PCGF6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCGF6, MBLR, RNF134, polycomb group ring finger 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607816 MGI: 1918291 HomoloGene: 12378 GeneCards: PCGF6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • PcG protein complex • нуклеоплазма • PRC1 complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone H2A-K119 monoubiquitination • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • inactivation of X chromosome by genetic imprinting |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 103.3 – 103.35 Mb | Хр. 19: 47.02 – 47.04 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCGF6 (англ. Polycomb group ring finger 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 39 047[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEGVAVVTAG | | SVGAAKTEGA | | AALPPPPPVS | | PPALTPAPAA | | GEEGPAPLSE |
TGAPGCSGSR | | PPELEPERSL | | GRFRGRFEDE | | DEELEEEEEL | | EEEEEEEEED |
MSHFSLRLEG | | GRQDSEDEEE | | RLINLSELTP | | YILCSICKGY | | LIDATTITEC |
LHTFCKSCIV | | RHFYYSNRCP | | KCNIVVHQTQ | | PLYNIRLDRQ | | LQDIVYKLVI |
NLEEREKKQM | | HDFYKERGLE | | VPKPAVPQPV | | PSSKGRSKKV | | LESVFRIPPE |
LDMSLLLEFI | | GANEGTGHFK | | PLEKKFVRVS | | GEATIGHVEK | | FLRRKMGLDP |
ACQVDIICGD | | HLLEQYQTLR | | EIRRAIGDAA | | MQDGLLVLHY | | GLVVSPLKIT |
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lee M.G., Norman J., Shilatifard A., Shiekhattar R. (2007). Physical and functional association of a trimethyl H3K4 demethylase and Ring6a/MBLR, a polycomb-like protein. Cell. 128: 877—887. PMID 17320162 DOI:10.1016/j.cell.2007.02.004
- Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21156 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BYE7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |