PPP1R8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3V4Y

Ідентифікатори

Символи

PPP1R8, ARD-1, ARD1, NIPP-1, NIPP1, PRO2047, protein phosphatase 1 regulatory subunit 8

Зовнішні ІД

OMIM: 602636 MGI: 2140494 HomoloGene: 8555 GeneCards: PPP1R8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein serine/threonine phosphatase inhibitor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein phosphatase inhibitor activity • nuclease activity • endonuclease activity • ribonuclease E activity • hydrolase activity • mRNA binding • protein phosphatase regulator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • mRNA processing • Деградація РНК • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • проліферація • RNA phosphodiester bond hydrolysis • negative regulation of protein dephosphorylation • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity • regulation of phosphoprotein phosphatase activity • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5511


100336

Ensembl


ENSG00000117751


ENSMUSG00000028882

UniProt


Q12972


Q8R3G1

RefSeq (мРНК)


NM_138558 NM_002713 NM_014110


NM_001290725 NM_146154 NM_001355198 NM_001355199

RefSeq (білок)


NP_002704 NP_054829 NP_612568


NP_001277654 NP_666266 NP_001342127 NP_001342128

Локус (UCSC)

Хр. 1: 27.83 – 27.85 Mb

Хр. 4: 132.55 – 132.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPP1R8 (англ. Protein phosphatase 1 regulatory subunit 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 479^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAANSGSS	LPLFDCPTWA	GKPPPGLHLD	VVKGDKLIEK	LIIDEKKYYL
FGRNPDLCDF	TIDHQSCSRV	HAALVYHKHL	KRVFLIDLNS	THGTFLGHIR
LEPHKPQQIP	IDSTVSFGAS	TRAYTLREKP	QTLPSAVKGD	EKMGGEDDEL
KGLLGLPEEE	TELDNLTEFN	TAHNKRISTL	TIEEGNLDIQ	RPKRKRKNSR
VTFSEDDEII	NPEDVDPSVG	RFRNMVQTAV	VPVKKKRVEG	PGSLGLEESG
SRRMQNFAFS	GGLYGGLPPT	HSEAGSQPHG	IHGTALIGGL	PMPYPNLAPD
VDLTPVVPSA	VNMNPAPNPA	VYNPEAVNEP	KKKKYAKEAW	PGKKPTPSLL
I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wang M., Cohen S.N. (1994). ard-1: a human gene that reverses the effects of temperature-sensitive and deletion mutations in the Escherichia coli rne gene and encodes an activity producing RNase E-like cleavages. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 10591—10595. PMID 7524097 DOI:10.1073/pnas.91.22.10591
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Claverie-Martin F., Wang M., Cohen S.N. (1997). ARD-1 cDNA from human cells encodes a site-specific single-strand endoribonuclease that functionally resembles Escherichia coli RNase E. J. Biol. Chem. 272: 13823—13828. PMID 9153239 DOI:10.1074/jbc.272.21.13823
Beullens M., Bollen M. (2002). The protein phosphatase-1 regulator NIPP1 is also a splicing factor involved in a late step of spliceosome assembly. J. Biol. Chem. 277: 19855—19860. PMID 11909864 DOI:10.1074/jbc.M200847200
Boudrez A., Beullens M., Waelkens E., Stalmans W., Bollen M. (2002). Phosphorylation-dependent interaction between the splicing factors SAP155 and NIPP1. J. Biol. Chem. 277: 31834—31841. PMID 12105215 DOI:10.1074/jbc.M204427200
Lee J.H., You J., Dobrota E., Skalnik D.G. (2010). Identification and characterization of a novel human PP1 phosphatase complex. J. Biol. Chem. 285: 24466—24476. PMID 20516061 DOI:10.1074/jbc.M110.109801

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9296 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12972 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.