RANGAP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1Z5S, 2GRN, 2GRO, 2GRP, 2GRQ, 2GRR, 2IY0, 3UIN, 3UIO, 3UIP, 5D2M, 2IO2, 2IO3

Ідентифікатори

Символи

RANGAP1, Fug1, RANGAP, SD, Ran GTPase activating protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602362 MGI: 103071 HomoloGene: 55700 GeneCards: RANGAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • RNA binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex • ядерна пора • хромосома • дендрит (нейробіологія) • nuclear pore cytoplasmic filaments • mitotic spindle • центромера • цитоскелет • клітинне ядро • кінетохор • axon cytoplasm • цитоплазма • гіалоплазма • aggresome • perinuclear region of cytoplasm • nuclear envelope • нуклеоплазма • веретено поділу • ядерна мембрана
Біологічний процес	• відповідь клітин на вазопресин • protein sumoylation • cellular response to peptide hormone stimulus • negative regulation of protein export from nucleus • response to axon injury • GO:0072468 сигнальна трансдукція • sister chromatid cohesion • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5905


19387

Ensembl


ENSG00000100401


ENSMUSG00000022391

UniProt


P46060


P46061

RefSeq (мРНК)


NM_001278651 NM_002883 NM_001317930


NM_001146174 NM_011241 NM_001358622

RefSeq (білок)


NP_001265580 NP_001304859 NP_002874


NP_001139646 NP_035371 NP_001345551

Локус (UCSC)

Хр. 22: 41.24 – 41.29 Mb

Хр. 15: 81.59 – 81.63 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RANGAP1 (англ. Ran GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 587 амінокислот, а молекулярна маса — 63 542^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASEDIAKLA	ETLAKTQVAG	GQLSFKGKSL	KLNTAEDAKD	VIKEIEDFDS
LEALRLEGNT	VGVEAARVIA	KALEKKSELK	RCHWSDMFTG	RLRTEIPPAL
ISLGEGLITA	GAQLVELDLS	DNAFGPDGVQ	GFEALLKSSA	CFTLQELKLN
NCGMGIGGGK	ILAAALTECH	RKSSAQGKPL	ALKVFVAGRN	RLENDGATAL
AEAFRVIGTL	EEVHMPQNGI	NHPGITALAQ	AFAVNPLLRV	INLNDNTFTE
KGAVAMAETL	KTLRQVEVIN	FGDCLVRSKG	AVAIADAIRG	GLPKLKELNL
SFCEIKRDAA	LAVAEAMADK	AELEKLDLNG	NTLGEEGCEQ	LQEVLEGFNM
AKVLASLSDD	EDEEEEEEGE	EEEEEAEEEE	EEDEEEEEEE	EEEEEEEPQQ
RGQGEKSATP	SRKILDPNTG	EPAPVLSSPP	PADVSTFLAF	PSPEKLLRLG
PKSSVLIAQQ	TDTSDPEKVV	SAFLKVSSVF	KDEATVRMAV	QDAVDALMQK
AFNSSSFNSN	TFLTRLLVHM	GLLKSEDKVK	AIANLYGPLM	ALNHMVQQDY
FPKALAPLLL	AFVTKPNSAL	ESCSFARHSL	LQTLYKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

Bischoff F.R., Krebber H., Kempf T., Hermes I., Ponstingl H. (1995). Human RanGTPase-activating protein RanGAP1 is a homologue of yeast Rna1p involved in mRNA processing and transport. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 1749—1753. PMID 7878053 DOI:10.1073/pnas.92.5.1749
Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Krebber H., Ponstingl H. (1996). Ubiquitous expression and testis-specific alternative polyadenylation of mRNA for the human Ran GTPase activator RanGAP1. Gene. 180: 7—11. PMID 8973340 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00389-7
Joseph J., Tan S.-H., Karpova T.S., McNally J.G., Dasso M. (2002). SUMO-1 targets RanGAP1 to kinetochores and mitotic spindles. J. Cell Biol. 156: 595—602. PMID 11854305 DOI:10.1083/jcb.200110109
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9854 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P46060 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.