RALGAPA1

Ідентифікатори

Символи

RALGAPA1, GARNL1, GRIPE, RalGAPalpha1, TULIP1, p240, Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1, Ral GTPase activating protein catalytic subunit alpha 1, NEDHRIT

Зовнішні ІД

OMIM: 608884 MGI: 1931050 HomoloGene: 84805 GeneCards: RALGAPA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • protein heterodimerization activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


253959


56784

Ensembl


ENSG00000174373


ENSMUSG00000021027

UniProt


Q6GYQ0


Q6GYP7

RefSeq (мРНК)

NM_001283043 NM_001283044 NM_014990 NM_194301 NM_001330075
NM_001346243 NM_001346245 NM_001346246 NM_001346247 NM_001346248 NM_001346249


NM_001003719 NM_001112714 NM_001286263 NM_019994 NM_001368814

RefSeq (білок)

NP_001269972 NP_001269973 NP_001317004 NP_001333172 NP_001333174
NP_001333175 NP_001333176 NP_001333177 NP_001333178 NP_055805 NP_919277


NP_001003719 NP_001106185 NP_001273192 NP_064378 NP_001355743

Локус (UCSC)

Хр. 14: 35.54 – 35.81 Mb

Хр. 12: 55.6 – 55.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RALGAPA1 (англ. Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 036 амінокислот, а молекулярна маса — 229 832^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSKKPHGDV	KKSTQKVLDT	KKDALTRLKH	LRIVIENAES	IDLKQFFDQH
FSHIYYVFFE	NFVTIEASLK	QKGHKSQREE	LDAILFIFEK	ILQLLPERIH
QRWQFHSIGL	ILKKLLHTGN	SLKIRREGVR	LFLLWLQALQ	NNCSKEQLWM
FSCLIPGFSA	PQSEHGPRTL	DNLINPPLNL	QETQVTIEEI	TPLVPPQSGD
KGQEDLTSYF	LEALLKYIVI	QVKSLEWKNK	ENQERGFSFL	FSHFKKYYLP
YIFPNICKEN	SLYHPILDIP	QMRPKPHYVV	IKKDAETNEA	IYCTKEPFIK
ARVIVIRWLV	SFWLEPKPHT	GPHIPGMEGE	VLPKNIQRAA	ASLVSREESK
NDNADKTDRT	TEPEQSHSNT	STLTEREPSS	SSLCSIDEEH	LTDIEIVRRV
FSSKRSNVNF	VTEIFRQAFL	LPICEAAAMR	KVVKVYQEWI	QQEEKPLFMQ
EPEEIVITSS	DLPCIENVTD	HDISMEEGEK	REEENGTNTA	DHVRNSSWAK
NGSYQGALHN	ASEEATEQNI	RAGTQAVLQV	FIINSSNIFL	LEPANEIKNL
LDEHTDMCKR	ILNIYRYMVV	QVSMDKKTWE	QMLLVLLRVT	ESVLKMPSQA
FLQFQGKKNM	TLAGRLAGPL	FQTLIVAWIK	ANLNVYISRE	LWDDLLSVLS
SLTYWEELAT	EWSLTMETLT	KVLARNLYSL	DLSDLPLDKL	SEQKQKKHKG
KGVGHEFQKV	SVDKSFSRGW	SRDQPGQAPM	RQRSATTTGS	PGTEKARSIV
RQKTVDIDDA	QILPRSTRVR	HFSQSEETGN	EVFGALNEEQ	PLPRSSSTSD
ILEPFTVERA	KVNKEDMSQK	LPPLNSDIGG	SSANVPDLMD	EFIAERLRSG
NASTMTRRGS	SPGSLEIPKD	LPDILNKQNQ	MRPIDDPGVP	SEWTSPASAG
SSDLISSDSH	SDSFSAFQYD	GRKFDNFGFG	TDTGVTSSAD	VDSGSGHHQS
AEEQEVASLT	TLHIDSETSS	LNQQAFSAEV	ATITGSESAS	PVHSPLGSRS
QTPSPSTLNI	DHMEQKDLQL	DEKLHHSVLQ	TPDDLEISEF	PSECCSVMAG
GTLTGWHADV	ATVMWRRMLG	ILGDVNSIMD	PEIHAQVFDY	LCELWQNLAK
IRDNLGISTD	NLTSPSPPVL	IPPLRILTPW	LFKATMLTDK	YKQGKLHAYK
LICNTMKRRQ	DVSPNRDFLT	HFYNIMHCGL	LHIDQDIVNT	IIKHCSPQFF
SLGLPGATML	IMDFIVAAGR	VASSAFLNAP	RVEAQVLLGS	LVCFPNLYCE
LPSLHPNIPD	VAVSQFTDVK	ELIIKTVLSS	ARDEPSGPAR	CVALCSLGIW
ICEELVHESH	HPQIKEALNV	ICVSLKFTNK	TVAHVACNML	HMLVHYVPRL
QIYQPDSPLK	IIQILIATIT	HLLPSTEASS	YEMDKRLVVS	LLLCLLDWIM
ALPLKTLLQP	FHATGAESDK	TEKSVLNCIY	KVLHGCVYGA	QCFSNPRYFP
MSLSDLASVD	YDPFMHLESL	KEPEPLHSPD	SERSSKLQPV	TEVKTQMQHG
LISIAARTVI	THLVNHLGHY	PMSGGPAMLT	SQVCENHDNH	YSESTELSPE
LFESPNIQFF	VLNNTTLVSC	IQIRSEENMP	GGGLSAGLAS	ANSNVRIIVR
DLSGKYSWDS	AILYGPPPVS	GLSEPTSFML	SLSHQEKPEE	PPTSNECLED
ITVKDGLSLQ	FKRFRETVPT	WDTIRDEEDV	LDELLQYLGV	TSPECLQRTG
ISLNIPAPQP	VCISEKQEND	VINAILKQHT	EEKEFVEKHF	NDLNMKAVEQ
DEPIPQKPQS	AFYYCRLLLS	ILGMNSWDKR	RSFHLLKKNE	KLLRELRNLD
SRQCRETHKI	AVFYVAEGQE	DKHSILTNTG	GSQAYEDFVA	GLGWEVNLTN
HCGFMGGLQK	NKSTGLTTPY	FATSTVEVIF	HVSTRMPSDS	DDSLTKKLRH
LGNDEVHIVW	SEHTRDYRRG	IIPTEFGDVL	IVIYPMKNHM	FSIQIMKKPE
VPFFGPLFDG	AIVNGKVLPI	MVRATAINAS	RALKSLIPLY	QNFYEERARY
LQTIVQHHLE	PTTFEDFAAQ	VFSPAPYHHL	PSDADH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17770 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6GYQ0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.