PASK |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5c/Protein_PASK_PDB_1ll8.png/250px-Protein_PASK_PDB_1ll8.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1LL8, 3DLS | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PASK, PASKIN, STK37, PAS domain containing serine/threonine kinase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607505 MGI: 2155936 HomoloGene: 9038 GeneCards: PASK |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • kinase activity • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • phosphatidylinositol binding • lipid binding • protein serine/threonine kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of respiratory gaseous exchange • protein autophosphorylation • negative regulation of glycogen biosynthetic process • positive regulation of translation • regulation of glucagon secretion • фосфорилювання • protein phosphorylation • energy homeostasis • GO:0007243 intracellular signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/51/PBB_GE_PASK_213534_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PASK_213534_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9c/PBB_GE_PASK_216945_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_PASK_216945_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001252119 NM_001252120 NM_001252122 NM_001252124 NM_015148 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001239048 NP_001239049 NP_001239051 NP_001239053 NP_055963 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 241.11 – 241.15 Mb | Хр. 1: 93.24 – 93.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PASK (англ. PAS domain containing serine/threonine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 323 амінокислот, а молекулярна маса — 142 929[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEDGGLTAFE | | EDQRCLSQSL | | PLPVSAEGPA | | AQTTAEPSRS | | FSSAHRHLSR |
RNGLSRLCQS | | RTALSEDRWS | | SYCLSSLAAQ | | NICTSKLHCP | | AAPEHTDPSE |
PRGSVSCCSL | | LRGLSSGWSS | | PLLPAPVCNP | | NKAIFTVDAK | | TTEILVANDK |
ACGLLGYSSQ | | DLIGQKLTQF | | FLRSDSDVVE | | ALSEEHMEAD | | GHAAVVFGTV |
VDIISRSGEK | | IPVSVWMKRM | | RQERRLCCVV | | VLEPVERVST | | WVAFQSDGTV |
TSCDSLFAHL | | HGYVSGEDVA | | GQHITDLIPS | | VQLPPSGQHI | | PKNLKIQRSV |
GRARDGTTFP | | LSLKLKSQPS | | SEEATTGEAA | | PVSGYRASVW | | VFCTISGLIT |
LLPDGTIHGI | | NHSFALTLFG | | YGKTELLGKN | | ITFLIPGFYS | | YMDLAYNSSL |
QLPDLASCLD | | VGNESGCGER | | TLDPWQGQDP | | AEGGQDPRIN | | VVLAGGHVVP |
RDEIRKLMES | | QDIFTGTQTE | | LIAGGQLLSC | | LSPQPAPGVD | | NVPEGSLPVH |
GEQALPKDQQ | | ITALGREEPV | | AIESPGQDLL | | GESRSEPVDV | | KPFASCEDSE |
APVPAEDGGS | | DAGMCGLCQK | | AQLERMGVSG | | PSGSDLWAGA | | AVAKPQAKGQ |
LAGGSLLMHC | | PCYGSEWGLW | | WRSQDLAPSP | | SGMAGLSFGT | | PTLDEPWLGV |
ENDREELQTC | | LIKEQLSQLS | | LAGALDVPHA | | ELVPTECQAV | | TAPVSSCDLG |
GRDLCGGCTG | | SSSACYALAT | | DLPGGLEAVE | | AQEVDVNSFS | | WNLKELFFSD |
QTDQTSSNCS | | CATSELRETP | | SSLAVGSDPD | | VGSLQEQGSC | | VLDDRELLLL |
TGTCVDLGQG | | RRFRESCVGH | | DPTEPLEVCL | | VSSEHYAASD | | RESPGHVPST |
LDAGPEDTCP | | SAEEPRLNVQ | | VTSTPVIVMR | | GAAGLQREIQ | | EGAYSGSCYH |
RDGLRLSIQF | | EVRRVELQGP | | TPLFCCWLVK | | DLLHSQRDSA | | ARTRLFLASL |
PGSTHSTAAE | | LTGPSLVEVL | | RARPWFEEPP | | KAVELEGLAA | | CEGEYSQKYS |
TMSPLGSGAF | | GFVWTAVDKE | | KNKEVVVKFI | | KKEKVLEDCW | | IEDPKLGKVT |
LEIAILSRVE | | HANIIKVLDI | | FENQGFFQLV | | MEKHGSGLDL | | FAFIDRHPRL |
DEPLASYIFR | | QLVSAVGYLR | | LKDIIHRDIK | | DENIVIAEDF | | TIKLIDFGSA |
AYLERGKLFY | | TFCGTIEYCA | | PEVLMGNPYR | | GPELEMWSLG | | VTLYTLVFEE |
NPFCELEETV | | EAAIHPPYLV | | SKELMSLVSG | | LLQPVPERRT | | TLEKLVTDPW |
VTQPVNLADY | | TWEEVFRVNK | | PESGVLSAAS | | LEMGNRSLSD | | VAQAQELCGG |
PVPGEAPNGQ | | GCLHPGDPRL | | LTS |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Rutter J., Michnoff C.H., Harper S.M., Gardner K.H., McKnight S.L. (2001). PAS kinase: an evolutionarily conserved PAS domain-regulated serine/threonine kinase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 8991—8996. PMID 11459942 DOI:10.1073/pnas.161284798
- Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Schlafli P., Borter E., Spielmann P., Wenger R.H. (2009). The PAS-domain kinase PASKIN: a new sensor in energy homeostasis. Cell. Mol. Life Sci. 66: 876—883. PMID 19189049 DOI:10.1007/s00018-009-8699-0
- Amezcua C.A., Harper S.M., Rutter J., Gardner K.H. (2002). Structure and interactions of PAS kinase N-terminal PAS domain: model for intramolecular kinase regulation. Structure. 10: 1349—1361. PMID 12377121 DOI:10.1016/S0969-2126(02)00857-2
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17270 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96RG2 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |