OLR1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YPO, 1YPQ, 1YPU, 1YXJ, 1YXK, 3VLG

Ідентифікатори

Символи

OLR1, CLEC8A, LOX1, LOXIN, SCARE1, SLOX1, oxidized low density lipoprotein receptor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602601 MGI: 1261434 HomoloGene: 1910 GeneCards: OLR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • нуклеоплазма • extracellular region • membrane raft • specific granule membrane • tertiary granule membrane
Біологічний процес	• процес імунної системи • кровообіг • протеоліз • адгезія клітин • inflammatory response • leukocyte migration • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4973


108078

Ensembl


ENSG00000173391


ENSMUSG00000030162

UniProt


P78380


Q9EQ09

RefSeq (мРНК)


NM_001172632 NM_001172633 NM_002543


NM_001301094 NM_001301096 NM_138648

RefSeq (білок)


NP_001166103 NP_001166104 NP_002534


NP_001288023 NP_001288025 NP_619589

Локус (UCSC)

Хр. 12: 10.16 – 10.17 Mb

Хр. 6: 129.46 – 129.48 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OLR1 (англ. Oxidized low density lipoprotein receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 959^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTFDDLKIQT	VKDQPDEKSN	GKKAKGLQFL	YSPWWCLAAA	TLGVLCLGLV
VTIMVLGMQL	SQVSDLLTQE	QANLTHQKKK	LEGQISARQQ	AEEASQESEN
ELKEMIETLA	RKLNEKSKEQ	MELHHQNLNL	QETLKRVANC	SAPCPQDWIW
HGENCYLFSS	GSFNWEKSQE	KCLSLDAKLL	KINSTADLDF	IQQAISYSSF
PFWMGLSRRN	PSYPWLWEDG	SPLMPHLFRV	RGAVSQTYPS	GTCAYIQRGA
VYAENCILAA	FSICQKKANL	RAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Yamanaka S., Zhang X.-Y., Miura K., Kim S., Iwao H. (1998). The human gene encoding the lectin-type oxidized LDL receptor (OLR1) is a novel member of the natural killer gene complex with a unique expression profile. Genomics. 54: 191—199. PMID 9828121 DOI:10.1006/geno.1998.5561
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hayashida K., Kume N., Minami M., Kita T. (2002). Lectin-like oxidized LDL receptor-1 (LOX-1) supports adhesion of mononuclear leukocytes and a monocyte-like cell line THP-1 cells under static and flow conditions. FEBS Lett. 511: 133—138. PMID 11821063 DOI:10.1016/S0014-5793(01)03297-5
Luedecking-Zimmer E., DeKosky S.T., Chen Q., Barmada M.M., Kamboh M.I. (2002). Investigation of oxidized LDL-receptor 1 (OLR1) as the candidate gene for Alzheimer's disease on chromosome 12. Hum. Genet. 111: 443—451. PMID 12384789 DOI:10.1007/s00439-002-0802-7
Hu B., Li D., Sawamura T., Mehta J.L. (2003). Oxidized LDL through LOX-1 modulates LDL-receptor expression in human coronary artery endothelial cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 307: 1008—1012. PMID 12878212 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01295-6
Pritchard A., St Clair D., Lemmon H., Mann D.M.A., Lendon C. (2004). No association between polymorphisms in the lectin-like oxidised low density lipoprotein receptor (ORL1) gene on chromosome 12 and Alzheimer's disease in a UK cohort. Neurosci. Lett. 366: 126—129. PMID 15276231 DOI:10.1016/j.neulet.2004.05.023

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8133 (англ.) . Архів оригіналу за 29 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P78380 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.