NEDD4

NEDD4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2KPZ, 2KQ0, 2M3O, 2XBB, 2XBF, 3B7Y, 4BBN, 4BE8, 4N7F, 4N7H, 5C91, 5AHT, 5C7J

Ідентифікатори
Символи NEDD4, NEDD4-1, RPF1, neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД OMIM: 602278 MGI: 97297 HomoloGene: 136740 GeneCards: NEDD4
Онтологія гена
Молекулярна функція

• protein domain specific binding
• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
• sodium channel inhibitor activity
• beta-2 adrenergic receptor binding
• ubiquitin binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• RNA polymerase binding
• proline-rich region binding
• phosphoserine residue binding
• phosphothreonine residue binding
• ionotropic glutamate receptor binding
• transferase activity
• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• комплекс Ґольджі
• мембрана
• ubiquitin ligase complex
• клітинна мембрана
• apicolateral plasma membrane
• cell cortex
• perinuclear region of cytoplasm
• Хроматин
• екзосома
• dendritic spine
• glutamatergic synapse
• postsynaptic cytosol

Біологічний процес

• protein targeting to lysosome
• адаптивна імунна відповідь
• GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process
• blood vessel morphogenesis
• negative regulation of sodium ion transport
• cellular response to UV
• endocardial cushion development
• negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
• protein K63-linked ubiquitination
• regulation of membrane potential
• negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity
• regulation of ion transmembrane transport
• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage
• outflow tract morphogenesis
• receptor internalization
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• protein monoubiquitination
• receptor catabolic process
• нейробіологія розвитку
• regulation of dendrite morphogenesis
• response to calcium ion
• positive regulation of nucleocytoplasmic transport
• neuromuscular junction development
• Убіквітин-залежний протеоліз
• regulation of potassium ion transmembrane transporter activity
• lysosomal transport
• ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
• progesterone receptor signaling pathway
• GO:0022415 viral process
• neuron projection development
• GO:1904739 regulation of synapse organization
• T cell activation
• regulation of macroautophagy
• glucocorticoid receptor signaling pathway
• protein polyubiquitination
• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4734
17999
Ensembl
ENSG00000069869
ENSMUSG00000032216
UniProt
P46934
P46935
RefSeq (мРНК)
NM_001284338
NM_001284339
NM_001284340
NM_006154
NM_198400
NM_001329212
NM_010890
RefSeq (білок)
NP_001271267
NP_001271268
NP_001271269
NP_001316141
NP_006145
NP_940682
NP_035020
NP_001344927
Локус (UCSC) Хр. 15: 55.83 – 55.99 Mb Хр. 9: 72.66 – 72.75 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NEDD4 (англ. Neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 319 амінокислот, а молекулярна маса — 149 114[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAQSLRLHFAARRSNTYPLSETSGDDLDSHVHMCFKRPTRISTSNVVQMK
LTPRQTALAPLIKENVQSQERSSVPSSENVNKKSSCLQISLQPTRYSGYL
QSSNVLADSDDASFTCILKDGIYSSAVVDNELNAVNDGHLVSSPAICSGS
LSNFSTSDNGSYSSNGSDFGSCASITSGGSYTNSVISDSSSYTFPPSDDT
FLGGNLPSDSTSNRSVPNRNTTPCEIFSRSTSTDPFVQDDLEHGLEIMKL
PVSRNTKIPLKRYSSLVIFPRSPSTTRPTSPTSLCTLLSKGSYQTSHQFI
ISPSEIAHNEDGTSAKGFLSTAVNGLRLSKTICTPGEVRDIRPLHRKGSL
QKKIVLSNNTPRQTVCEKSSEGYSCVSVHFTQRKAATLDCETTNGDCKPE
MSEIKLNSDSEYIKLMHRTSACLPSSQNVDCQININGELERPHSQMNKNH
GILRRSISLGGAYPNISCLSSLKHNCSKGGPSQLLIKFASGNEGKVDNLS
RDSNRDCTNELSNSCKTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFKDFVL
HPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAA
CHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDA
ENGNIQLQAQRAFTTRRQISEETESVDNRESSENWEIIREDEATMYSNQA
FPSPPPSSNLDVPTHLAEELNARLTIFGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQA
YTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTV
QATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGWEVRH
APNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEE
RTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRR
KLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEK
GLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDH
LSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEY
YNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKE
YIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLG
DVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTS
RVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEE
LWDKLQMAIENTQGFDGVD

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pham N., Rotin D. (2001). Nedd4 regulates ubiquitination and stability of the guanine-nucleotide exchange factor CNrasGEF. J. Biol. Chem. 276: 46995—47003. PMID 11598133 DOI:10.1074/jbc.M108373200
  • Okumura A., Pitha P.M., Harty R.N. (2008). ISG15 inhibits Ebola VP40 VLP budding in an L-domain-dependent manner by blocking Nedd4 ligase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 3974—3979. PMID 18305167 DOI:10.1073/pnas.0710629105
  • Nabhan J.F., Pan H., Lu Q. (2010). Arrestin domain-containing protein 3 recruits the NEDD4 E3 ligase to mediate ubiquitination of the beta2-adrenergic receptor. EMBO Rep. 11: 605—611. PMID 20559325 DOI:10.1038/embor.2010.80
  • Qi S., O'Hayre M., Gutkind J.S., Hurley J.H. (2014). Structural and biochemical basis for ubiquitin ligase recruitment by arrestin-related domain-containing protein-3 (ARRDC3). J. Biol. Chem. 289: 4743—4752. PMID 24379409 DOI:10.1074/jbc.M113.527473

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7727 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P46934 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 15
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.