRRLSDNCG | | GKVLSITGCS |
AILRFINQDS | | AERAQKRMEN | | EDVFGNRIIV | | SFTPKNRELC | | ETKSSNAIAD |
KVKSPKKLKN | | PKLCLIKDAS | | EQSSSAKATP | | GKGSQANSGS | | ATKNTNVKSL |
QELCRMESKT | | GHRNSEHQQG | | HLRLVVPTHG | | NSSAAVSTPK | | NSGVAEPVYK |
TSQKKENLSA | | RSVTSSPVEK | | KDKEETVFQV | | SYPSAFSKLV | | ASRQVSPLLA |
SQSWSSRSMS | | PNLLNRASPL | | AFNIANSSSE | | ADCPDPFANG | | ADVQVSNIDY |
RLSRKELQQL | | LQEAFARHGK | | VKSVELSPHT | | DYQLKAVVQM | | ENLQDAIGAV |
NSLHRYKIGS | | KKILVSLATG | | AASKSLSLLS | | AETMSVLQDA | | PACCLPLFKF |
TDIYEKKFGH | | KLNVSDLYKL | | TDTVAIREQG | | NGRLVCLLPS | | SQARQSPLGS |
SQSHDGSSTN | | CSPIIFEELE | | YHEPVCRQHC | | SNKDFSEHEF | | DPDSYKIPFV |
ILSLKTFAPQ | | VHSLLQTHEG | | TVPLLSFPDC | | YIAEFGDLEV | | VQENQGGVPL |
EHFITCVPGV | | NIATAQNGIK | | VVKWIHNKPP | | PPNTDPWLLR | | SKSPVGNPQL |
IQFSREVIDL | | LKSQPSCVIP | | ISHFIPSYHH | | HFAKQCRVSD | | YGYSKLIELL |
EAVPHVLQIL | | GMGSKRLLTL | | THRAQVKRFT | | QDLLKLLKSQ | | ASKQVIVREF |
SQAYHWCFSK | | DWDVTEYGVC | | ELIDIVSEIP | | DTTICLSQQD | | NEMVICIPKR |
ERTQDEIERT | | KQFSKDVVDL | | LRHQPHFRMP | | FNKFIPSYHH | | HFGRQCKLAY |
YGFTKLLELF | | EAIPDTLQVL | | ECGEEKILTL | | TEVERFKALA | | AQFVKLLRSQ |
KDNCLMMTDL | | LTEYAKTFGY | | TFRLQDYDVS | | SISALTQKLC | | HVVKVADIES |
GRQIQLINRK | | SLRSLTAQLL | | VLLMSWEGTT | | HLSVEELKRH | | YESTHNTPLN |
PCEYGFMTLT | | ELLKSLPYLV | | EVFTNDKMEE | | CVKLTSLYLF | | AKNVRSLLHT |
YHYQQIFLHE | | FSMAYTKYVG | | ETLQPKTYGH | | SSVEELLGAI | | PQVVWIKGHG |
HKRIVVLKND | | MKSRLSSLSL | | SPANHENQPS | | EGERILEVPE | | SHTASELKLG |
ADGSGPSHTE | | QELLRLTDDS | | PVDLLCAPVP | | SCLPSPQLRP | | DPVILQSADL |
IQFEERPQEP | | SEIMILNQEE | | KMEIPIPGKS | | KTLTSDSSSS | | CISAAVPVPP |
CPSSETSESL | | LSKDPVESPA | | KKQPKNRVKL | | AANFSLAPIT | | KL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у пероксисомах.
Література
- Dunster K., Lai F.P.L., Sentry J.W. (2005). Limkain b1, a novel human autoantigen localized to a subset of ABCD3 and PXF marked peroxisomes. Clin. Exp. Immunol. 140: 556—563. PMID 15932519 DOI:10.1111/j.1365-2249.2005.02774.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122
- Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29562 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y4F3 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |