NLRP3

NLRP3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3QF2, 2NAQ

Ідентифікатори
Символи NLRP3, AGTAVPRL, AII, AVP, C1orf7, CIAS1, CLR1.1, FCAS, FCAS1, FCU, MWS, NALP3, PYPAF1, NLR family, pyrin domain containing 3, NLR family pyrin domain containing 3, DFNA34, KEFH
Зовнішні ІД OMIM: 606416 MGI: 2653833 HomoloGene: 3600 GeneCards: NLRP3
Пов'язані генетичні захворювання
Muckle-Wells syndrome, CINCA syndrome, autosomal dominant nonsyndromic deafness 34, familial cold autoinflammatory syndrome 4[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
nucleotide binding
transcription factor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
peptidoglycan binding
ATP binding
identical protein binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
extracellular region
ендоплазматичний ретикулум
inflammasome complex
клітинне ядро
NLRP3 inflammasome complex
Golgi membrane
комплекс Ґольджі
мембрана

Біологічний процес

defense response
detection of biotic stimulus
NLRP3 inflammasome complex assembly
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of acute inflammatory response
positive regulation of interleukin-5 production
interleukin-18 production
процес імунної системи
positive regulation of interleukin-4 production
transcription, DNA-templated
positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
positive regulation of interleukin-13 production
positive regulation of T-helper 17 cell differentiation
defense response to virus
protein complex oligomerization
positive regulation of T-helper 2 cell differentiation
regulation of inflammatory response
interleukin-1 beta production
positive regulation of type 2 immune response
inflammatory response
negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
negative regulation of inflammatory response
cellular response to lipopolysaccharide
positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0097285 апоптоз
вроджений імунітет
protein deubiquitination
GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium
positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
cellular response to peptidoglycan
negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
114548
216799
Ensembl
ENSG00000162711
ENSMUSG00000032691
UniProt
Q96P20
Q8R4B8
RefSeq (мРНК)
NM_001079821
NM_001127461
NM_001127462
NM_001243133
NM_004895
NM_183395
NM_145827
NM_001359638
RefSeq (білок)
NP_001073289
NP_001120933
NP_001120934
NP_001230062
NP_004886
NP_899632
NP_665826
NP_001346567
Локус (UCSC) Хр. 1: 247.42 – 247.45 Mb Хр. 11: 59.43 – 59.46 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NLRP3 (англ. NLR family pyrin domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 036 амінокислот, а молекулярна маса — 118 173[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKAD
HVDLATLMIDFNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNAR
VSNPTVICQEDSIEEEWMGLLEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQC
IEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQQEREQELLAIGKTKTCESPV
SPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMMLDWASGTLYQ
DRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITT
RPVALEKLQHLLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQ
ENEVLFTMCFIPLVCWIVCTGLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSL
LQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQKILFEESDLRNHGLQKADVS
AFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEKEGRTNVPGSR
LKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYF
PKIEINLSTRMDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRH
LDMVQCVLPSSSHAACSHGLVNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSD
NSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLSHECCFDISLVLSSNQKL
VELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVSCCLTSACCQDLASV
LSTSHSLTRLYVGENALGDSGVAILCEKAKNPQCNLQKLGLVNSGLTSVC
CSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDN
CNLTSHCCWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLL
QNLGLSEMYFNYETKSALETLQEEKPELTVVFEPSW

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

  • Hoffman H.M., Mueller J.L., Broide D.H., Wanderer A.A., Kolodner R.D. (2001). Mutation of a new gene encoding a putative pyrin-like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle-Wells syndrome. Nat. Genet. 29: 301—305. PMID 11687797 DOI:10.1038/ng756
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • O'Connor W. Jr., Harton J.A., Zhu X., Linhoff M.W., Ting J.-P. (2003). CIAS1/cryopyrin/PYPAF1/NALP3/CATERPILLER 1.1 is an inducible inflammatory mediator with NF-kappa B suppressive properties. J. Immunol. 171: 6329—6333. PMID 14662828 DOI:10.4049/jimmunol.171.12.6329
  • Haneklaus M., O'Neill L.A., Coll R.C. (2013). Modulatory mechanisms controlling the NLRP3 inflammasome in inflammation: recent developments. Curr. Opin. Immunol. 25: 40—45. PMID 23305783 DOI:10.1016/j.coi.2012.12.004
  • Lu A., Wu H. (2015). Structural mechanisms of inflammasome assembly. FEBS J. 282: 435—444. PMID 25354325 DOI:10.1111/febs.13133
  • Bae J.Y., Park H.H. (2011). Crystal structure of NALP3 protein pyrin domain (PYD) and its implications in inflammasome assembly. J. Biol. Chem. 286: 39528—39536. PMID 21880711 DOI:10.1074/jbc.M111.278812

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з NLRP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16400 (англ.) . Архів оригіналу за 22 червня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  5. UniProt, Q96P20 (англ.) . Архів оригіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.