RAB11FIP5

Ідентифікатори

Символи

RAB11FIP5, GAF1, RIP11, pp75, RAB11 family interacting protein 5, rab11-FIP5, gaf-1

Зовнішні ІД

OMIM: 605536 MGI: 1098586 HomoloGene: 9158 GeneCards: RAB11FIP5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • gamma-tubulin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • мітохондріальна мембрана • Golgi membrane • transport vesicle membrane • центр організації мікротрубочок • мітохондріальна зовнішня мембрана • recycling endosome membrane • мітохондрія • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • early endosome • secretory granule • recycling endosome
Біологічний процес	• regulation of protein localization to cell surface • cellular response to acidic pH • protein transport • negative regulation of adiponectin secretion • insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • regulated exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26056


52055

Ensembl


ENSG00000135631


ENSMUSG00000051343

UniProt


Q9BXF6


Q8R361

RefSeq (мРНК)


NM_015470 NM_001371272


NM_001003955 NM_177466

RefSeq (білок)


NP_056285 NP_001358201


NP_001003955 NP_803417

Локус (UCSC)

Хр. 2: 73.07 – 73.16 Mb

Хр. 6: 85.31 – 85.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB11FIP5 (англ. RAB11 family interacting protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 653 амінокислот, а молекулярна маса — 70 415^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALVRGAEPA	AGPSRWLPTH	VQVTVLRARG	LRGKSSGAGS	TSDAYTVIQV
GREKYSTSVV	EKTHGCPEWR	EECSFELPPG	ALDGLLRAQE	ADAGPAPWAA
SSAAACELVL	TTMHRSLIGV	DKFLGQATVA	LDEVFGAGRA	QHTQWYKLHS
KPGKKEKERG	EIEVTIQFTR	NNLSASMFDL	SMKDKPRSPF	SKIRDKMKGK
KKYDLESASA	ILPSSAIEDP	DLGSLGKMGK	AKGFFLRNKL	RKSSLTQSNT
SLGSDSTLSS	ASGSLAYQGP	GAELLTRSPS	RSSWLSTEGG	RDSAQSPKLF
THKRTYSDEA	NQMRVAPPRA	LLDLQGHLDA	ASRSSLCVNG	SHIYNEEPQG
PVRHRSSISG	SLPSSGSLQA	VSSRFSEEGP	RSTDDTWPRG	SRSNSSSEAV
LGQEELSAQA	KVLAPGASHP	GEEEGARLPE	GKPVQVATPI	VASSEAVAEK
EGARKEERKP	RMGLFHHHHQ	GLSRSELGRR	SSLGEKGGPI	LGASPHHSSS
GEEKAKSSWF	GLREAKDPTQ	KPSPHPVKPL	SAAPVEGSPD	RKQSRSSLSI
ALSSGLEKLK	TVTSGSIQPV	TQAPQAGQMV	DTKRLKDSAV	LDQSAKYYHL
THDELISLLL	QRERELSQRD	EHVQELESYI	DRLLVRIMET	SPTLLQIPPG
PPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Prekeris R., Klumperman J., Scheller R.H. (2000). A Rab11/Rip11 protein complex regulates apical membrane trafficking via recycling endosomes. Mol. Cell. 6: 1437—1448. PMID 11163216 DOI:10.1016/S1097-2765(00)00140-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang D., Buyon J.P., Zhu W., Chan E.K.L. (1999). Defining a novel 75-kDa phosphoprotein associated with SS-A/Ro and identification of distinct human autoantibodies. J. Clin. Invest. 104: 1265—1275. PMID 10545525 DOI:10.1172/JCI8003
Chen D., Xu W., He P., Medrano E.E., Whiteheart S.W. (2001). Gaf-1, a gamma-SNAP-binding protein associated with the mitochondria. J. Biol. Chem. 276: 13127—13135. PMID 11278501 DOI:10.1074/jbc.M009424200
Wallace D.M., Lindsay A.J., Hendrick A.G., McCaffrey M.W. (2002). Rab11-FIP4 interacts with Rab11 in a GTP-dependent manner and its overexpression condenses the Rab11 positive compartment in HeLa cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299: 770—779. PMID 12470645 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02720-1
Oehlke O., Martin H.W., Osterberg N., Roussa E. (2011). Rab11b and its effector Rip11 regulate the acidosis-induced traffic of V-ATPase in salivary ducts. J. Cell. Physiol. 226: 638—651. PMID 20717956 DOI:10.1002/jcp.22388

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24845 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BXF6 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.