PPRC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PPRC1, PRC, peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1, PPARG related coactivator 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617462 MGI: 2385096 HomoloGene: 9006 GeneCards: PPRC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nuclear receptor coactivator activity • nucleic acid binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • RNA binding • transcription factor binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • mitochondrion organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001288727 NM_001288728 NM_015062 |
| | NM_001081214 NM_145504 NM_001346801 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001275656 NP_001275657 NP_055877 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 102.13 – 102.15 Mb | Хр. 19: 46.03 – 46.06 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PPRC1 (англ. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 664 амінокислот, а молекулярна маса — 177 544[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAARRGRRDG | | VAPPPSGGPG | | PDPGGGARGS | | GWGSRSQAPY | | GTLGAVSGGE |
QVLLHEEAGD | | SGFVSLSRLG | | PSLRDKDLEM | | EELMLQDETL | | LGTMQSYMDA |
SLISLIEDFG | | SLGESRLSLE | | DQNEVSLLTA | | LTEILDNADS | | ENLSPFDSIP |
DSELLVSPRE | | GSSLHKLLTL | | SRTPPERDLI | | TPVDPLGPST | | GSSRGSGVEM |
SLPDPSWDFS | | PPSFLETSSP | | KLPSWRPPRS | | RPRWGQSPPP | | QQRSDGEEEE |
EVASFSGQIL | | AGELDNCVSS | | IPDFPMHLAC | | PEEEDKATAA | | EMAVPAAGDE |
SISSLSELVR | | AMHPYCLPNL | | THLASLEDEL | | QEQPDDLTLP | | EGCVVLEIVG |
QAATAGDDLE | | IPVVVRQVSP | | GPRPVLLDDS | | LETSSALQLL | | MPTLESETEA |
AVPKVTLCSE | | KEGLSLNSEE | | KLDSACLLKP | | REVVEPVVPK | | EPQNPPANAA |
PGSQRARKGR | | KKKSKEQPAA | | CVEGYARRLR | | SSSRGQSTVG | | TEVTSQVDNL |
QKQPQEELQK | | ESGPLQGKGK | | PRAWARAWAA | | ALENSSPKNL | | ERSAGQSSPA |
KEGPLDLYPK | | LADTIQTNPI | | PTHLSLVDSA | | QASPMPVDSV | | EADPTAVGPV |
LAGPVPVDPG | | LVDLASTSSE | | LVEPLPAEPV | | LINPVLADSA | | AVDPAVVPIS |
DNLPPVDAVP | | SGPAPVDLAL | | VDPVPNDLTP | | VDPVLVKSRP | | TDPRRGAVSS |
ALGGSAPQLL | | VESESLDPPK | | TIIPEVKEVV | | DSLKIESGTS | | ATTHEARPRP |
LSLSEYRRRR | | QQRQAETEER | | SPQPPTGKWP | | SLPETPTGLA | | DIPCLVIPPA |
PAKKTALQRS | | PETPLEICLV | | PVGPSPASPS | | PEPPVSKPVA | | SSPTEQVPSQ |
EMPLLARPSP | | PVQSVSPAVP | | TPPSMSAALP | | FPAGGLGMPP | | SLPPPPLQPP |
SLPLSMGPVL | | PDPFTHYAPL | | PSWPCYPHVS | | PSGYPCLPPP | | PTVPLVSGTP |
GAYAVPPTCS | | VPWAPPPAPV | | SPYSSTCTYG | | PLGWGPGPQH | | APFWSTVPPP |
PLPPASIGRA | | VPQPKMESRG | | TPAGPPENVL | | PLSMAPPLSL | | GLPGHGAPQT |
EPTKVEVKPV | | PASPHPKHKV | | SALVQSPQMK | | ALACVSAEGV | | TVEEPASERL |
KPETQETRPR | | EKPPLPATKA | | VPTPRQSTVP | | KLPAVHPARL | | RKLSFLPTPR |
TQGSEDVVQA | | FISEIGIEAS | | DLSSLLEQFE | | KSEAKKECPP | | PAPADSLAVG |
NSGGVDIPQE | | KRPLDRLQAP | | ELANVAGLTP | | PATPPHQLWK | | PLAAVSLLAK |
AKSPKSTAQE | | GTLKPEGVTE | | AKHPAAVRLQ | | EGVHGPSRVH | | VGSGDHDYCV |
RSRTPPKKMP | | ALVIPEVGSR | | WNVKRHQDIT | | IKPVLSLGPA | | APPPPCIAAS |
REPLDHRTSS | | EQADPSAPCL | | APSSLLSPEA | | SPCRNDMNTR | | TPPEPSAKQR |
SMRCYRKACR | | SASPSSQGWQ | | GRRGRNSRSV | | SSGSNRTSEA | | SSSSSSSSSS |
SRSRSRSLSP | | PHKRWRRSSC | | SSSGRSRRCS | | SSSSSSSSSS | | SSSSSSSSSR |
SRSRSPSPRR | | RSDRRRRYSS | | YRSHDHYQRQ | | RVLQKERAIE | | ERRVVFIGKI |
PGRMTRSELK | | QRFSVFGEIE | | ECTIHFRVQG | | DNYGFVTYRY | | AEEAFAAIES |
GHKLRQADEQ | | PFDLCFGGRR | | QFCKRSYSDL | | DSNREDFDPA | | PVKSKFDSLD |
FDTLLKQAQK | | NLRR |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Andersson U., Scarpulla R.C. (2001). Pgc-1-related coactivator, a novel, serum-inducible coactivator of nuclear respiratory factor 1-dependent transcription in mammalian cells. Mol. Cell. Biol. 21: 3738—3749. PMID 11340167 DOI:10.1128/MCB.21.11.3738-3749.2001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vercauteren K., Pasko R.A., Gleyzer N., Marino V.M., Scarpulla R.C. (2006). PGC-1-related coactivator: immediate early expression and characterization of a CREB/NRF-1 binding domain associated with cytochrome c promoter occupancy and respiratory growth. Mol. Cell. Biol. 26: 7409—7419. PMID 16908542 DOI:10.1128/MCB.00585-06
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30025 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q5VV67 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |