PADI1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PADI1

Ідентифікатори

Символи

PADI1, HPAD10, PAD1, PDI, PDI1, peptidyl arginine deiminase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607934 MGI: 1338893 HomoloGene: 7881 GeneCards: PADI1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • hydrolase activity • protein-arginine deiminase activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29943


18599

Ensembl


ENSG00000142623 ENSG00000281459


ENSMUSG00000025329

UniProt


Q9ULC6


Q9Z185

RefSeq (мРНК)


NM_013358


NM_011059

RefSeq (білок)


NP_037490


NP_035189

Локус (UCSC)

Хр. 1: 17.21 – 17.25 Mb

Хр. 4: 140.54 – 140.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PADI1 (англ. Peptidyl arginine deiminase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 74 666^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPKRVVQLS	LKMPTHAVCV	VGVEAHVDIH	SDVPKGANSF	RVSGSSGVEV
FMVYNRTRVK	EPIGKARWPL	DTDADMVVSV	GTASKELKDF	KVRVSYFGEQ
EDQALGRSVL	YLTGVDISLE	VDTGRTGKVK	RSQGDKKTWR	WGPEGYGAIL
LVNCDRDNHR	SAEPDLTHSW	LMSLADLQDM	SPMLLSCNGP	DKLFDSHKLV
LNVPFSDSKR	VRVFCARGGN	SLSDYKQVLG	PQCLSYEVER	QPGEQEIKFY
VEGLTFPDAD	FLGLVSLSVS	LVDPGTLPEV	TLFTDTVGFR	MAPWIMTPNT
QPPEELYVCR	VMDTHGSNEK	FLEDMSYLTL	KANCKLTICP	QVENRNDRWI
QDEMEFGYIE	APHKSFPVVF	DSPRNRGLKD	FPYKRILGPD	FGYVTREIPL
PGPSSLDSFG	NLDVSPPVTV	GGTEYPLGRI	LIGSSFPKSG	GRQMARAVRN
FLKAQQVQAP	VELYSDWLSV	GHVDEFLTFV	PTSDQKGFRL	LLASPSACLK
LFQEKKEEGY	GEAAQFDGLK	HQAKRSINEM	LADRHLQRDN	LHAQKCIDWN
RNVLKRELGL	AESDIVDIPQ	LFFLKNFYAE	AFFPDMVNMV	VLGKYLGIPK
PYGPIINGRC	CLEEKVQSLL	EPLGLHCIFI	DDYLSYHELQ	GEIHCGTNVR
RKPFPFKWWN	MVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18367 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9ULC6 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.