PDLIM1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1X62, 2PKT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDLIM1, CLIM1, CLP-36, CLP36, HEL-S-112, hCLIM1, PDZ and LIM domain 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605900 MGI: 1860611 HomoloGene: 9643 GeneCards: PDLIM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • cadherin binding involved in cell-cell adhesion • actin binding • muscle alpha-actinin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • цитоскелет • focal adhesion • transcription regulator complex • Z discdkac • stress fiber • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0001306 response to oxidative stress • cell-cell adhesion • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 95.24 – 95.29 Mb | Хр. 19: 40.21 – 40.26 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDLIM1 (англ. PDZ and LIM domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 329 амінокислот, а молекулярна маса — 36 072[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTTQQIDLQG | | PGPWGFRLVG | | GKDFEQPLAI | | SRVTPGSKAA | | LANLCIGDVI |
TAIDGENTSN | | MTHLEAQNRI | | KGCTDNLTLT | | VARSEHKVWS | | PLVTEEGKRH |
PYKMNLASEP | | QEVLHIGSAH | | NRSAMPFTAS | | PASSTTARVI | | TNQYNNPAGL |
YSSENISNFN | | NALESKTAAS | | GVEANSRPLD | | HAQPPSSLVI | | DKESEVYKML |
QEKQELNEPP | | KQSTSFLVLQ | | EILESEEKGD | | PNKPSGFRSV | | KAPVTKVAAS |
IGNAQKLPMC | | DKCGTGIVGV | | FVKLRDRHRH | | PECYVCTDCG | | TNLKQKGHFF |
VEDQIYCEKH | | ARERVTPPEG | | YEVVTVFPK |
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vallenius T., Luukko K., Makela T.P. (2000). CLP-36 PDZ-LIM protein associates with nonmuscle alpha-actinin-1 and alpha-actinin-4. J. Biol. Chem. 275: 11100—11105. PMID 10753915 DOI:10.1074/jbc.275.15.11100
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2067 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O00151 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |