PSMB6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4R3O, 4R67, 5A0Q

Ідентифікатори

Символи

PSMB6, DELTA, LMPY, proteasome subunit beta 6, Y, proteasome 20S subunit beta 6

Зовнішні ІД

OMIM: 600307 MGI: 104880 HomoloGene: 2092 GeneCards: PSMB6

Реагує на сполуку

Карфілзоміб, ixazomib, Oprozomib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • threonine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • proteasome core complex • цитоплазма • гіалоплазма • proteasome core complex, beta-subunit complex
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • протеоліз • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0022415 viral process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • proteasomal protein catabolic process • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5694


19175

Ensembl


ENSG00000142507


ENSMUSG00000018286

UniProt


P28072


Q60692

RefSeq (мРНК)


NM_002798 NM_001270481


NM_008946

RefSeq (білок)


NP_001257410 NP_002789


NP_032972

Локус (UCSC)

Хр. 17: 4.8 – 4.8 Mb

Хр. 11: 70.42 – 70.42 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMB6 (англ. Proteasome subunit beta 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 239 амінокислот, а молекулярна маса — 25 358^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATLLAARG	AGPAPAWGPE	AFTPDWESRE	VSTGTTIMAV	QFDGGVVLGA
DSRTTTGSYI	ANRVTDKLTP	IHDRIFCCRS	GSAADTQAVA	DAVTYQLGFH
SIELNEPPLV	HTAASLFKEM	CYRYREDLMA	GIIIAGWDPQ	EGGQVYSVPM
GGMMVRQSFA	IGGSGSSYIY	GYVDATYREG	MTKEECLQFT	ANALALAMER
DGSSGGVIRL	AAIAESGVER	QVLLGDQIPK	FAVATLPPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176
da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core. Nat. Commun. 6: 7573—7573. PMID 26133119 DOI:10.1038/ncomms8573
Harshbarger W., Miller C., Diedrich C., Sacchettini J. (2015). Crystal structure of the human 20S proteasome in complex with carfilzomib. Structure. 23: 418—424. PMID 25599644 DOI:10.1016/j.str.2014.11.017
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Proteasome 20S subunit beta 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9543 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P28072 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.