NWD1

Ідентифікатори

Символи

NWD1, NACHT and WD repeat domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 616250 MGI: 2442268 HomoloGene: 72261 GeneCards: NWD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATP binding • nucleotide binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • U5 snRNP • precatalytic spliceosome • catalytic step 2 spliceosome
Біологічний процес	• Сплайсинг РНК • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


284434


319555

Ensembl


ENSG00000188039


ENSMUSG00000048148

UniProt


Q149M9


A6H603

RefSeq (мРНК)


NM_001007525 NM_001290355 NM_001347994


NM_001159403 NM_176940

RefSeq (білок)


NP_001007526 NP_001277284 NP_001334923


NP_795914

Локус (UCSC)

Хр. 19: 16.72 – 16.82 Mb

Хр. 8: 72.65 – 72.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NWD1 (англ. NACHT and WD repeat domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 564 амінокислот, а молекулярна маса — 174 552^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRGKPCRAL	PTLKCQTFCQ	RHGLMFEVVD	LRWGIRNIEA	TDHLTTELCL
EEVDRCWKTS	IGPAFVALIG	DQYGPCLIPS	RIDEKEWEVL	RDHLTARPSD
LELVARYFQR	DENAFPPTYV	LQAPGTGEAC	EPEEATLTSV	LRSGAQEARR
LGLITQEQWQ	HYHRSVIEWE	IERSLLSSED	REQGATVFLR	EIQDLHKHIL
EDCALRMVDR	LADGCLDADA	QNLLSSLKSH	ITDMHPGVLK	THRLPWSRDL
VNPKNKTHAC	YLKELGEQFV	VRANHQVLTR	LRELDTAGQE	LAWLYQEIRH
HLWQSSEVIQ	TFCGRQELLA	RLGQQLRHDD	SKQHTPLVLF	GPPGIGKTAL
MCKLAEQMPR	LLGHKTVTVL	RLLGTSQMSS	DARGLLKSIC	FQVCLAYGLP
LPPAQVLDAH	TRVVQFFHTL	LHTVSCRNFE	SLVLLLDAMD	DLDSVRHARR
VPWLPLNCPP	RVHLILSACS	GALGVLDTLQ	RVLLDPEAYW	EVKPLSGNQG
QQMIQLLLAA	ARRTLSPVHT	DLLWASLPEC	GNPGRLRLAF	EEARKWASFT
VPVPLATTAE	EATHQLCTRL	EQTHGQLLVA	HVLGYIVSSR	HGLSEAELKD
VLSLDDEVLQ	DVYRDWTPPS	KELLRFPPLL	WVRLRRDLGY	YLARRPVDGF
TLLAIAHRQL	VEVVRERYLS	GSERAKRHGV	LADFFSGTWS	QGTKKLITLP
LVGKPLNLDR	KVAPQPLWFS	HTVANLRKLK	ELPYHLLHSG	RLEELKQEVL
GSMSWISCRG	ISGGIEDLLD	DFDLCAPHLD	SPEVGLVREA	LQLCRPAVEL
RGMERSLLYT	ELLARLHFFA	TSHPALVGQL	CQQAQSWFQL	CAHPVLVPLG
GFLQPPGGPL	RATLSGCHKG	ITAMAWGVEE	KLLVIGTQDG	IMAVWDMEEQ
HVIHMLTGHT	GEVRCVKIFA	KGTLANSASK	DYTLHLWNLL	SGQEKFTIWD
GGSKNPAEPQ	IWNLHVDEAH	KVVYSASGSK	INAWNLETAE	PVFHILGDAS
DPWMCMAVLA	SQATLLTVSR	DGVVSLWSSA	TGKLQGKQHM	SSIKEETPTC
AVSVQKQGKL	VTGFSNGSIS	LVSSKGDRLL	EKLPDAVRFL	VVSEDESLLA
AGFGRSVRIF	LADSRGFRRF	MAMDLEHEDM	VETAVFGTEN	NLIITGSLDA
LIQVWSLSEQ	GTLLDILEGV	GAPVSLLARG	GALVASASPQ	SSSFKVWDLS
DAHRSRVPAP	FLDRTGLTAV	SHNGSYVYFP	KIGDKNKVTI	WDLAEGEEQD
SLDTSSEIRC	LEVAEQRKLL	FTGLVSGVVL	VFPLNSRQDV	ICIPPPEARK
AINCMSLSKC	EDRLAIAYDN	IVLVLDITSG	DPCPVIDGPR	YTFYTQLPET
LSSVAILTDY	RVVYSMTNGD	LFLYECATSK	AFPLETHRSR	VACVEVSHKE
QLVVSGSEDA	LLCLWDLQAR	KWKFEMSYTS	SYCRGVQCAC	FSKDDKYVYV
GLKDRSILVW	SVLDGTLLTV	QFVHAVVNRI	IPTTSGFIAP	TRHGYLIREN
FQCLSAKASP	QDPLKNFKKA	MWMVKSRQRE	ELVAAAGAPQ	DLESESAQGN
ETKSNKCSQV	CLIV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Correa R.G., Krajewska M., Ware C.F., Gerlic M., Reed J.C. (2014). The NLR-related protein NWD1 is associated with prostate cancer and modulates androgen receptor signaling. Oncotarget. 5: 1666—1682. PMID 24681825

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:27619 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q149M9 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.