NLRP2

Ідентифікатори

Символи

NLRP2, CLR19.9, NALP2, NBS1, PAN1, PYPAF2, NLR family, pyrin domain containing 2, NLR family pyrin domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 609364 MGI: 3041206 HomoloGene: 56789 GeneCards: NLRP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• Pyrin domain binding • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • inflammatory response • вроджений імунітет • процес імунної системи • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55655


232827

Ensembl

ENSG00000278789 ENSG00000275796 ENSG00000277060 ENSG00000275843 ENSG00000275399
ENSG00000022556 ENSG00000275082 ENSG00000278682 ENSG00000274638 ENSG00000273992


ENSMUSG00000035177

UniProt


Q9NX02


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_017852 NM_001174081 NM_001174082 NM_001174083 NM_001348003


NM_177690

RefSeq (білок)


NP_001167552 NP_001167553 NP_001167554 NP_060322 NP_001334932


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 54.95 – 55 Mb

Хр. 7: 5.3 – 5.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NLRP2 (англ. NLR family pyrin domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 062 амінокислот, а молекулярна маса — 120 515^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVSSAQMGFN	LQALLEQLSQ	DELSKFKYLI	TTFSLAHELQ	KIPHKEVDKA
DGKQLVEILT	THCDSYWVEM	ASLQVFEKMH	RMDLSERAKD	EVREAALKSF
NKRKPLSLGI	TRKERPPLDV	DEMLERFKTE	AQAFTETKGN	VICLGKEVFK
GKKPDKDNRC	RYILKTKFRE	MWKSWPGDSK	EVQVMAERYK	MLIPFSNPRV
LPGPFSYTVV	LYGPAGLGKT	TLAQKLMLDW	AEDNLIHKFK	YAFYLSCREL
SRLGPCSFAE	LVFRDWPELQ	DDIPHILAQA	RKILFVIDGF	DELGAAPGAL
IEDICGDWEK	KKPVPVLLGS	LLNRVMLPKA	ALLVTTRPRA	LRDLRILAEE
PIYIRVEGFL	EEDRRAYFLR	HFGDEDQAMR	AFELMRSNAA	LFQLGSAPAV
CWIVCTTLKL	QMEKGEDPVP	TCLTRTGLFL	RFLCSRFPQG	AQLRGALRTL
SLLAAQGLWA	QTSVLHREDL	ERLGVQESDL	RLFLDGDILR	QDRVSKGCYS
FIHLSFQQFL	TALFYTLEKE	EEEDRDGHTW	DIGDVQKLLS	GVERLRNPDL
IQAGYYSFGL	ANEKRAKELE	ATFGCRMSPD	IKQELLRCDI	SCKGGHSTVT
DLQELLGCLY	ESQEEELVKE	VMAQFKEISL	HLNAVDVVPS	SFCVKHCRNL
QKMSLQVIKE	NLPENVTASE	SDAEVERSQD	DQHMLPFWTD	LCSIFGSNKD
LMGLAINDSF	LSASLVRILC	EQIASDTCHL	QRVVFKNISP	ADAHRNLCLA
LRGHKTVTYL	TLQGNDQDDM	FPALCEVLRH	PECNLRYLGL	VSCSATTQQW
ADLSLALEVN	QSLTCVNLSD	NELLDEGAKL	LYTTLRHPKC	FLQRLSLENC
HLTEANCKDL	AAVLVVSREL	THLCLAKNPI	GNTGVKFLCE	GLRYPECKLQ
TLVLWNCDIT	SDGCCDLTKL	LQEKSSLLCL	DLGLNHIGVK	GMKFLCEALR
KPLCNLRCLW	LWGCSIPPFS	CEDLCSALSC	NQSLVTLDLG	QNPLGSSGVK
MLFETLTCSS	GTLRTLRLKI	DDFNDELNKL	LEEIEEKNPQ	LIIDTEKHHP
WAERPSSHDF	MI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Bertin J., DiStefano P.S. (2000). The PYRIN domain: a novel motif found in apoptosis and inflammation proteins. Cell Death Differ. 7: 1273—1274. PMID 11270363 DOI:10.1038/sj.cdd.4400774
Martinon F., Hofmann K., Tschopp J. (2001). The pyrin domain: a possible member of the death domain-fold family implicated in apoptosis and inflammation. Curr. Biol. 11: R118—R120. PMID 11250163 DOI:10.1016/S0960-9822(01)00056-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22948 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NX02 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.