POLD1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | POLD1, CDC2, CRCS10, MDPL, POLD, polymerase (DNA) delta 1, catalytic subunit, DNA polymerase delta 1, catalytic subunit |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 174761 MGI: 97741 HomoloGene: 2014 GeneCards: POLD1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння, MDP syndrome, Polymerase proofreading-related adenomatous polyposis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • DNA binding • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • nucleotidyltransferase activity • iron-sulfur cluster binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5' exonuclease activity • 3'-5'-exodeoxyribonuclease activity • nucleic acid binding • DNA-directed DNA polymerase activity • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • нуклеоплазма • aggresome • nucleotide-excision repair complex • клітинне ядро • delta DNA polymerase complex • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA synthesis involved in DNA repair • cellular response to UV • реплікація ДНК • fatty acid homeostasis • DNA mismatch repair • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • telomere maintenance • response to UV • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • DNA ligation • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • base-excision repair, gap-filling • DNA replication proofreading • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA-dependent DNA replication |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001256849 NM_001308632 NM_002691 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001243778 NP_001295561 NP_002682 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 50.38 – 50.42 Mb | Хр. 7: 44.18 – 44.2 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
POLD1 (англ. DNA polymerase delta 1, catalytic subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 107 амінокислот, а молекулярна маса — 123 631[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDGKRRPGPG | | PGVPPKRARG | | GLWDDDDAPR | | PSQFEEDLAL | | MEEMEAEHRL |
QEQEEEELQS | | VLEGVADGQV | | PPSAIDPRWL | | RPTPPALDPQ | | TEPLIFQQLE |
IDHYVGPAQP | | VPGGPPPSRG | | SVPVLRAFGV | | TDEGFSVCCH | | IHGFAPYFYT |
PAPPGFGPEH | | MGDLQRELNL | | AISRDSRGGR | | ELTGPAVLAV | | ELCSRESMFG |
YHGHGPSPFL | | RITVALPRLV | | APARRLLEQG | | IRVAGLGTPS | | FAPYEANVDF |
EIRFMVDTDI | | VGCNWLELPA | | GKYALRLKEK | | ATQCQLEADV | | LWSDVVSHPP |
EGPWQRIAPL | | RVLSFDIECA | | GRKGIFPEPE | | RDPVIQICSL | | GLRWGEPEPF |
LRLALTLRPC | | APILGAKVQS | | YEKEEDLLQA | | WSTFIRIMDP | | DVITGYNIQN |
FDLPYLISRA | | QTLKVQTFPF | | LGRVAGLCSN | | IRDSSFQSKQ | | TGRRDTKVVS |
MVGRVQMDML | | QVLLREYKLR | | SYTLNAVSFH | | FLGEQKEDVQ | | HSIITDLQNG |
NDQTRRRLAV | | YCLKDAYLPL | | RLLERLMVLV | | NAVEMARVTG | | VPLSYLLSRG |
QQVKVVSQLL | | RQAMHEGLLM | | PVVKSEGGED | | YTGATVIEPL | | KGYYDVPIAT |
LDFSSLYPSI | | MMAHNLCYTT | | LLRPGTAQKL | | GLTEDQFIRT | | PTGDEFVKTS |
VRKGLLPQIL | | ENLLSARKRA | | KAELAKETDP | | LRRQVLDGRQ | | LALKVSANSV |
YGFTGAQVGK | | LPCLEISQSV | | TGFGRQMIEK | | TKQLVESKYT | | VENGYSTSAK |
VVYGDTDSVM | | CRFGVSSVAE | | AMALGREAAD | | WVSGHFPSPI | | RLEFEKVYFP |
YLLISKKRYA | | GLLFSSRPDA | | HDRMDCKGLE | | AVRRDNCPLV | | ANLVTASLRR |
LLIDRDPEGA | | VAHAQDVISD | | LLCNRIDISQ | | LVITKELTRA | | ASDYAGKQAH |
VELAERMRKR | | DPGSAPSLGD | | RVPYVIISAA | | KGVAAYMKSE | | DPLFVLEHSL |
PIDTQYYLEQ | | QLAKPLLRIF | | EPILGEGRAE | | AVLLRGDHTR | | CKTVLTGKVG |
GLLAFAKRRN | | CCIGCRTVLS | | HQGAVCEFCQ | | PRESELYQKE | | VSHLNALEER |
FSRLWTQCQR | | CQGSLHEDVI | | CTSRDCPIFY | | MRKKVRKDLE | | DQEQLLRRFG |
PPGPEAW |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Liu L., Rodriguez-Belmonte E.M., Mazloum N., Xie B., Lee M.Y.W.T. (2003). Identification of a novel protein, PDIP38, that interacts with the p50 subunit of DNA polymerase delta and proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 278: 10041—10047. PMID 12522211 DOI:10.1074/jbc.M208694200
- Tsurimoto T., Shinozaki A., Yano M., Seki M., Enomoto T. (2005). Human Werner helicase interacting protein 1 (WRNIP1) functions as a novel modulator for DNA polymerase delta. Genes Cells. 10: 13—22. PMID 15670210 DOI:10.1111/j.1365-2443.2004.00812.x
- Meng X., Zhou Y., Lee E.Y., Lee M.Y., Frick D.N. (2010). The p12 subunit of human polymerase delta modulates the rate and fidelity of DNA synthesis. Biochemistry. 49: 3545—3554. PMID 20334433 DOI:10.1021/bi100042b
- Terai K., Shibata E., Abbas T., Dutta A. (2013). Degradation of p12 subunit by CRL4Cdt2 E3 ligase inhibits fork progression after DNA damage. J. Biol. Chem. 288: 30509—30514. PMID 24022480 DOI:10.1074/jbc.C113.505586
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9175 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P28340 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |