NR2C2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3P0U

Ідентифікатори

Символи

NR2C2, TAK1, TR4, Testicular receptor 4, nuclear receptor subfamily 2 group C member 2

Зовнішні ІД

OMIM: 601426 MGI: 1352466 HomoloGene: 2475 GeneCards: NR2C2

Реагує на сполуку

Ретинол, третиноїн^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7182


22026

Ensembl


ENSG00000177463


ENSMUSG00000005893

UniProt


P49116


P49117

RefSeq (мРНК)


NM_001291694 NM_003298


NM_011630 NM_001347342

RefSeq (білок)


NP_001278623 NP_003289


NP_001334271 NP_035760

Локус (UCSC)

Хр. 3: 14.95 – 15.05 Mb

Хр. 6: 92.07 – 92.15 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NR2C2 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 596 амінокислот, а молекулярна маса — 65 414^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSPSPRIQI	ISTDSAVASP	QRIQIVTDQQ	TGQKIQIVTA	VDASGSPKQQ
FILTSPDGAG	TGKVILASPE	TSSAKQLIFT	TSDNLVPGRI	QIVTDSASVE
RLLGKTDVQR	PQVVEYCVVC	GDKASGRHYG	AVSCEGCKGF	FKRSVRKNLT
YSCRSNQDCI	INKHHRNRCQ	FCRLKKCLEM	GMKMESVQSE	RKPFDVQREK
PSNCAASTEK	IYIRKDLRSP	LIATPTFVAD	KDGARQTGLL	DPGMLVNIQQ
PLIREDGTVL	LATDSKAETS	QGALGTLANV	VTSLANLSES	LNNGDTSEIQ
PEDQSASEIT	RAFDTLAKAL	NTTDSSSSPS	LADGIDTSGG	GSIHVISRDQ
STPIIEVEGP	LLSDTHVTFK	LTMPSPMPEY	LNVHYICESA	SRLLFLSMHW
ARSIPAFQAL	GQDCNTSLVR	ACWNELFTLG	LAQCAQVMSL	STILAAIVNH
LQNSIQEDKL	SGDRIKQVME	HIWKLQEFCN	SMAKLDIDGY	EYAYLKAIVL
FSPDHPGLTS	TSQIEKFQEK	AQMELQDYVQ	KTYSEDTYRL	ARILVRLPAL
RLMSSNITEE	LFFTGLIGNV	SIDSIIPYIL	KMETAEYNGQ	ITGASL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, сперматогенез, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
Hirose T., Apfel R., Pfahl M., Jetten A.M. (1995). The orphan receptor TAK1 acts as a repressor of RAR-, RXR- and T3R-mediated signaling pathways. Biochem. Biophys. Res. Commun. 211: 83—91. PMID 7779113 DOI:10.1006/bbrc.1995.1781
Lee Y.F., Young W.J., Lin W.J., Shyr C.R., Chang C. (1999). Differential regulation of direct repeat 3 vitamin D3 and direct repeat 4 thyroid hormone signaling pathways by the human TR4 orphan receptor. J. Biol. Chem. 274: 16198—16205. PMID 10347174 DOI:10.1074/jbc.274.23.16198
Zhang Y., Dufau M.L. (2000). Nuclear orphan receptors regulate transcription of the gene for the human luteinizing hormone receptor. J. Biol. Chem. 275: 2763—2770. PMID 10644740 DOI:10.1074/jbc.275.4.2763
Nakajima T., Fujino S., Nakanishi G., Kim Y.S., Jetten A.M. (2004). TIP27: a novel repressor of the nuclear orphan receptor TAK1/TR4. Nucleic Acids Res. 32: 4194—4204. PMID 15302918 DOI:10.1093/nar/gkh741

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7972 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P49116 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.