PSMD1

Ідентифікатори

Символи

PSMD1, P112, Rpn2, S1, proteasome 26S subunit, non-ATPase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 617842 MGI: 1917497 HomoloGene: 2100 GeneCards: PSMD1

Реагує на сполуку

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0010576 enzyme regulator activity • endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мембрана • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • extracellular region • azurophil granule lumen • клітинне ядро • proteasome regulatory particle, base subcomplex • proteasome storage granule • proteasome accessory complex
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • GO:0048552 regulation of catalytic activity • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5707


70247

Ensembl


ENSG00000173692


ENSMUSG00000026229

UniProt


Q99460


Q3TXS7

RefSeq (мРНК)


NM_001191037 NM_002807


NM_027357

RefSeq (білок)


NP_001177966 NP_002798


NP_081633

Локус (UCSC)

Хр. 2: 231.06 – 231.17 Mb

Хр. 1: 85.99 – 86.07 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMD1 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 953 амінокислот, а молекулярна маса — 105 836^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MITSAAGIIS	LLDEDEPQLK	EFALHKLNAV	VNDFWAEISE	SVDKIEVLYE
DEGFRSRQFA	ALVASKVFYH	LGAFEESLNY	ALGAGDLFNV	NDNSEYVETI
IAKCIDHYTK	QCVENADLPE	GEKKPIDQRL	EGIVNKMFQR	CLDDHKYKQA
IGIALETRRL	DVFEKTILES	NDVPGMLAYS	LKLCMSLMQN	KQFRNKVLRV
LVKIYMNLEK	PDFINVCQCL	IFLDDPQAVS	DILEKLVKED	NLLMAYQICF
DLYESASQQF	LSSVIQNLRT	VGTPIASVPG	STNTGTVPGS	EKDSDSMETE
EKTSSAFVGK	TPEASPEPKD	QTLKMIKILS	GEMAIELHLQ	FLIRNNNTDL
MILKNTKDAV	RNSVCHTATV	IANSFMHCGT	TSDQFLRDNL	EWLARATNWA
KFTATASLGV	IHKGHEKEAL	QLMATYLPKD	TSPGSAYQEG	GGLYALGLIH
ANHGGDIIDY	LLNQLKNASN	DIVRHGGSLG	LGLAAMGTAR	QDVYDLLKTN
LYQDDAVTGE	AAGLALGLVM	LGSKNAQAIE	DMVGYAQETQ	HEKILRGLAV
GIALVMYGRM	EEADALIESL	CRDKDPILRR	SGMYTVAMAY	CGSGNNKAIR
RLLHVAVSDV	NDDVRRAAVE	SLGFILFRTP	EQCPSVVSLL	SESYNPHVRY
GAAMALGICC	AGTGNKEAIN	LLEPMTNDPV	NYVRQGALIA	SALIMIQQTE
ITCPKVNQFR	QLYSKVINDK	HDDVMAKFGA	ILAQGILDAG	GHNVTISLQS
RTGHTHMPSV	VGVLVFTQFW	FWFPLSHFLS	LAYTPTCVIG	LNKDLKMPKV
QYKSNCKPST	FAYPAPLEVP	KEKEKEKVST	AVLSITAKAK	KKEKEKEKKE
EEKMEVDEAE	KKEEKEKKKE	PEPNFQLLDN	PARVMPAQLK	VLTMPETCRY
QPFKPLSIGG	IIILKDTSED	IEELVEPVAA	HGPKIEEEEQ	EPEPPEPFEY
IDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Proteasome 26S subunit, non-ATPase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9554 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99460 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.