RAB4A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YU9, 1Z0K, 2BMD, 2BME

Ідентифікатори

Символи

RAB4A, HRES-1, HRES-1/RAB4, HRES1, RAB4, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 179511 MGI: 105069 HomoloGene: 101538 GeneCards: RAB4A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GDP binding • ATPase binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • ATPase activator activity • syntaxin binding • ionotropic glutamate receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • recycling endosome • везикула • гіалоплазма • ендосома • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • insulin-responsive compartment • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • postsynaptic recycling endosome • early endosome membrane • recycling endosome membrane • anchored component of synaptic vesicle membrane
Біологічний процес	• regulation of endocytosis • antigen processing and presentation • positive regulation of ATP-dependent activity • Rab protein signal transduction • protein transport • phosphatidylinositol biosynthetic process • intracellular protein transport • small GTPase mediated signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5867


19341

Ensembl


ENSG00000168118


ENSMUSG00000019478

UniProt


P20338


P56371

RefSeq (мРНК)


NM_001271998 NM_004578


NM_009003

RefSeq (білок)


NP_001258927 NP_004569 NP_004569.2


NP_033029

Локус (UCSC)

Хр. 1: 229.27 – 229.31 Mb

Хр. 8: 124.53 – 124.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB4A (англ. RAB4A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 218 амінокислот, а молекулярна маса — 24 390^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQTAMSETY	DFLFKFLVIG	NAGTGKSCLL	HQFIEKKFKD	DSNHTIGVEF
GSKIINVGGK	YVKLQIWDTA	GQERFRSVTR	SYYRGAAGAL	LVYDITSRET
YNALTNWLTD	ARMLASQNIV	IILCGNKKDL	DADREVTFLE	ASRFAQENEL
MFLETSALTG	ENVEEAFVQC	ARKILNKIES	GELDPERMGS	GIQYGDAALR
QLRSPRRAQA	PNAQECGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
de Renzis S., Soennichsen B., Zerial M. (2002). Divalent Rab effectors regulate the sub-compartmental organization and sorting of early endosomes. Nat. Cell Biol. 4: 124—133. PMID 11788822 DOI:10.1038/ncb744
Lindsay A.J., McCaffrey M.W. (2004). Characterisation of the Rab binding properties of Rab coupling protein (RCP) by site-directed mutagenesis. FEBS Lett. 571: 86—92. PMID 15280022 DOI:10.1016/j.febslet.2004.06.068
Huber S.K., Scheidig A.J. (2005). High resolution crystal structures of human Rab4a in its active and inactive conformations. FEBS Lett. 579: 2821—2829. PMID 15907487 DOI:10.1016/j.febslet.2005.04.020
Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798
Zahraoui A., Touchot N., Chardin P., Tavitian A. (1989). The human Rab genes encode a family of GTP-binding proteins related to yeast YPT1 and SEC4 products involved in secretion. J. Biol. Chem. 264: 12394—12401. PMID 2501306

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9781 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P20338 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.