NEDD4 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/29/NEDD4_HECT_domain_structure_from_PDB_ID_2XBF.png/250px-NEDD4_HECT_domain_structure_from_PDB_ID_2XBF.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2KPZ, 2KQ0, 2M3O, 2XBB, 2XBF, 3B7Y, 4BBN, 4BE8, 4N7F, 4N7H, 5C91, 5AHT, 5C7J | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NEDD4, NEDD4-1, RPF1, neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602278 MGI: 97297 HomoloGene: 136740 GeneCards: NEDD4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein domain specific binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • sodium channel inhibitor activity • beta-2 adrenergic receptor binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • proline-rich region binding • phosphoserine residue binding • phosphothreonine residue binding • ionotropic glutamate receptor binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • ubiquitin ligase complex • клітинна мембрана • apicolateral plasma membrane • cell cortex • perinuclear region of cytoplasm • Хроматин • екзосома • dendritic spine • glutamatergic synapse • postsynaptic cytosol |
---|
Біологічний процес | • protein targeting to lysosome • адаптивна імунна відповідь • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • blood vessel morphogenesis • negative regulation of sodium ion transport • cellular response to UV • endocardial cushion development • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • protein K63-linked ubiquitination • regulation of membrane potential • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity • regulation of ion transmembrane transport • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage • outflow tract morphogenesis • receptor internalization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • protein monoubiquitination • receptor catabolic process • нейробіологія розвитку • regulation of dendrite morphogenesis • response to calcium ion • positive regulation of nucleocytoplasmic transport • neuromuscular junction development • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of potassium ion transmembrane transporter activity • lysosomal transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • progesterone receptor signaling pathway • GO:0022415 viral process • neuron projection development • GO:1904739 regulation of synapse organization • T cell activation • regulation of macroautophagy • glucocorticoid receptor signaling pathway • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4f/PBB_GE_NEDD4_213012_at_fs.png/250px-PBB_GE_NEDD4_213012_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001284338 NM_001284339 NM_001284340 NM_006154 NM_198400
| NM_001329212 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001271267 NP_001271268 NP_001271269 NP_001316141 NP_006145
| NP_940682 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 55.83 – 55.99 Mb | Хр. 9: 72.66 – 72.75 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NEDD4 (англ. Neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 319 амінокислот, а молекулярна маса — 149 114[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQSLRLHFA | | ARRSNTYPLS | | ETSGDDLDSH | | VHMCFKRPTR | | ISTSNVVQMK |
LTPRQTALAP | | LIKENVQSQE | | RSSVPSSENV | | NKKSSCLQIS | | LQPTRYSGYL |
QSSNVLADSD | | DASFTCILKD | | GIYSSAVVDN | | ELNAVNDGHL | | VSSPAICSGS |
LSNFSTSDNG | | SYSSNGSDFG | | SCASITSGGS | | YTNSVISDSS | | SYTFPPSDDT |
FLGGNLPSDS | | TSNRSVPNRN | | TTPCEIFSRS | | TSTDPFVQDD | | LEHGLEIMKL |
PVSRNTKIPL | | KRYSSLVIFP | | RSPSTTRPTS | | PTSLCTLLSK | | GSYQTSHQFI |
ISPSEIAHNE | | DGTSAKGFLS | | TAVNGLRLSK | | TICTPGEVRD | | IRPLHRKGSL |
QKKIVLSNNT | | PRQTVCEKSS | | EGYSCVSVHF | | TQRKAATLDC | | ETTNGDCKPE |
MSEIKLNSDS | | EYIKLMHRTS | | ACLPSSQNVD | | CQININGELE | | RPHSQMNKNH |
GILRRSISLG | | GAYPNISCLS | | SLKHNCSKGG | | PSQLLIKFAS | | GNEGKVDNLS |
RDSNRDCTNE | | LSNSCKTRDD | | FLGQVDVPLY | | PLPTENPRLE | | RPYTFKDFVL |
HPRSHKSRVK | | GYLRLKMTYL | | PKTSGSEDDN | | AEQAEELEPG | | WVVLDQPDAA |
CHLQQQQEPS | | PLPPGWEERQ | | DILGRTYYVN | | HESRRTQWKR | | PTPQDNLTDA |
ENGNIQLQAQ | | RAFTTRRQIS | | EETESVDNRE | | SSENWEIIRE | | DEATMYSNQA |
FPSPPPSSNL | | DVPTHLAEEL | | NARLTIFGNS | | AVSQPASSSN | | HSSRRGSLQA |
YTFEEQPTLP | | VLLPTSSGLP | | PGWEEKQDER | | GRSYYVDHNS | | RTTTWTKPTV |
QATVETSQLT | | SSQSSAGPQS | | QASTSDSGQQ | | VTQPSEIEQG | | FLPKGWEVRH |
APNGRPFFID | | HNTKTTTWED | | PRLKIPAHLR | | GKTSLDTSND | | LGPLPPGWEE |
RTHTDGRIFY | | INHNIKRTQW | | EDPRLENVAI | | TGPAVPYSRD | | YKRKYEFFRR |
KLKKQNDIPN | | KFEMKLRRAT | | VLEDSYRRIM | | GVKRADFLKA | | RLWIEFDGEK |
GLDYGGVARE | | WFFLISKEMF | | NPYYGLFEYS | | ATDNYTLQIN | | PNSGLCNEDH |
LSYFKFIGRV | | AGMAVYHGKL | | LDGFFIRPFY | | KMMLHKPITL | | HDMESVDSEY |
YNSLRWILEN | | DPTELDLRFI | | IDEELFGQTH | | QHELKNGGSE | | IVVTNKNKKE |
YIYLVIQWRF | | VNRIQKQMAA | | FKEGFFELIP | | QDLIKIFDEN | | ELELLMCGLG |
DVDVNDWREH | | TKYKNGYSAN | | HQVIQWFWKA | | VLMMDSEKRI | | RLLQFVTGTS |
RVPMNGFAEL | | YGSNGPQSFT | | VEQWGTPEKL | | PRAHTCFNRL | | DLPPYESFEE |
LWDKLQMAIE | | NTQGFDGVD |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pham N., Rotin D. (2001). Nedd4 regulates ubiquitination and stability of the guanine-nucleotide exchange factor CNrasGEF. J. Biol. Chem. 276: 46995—47003. PMID 11598133 DOI:10.1074/jbc.M108373200
- Okumura A., Pitha P.M., Harty R.N. (2008). ISG15 inhibits Ebola VP40 VLP budding in an L-domain-dependent manner by blocking Nedd4 ligase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 3974—3979. PMID 18305167 DOI:10.1073/pnas.0710629105
- Nabhan J.F., Pan H., Lu Q. (2010). Arrestin domain-containing protein 3 recruits the NEDD4 E3 ligase to mediate ubiquitination of the beta2-adrenergic receptor. EMBO Rep. 11: 605—611. PMID 20559325 DOI:10.1038/embor.2010.80
- Qi S., O'Hayre M., Gutkind J.S., Hurley J.H. (2014). Structural and biochemical basis for ubiquitin ligase recruitment by arrestin-related domain-containing protein-3 (ARRDC3). J. Biol. Chem. 289: 4743—4752. PMID 24379409 DOI:10.1074/jbc.M113.527473
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7727 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P46934 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |