NSD3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DAQ, 4GND, 4GNE, 4GNF, 4GNG, 4RXJ, 4YZ8, 2ND1, 2NCZ

Ідентифікатори

Символи

NSD3, pp14328, WHSC1L1, WHISTLE, Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1-like 1, nuclear receptor binding SET domain protein 3, KMT3G, KMT3F

Зовнішні ІД

OMIM: 607083 MGI: 2142581 HomoloGene: 56960 GeneCards: NSD3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • histone-lysine N-methyltransferase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone methyltransferase activity (H3-K36 specific)
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • Хроматин
Біологічний процес	• histone methylation • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone lysine methylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of histone H3-K36 trimethylation • histone H3-K36 methylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54904


234135

Ensembl


ENSG00000147548


ENSMUSG00000054823

UniProt


Q9BZ95


Q6P2L6

RefSeq (мРНК)


NM_017778 NM_023034


NM_001001735 NM_001081269 NM_001308481 NM_001308482

RefSeq (білок)


NP_060248 NP_075447


NP_001001735 NP_001074738 NP_001295410 NP_001295411

Локус (UCSC)

Хр. 8: 38.27 – 38.38 Mb

Хр. 8: 26.09 – 26.21 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NSD3 (англ. Nuclear receptor binding SET domain protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 437 амінокислот, а молекулярна маса — 161 613^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFSFSFMQG	IMGNTIQQPP	QLIDSANIRQ	EDAFDNNSDI	AEDGGQTPYE
ATLQQGFQYP	ATTEDLPPLT	NGYPSSISVY	ETQTKYQSYN	QYPNGSANGF
GAVRNFSPTD	YYHSEIPNTR	PHEILEKPSP	PQPPPPPSVP	QTVIPKKTGS
PEIKLKITKT	IQNGRELFES	SLCGDLLNEV	QASEHTKSKH	ESRKEKRKKS
NKHDSSRSEE	RKSHKIPKLE	PEEQNRPNER	VDTVSEKPRE	EPVLKEEAPV
QPILSSVPTT	EVSTGVKFQV	GDLVWSKVGT	YPWWPCMVSS	DPQLEVHTKI
NTRGAREYHV	QFFSNQPERA	WVHEKRVREY	KGHKQYEELL	AEATKQASNH
SEKQKIRKPR	PQRERAQWDI	GIAHAEKALK	MTREERIEQY	TFIYIDKQPE
EALSQAKKSV	ASKTEVKKTR	RPRSVLNTQP	EQTNAGEVAS	SLSSTEIRRH
SQRRHTSAEE	EEPPPVKIAW	KTAAARKSLP	ASITMHKGSL	DLQKCNMSPV
VKIEQVFALQ	NATGDGKFID	QFVYSTKGIG	NKTEISVRGQ	DRLIISTPNQ
RNEKPTQSVS	SPEATSGSTG	SVEKKQQRRS	IRTRSESEKS	TEVVPKKKIK
KEQVETVPQA	TVKTGLQKGA	SEISDSCKPL	KKRSRASTDV	EMTSSAYRDT
SDSDSRGLSD	LQVGFGKQVD	SPSATADADV	SDVQSMDSSL	SRRGTGMSKK
DTVCQICESS	GDSLIPCEGE	CCKHFHLECL	GLASLPDSKF	ICMECKTGQH
PCFSCKVSGK	DVKRCSVGAC	GKFYHEACVR	KFPTAIFESK	GFRCPQHCCS
ACSMEKDIHK	ASKGRMMRCL	RCPVAYHSGD	ACIAAGSMLV	SSYILICSNH
SKRSSNSSAV	NVGFCFVCAR	GLIVQDHSDP	MFSSYAYKSH	YLLNESNRAE
LMKLPMIPSS	SASKKKCEKG	GRLLCCESCP	ASFHPECLSI	EMPEGCWNCN
DCKAGKKLHY	KQIVWVKLGN	YRWWPAEICN	PRSVPLNIQG	LKHDLGDFPV
FFFGSHDYYW	VHQGRVFPYV	EGDKSFAEGQ	TSINKTFKKA	LEEAAKRFQE
LKAQRESKEA	LEIEKNSRKP	PPYKHIKANK	VIGKVQIQVA	DLSEIPRCNC
KPADENPCGL	ESECLNRMLQ	YECHPQVCPA	GDRCQNQCFT	KRLYPDAEII
KTERRGWGLR	TKRSIKKGEF	VNEYVGELID	EEECRLRIKR	AHENSVTNFY
MLTVTKDRII	DAGPKGNYSR	FMNHSCNPNC	ETQKWTVNGD	VRVGLFALCD
IPAGMELTFN	YNLDCLGNGR	TECHCGADNC	SGFLGVRPKS	ACASTNEEKA
KNAKLKQKRR	KIKTEPKQMH	EDYCFQCGDG	GELVMCDKKD	CPKAYHLLCL
NLTQPPYGKW	ECPWHQCDEC	SSAAVSFCEF	CPHSFCKDHE	KGALVPSALE
GRLCCSEHDP	MAPVSPEYWS	KIKCKWESQD	HGEEVKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Stec I., van Ommen G.-J.B., den Dunnen J.T. (2001). WHSC1L1, on human chromosome 8p11.2, closely resembles WHSC1 and maps to a duplicated region shared with 4p16.3. Genomics. 76: 5—8. PMID 11549311 DOI:10.1006/geno.2001.6581
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12767 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BZ95 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.