PES1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EP8

Ідентифікатори

Символи

PES1, PES, pescadillo ribosomal biogenesis factor 1, NOP7

Зовнішні ІД

OMIM: 605819 MGI: 1890613 HomoloGene: 5984 GeneCards: PES1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • ribonucleoprotein complex binding
Клітинна компонента	• мембрана • PeBoW complex • хромосома • ядерце • condensed chromosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • preribosome, large subunit precursor
Біологічний процес	• protein localization to organelle • ribosome biogenesis • regulation of cell cycle • GO:0007576 nucleolus organization • maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • проліферація • rRNA processing • maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosomal large subunit biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23481


64934

Ensembl


ENSG00000100029


ENSMUSG00000020430

UniProt


O00541


Q9EQ61

RefSeq (мРНК)


NM_001243225 NM_001282327 NM_001282328 NM_014303


NM_022889

RefSeq (білок)


NP_001230154 NP_001269256 NP_001269257 NP_055118


NP_075027

Локус (UCSC)

Хр. 22: 30.58 – 30.61 Mb

Хр. 11: 3.91 – 3.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PES1 (англ. Pescadillo ribosomal biogenesis factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 588 амінокислот, а молекулярна маса — 68 003^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGLEKKKYE	RGSATNYITR	NKARKKLQLS	LADFRRLCIL	KGIYPHEPKH
KKKVNKGSTA	ARTFYLIKDI	RFLLHEPIVN	KFREYKVFVR	KLRKAYGKSE
WNTVERLKDN	KPNYKLDHII	KERYPTFIDA	LRDLDDALSM	CFLFSTFPRT
GKCHVQTIQL	CRRLTVEFMH	YIIAARALRK	VFLSIKGIYY	QAEVLGQPIV
WITPYAFSHD	HPTDVDYRVM	ATFTEFYTTL	LGFVNFRLYQ	LLNLHYPPKL
EGQAQAEAKA	GEGTYALDSE	SCMEKLAALS	ASLARVVVPA	TEEEAEVDEF
PTDGEMSAQE	EDRRKELEAQ	EKHKKLFEGL	KFFLNREVPR	EALAFIIRSF
GGEVSWDKSL	CIGATYDVTD	SRITHQIVDR	PGQQTSVIGR	CYVQPQWVFD
SVNARLLLPV	AEYFSGVQLP	PHLSPFVTEK	EGDYVPPEKL	KLLALQRGED
PGNLNESEEE	EEEDDNNEGD	GDEEGENEEE	EEDAEAGSEK	EEEARLAALE
EQRMEGKKPR	VMAGTLKLED	KQRLAQEEES	EAKRLAIMMM	KKREKYLYQK
IMFGKRRKIR	EANKLAEKRK	AHDEAVRSEK	KAKKARPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Oeffinger M., Leung A., Lamond A., Tollervey D. (2002). Yeast Pescadillo is required for multiple activities during 60S ribosomal subunit synthesis. RNA. 8: 626—636. PMID 12022229 DOI:10.1017/S1355838202020022
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Oeffinger M., Leung A., Lamond A., Tollervey D. (2002). RNA. 8: 851—851. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8848 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00541 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.