NLRP9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NLRP9, CLR19.1, NALP9, NOD6, PAN12, NLR family, pyrin domain containing 9, NLR family pyrin domain containing 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609663 MGI: 2675377 HomoloGene: 18530 GeneCards: NLRP9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ATP binding • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • inflammasome complex |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of interleukin-18 production • defense response to virus • Піроптоз • процес імунної системи • inflammatory response • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 55.71 – 55.74 Mb | Хр. 7: 19.73 – 19.81 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NLRP9 (англ. NLR family pyrin domain containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 991 амінокислот, а молекулярна маса — 113 312[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAESFFSDFG | | LLWYLKELRK | | EEFWKFKELL | | KQPLEKFELK | | PIPWAELKKA |
SKEDVAKLLD | | KHYPGKQAWE | | VTLNLFLQIN | | RKDLWTKAQE | | EMRNKLNPYR |
KHMKETFQLI | | WEKETCLHVP | | EHFYKETMKN | | EYKELNDAYT | | AAARRHTVVL |
EGPDGIGKTT | | LLRKVMLDWA | | EGNLWKDRFT | | FVFFLNVCEM | | NGIAETSLLE |
LLSRDWPESS | | EKIEDIFSQP | | ERILFIMDGF | | EQLKFNLQLK | | ADLSDDWRQR |
QPMPIILSSL | | LQKKMLPESS | | LLIALGKLAM | | QKHYFMLRHP | | KLIKLLGFSE |
SEKKSYFSYF | | FGEKSKALKV | | FNFVRDNGPL | | FILCHNPFTC | | WLVCTCVKQR |
LERGEDLEIN | | SQNTTYLYAS | | FLTTVFKAGS | | QSFPPKVNRA | | RLKSLCALAA |
EGIWTYTFVF | | SHGDLRRNGL | | SESEGVMWVG | | MRLLQRRGDC | | FAFMHLCIQE |
FCAAMFYLLK | | RPKDDPNPAI | | GSITQLVRAS | | VVQPQTLLTQ | | VGIFMFGIST |
EEIVSMLETS | | FGFPLSKDLK | | QEITQCLESL | | SQCEADREAI | | AFQELFIGLF |
ETQEKEFVTK | | VMNFFEEVFI | | YIGNIEHLVI | | ASFCLKHCQH | | LTTLRMCVEN |
IFPDDSGCIS | | DYNEKLVYWR | | ELCSMFITNK | | NFQILDMENT | | SLDDPSLAIL |
CKALAQPVCK | | LRKLIFTSVY | | FGHDSELFKA | | VLHNPHLKLL | | SLYGTSLSQS |
DIRHLCETLK | | HPMCKIEELI | | LGKCDISSEV | | CEDIASVLAC | | NSKLKHLSLV |
ENPLRDEGMT | | LLCEALKHSH | | CALERLMLMY | | CCLTSVSCDS | | ISEVLLCSKS |
LSLLDLGSNA | | LEDNGVASLC | | AALKHPGCSI | | RELWLMGCFL | | TSDSCKDIAA |
VLICNGKLKT | | LKLGHNEIGD | | TGVRQLCAAL | | QHPHCKLECL | | GLQTCPITRA |
CCDDIAAALI | | ACKTLRSLNL | | DWIALDADAV | | VVLCEALSHP | | DCALQMLGLH |
KSGFDEETQK | | ILMSVEEKIP | | HLTISHGPWI | | DEEYKIRGVL | | L |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Inohara N., Nunez G. (2003). NODs: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis. Nat. Rev. Immunol. 3: 371—382. PMID 12766759 DOI:10.1038/nri1086
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22941 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7RTR0 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |