ROR1

Ідентифікатори

Символи

ROR1, NTRKR1, dJ537F10.1, receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1, receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602336 MGI: 1347520 HomoloGene: 3675 GeneCards: ROR1

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal recessive nonsyndromic deafness 108^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase activity • Wnt-protein binding • kinase activity • ATP binding • transferase activity • coreceptor activity involved in Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • Wnt-activated receptor activity • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity
Клітинна компонента	• receptor complex • integral component of plasma membrane • integral component of membrane • мембрана • stress fiber • цитоплазма • cell surface • клітинна мембрана • axon terminus • аксон • cell projection
Біологічний процес	• фосфорилювання • protein phosphorylation • Wnt signaling pathway • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • astrocyte development • слух • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • inner ear development • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:1903374 anatomical structure development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4919


26563

Ensembl


ENSG00000185483


ENSMUSG00000035305

UniProt


Q01973


Q9Z139

RefSeq (мРНК)


NM_001083592 NM_005012


NM_013845 NM_001312690

RefSeq (білок)


NP_001077061 NP_005003


NP_001299619 NP_038873

Локус (UCSC)

Хр. 1: 63.77 – 64.18 Mb

Хр. 4: 99.95 – 100.3 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ROR1 (англ. Receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 937 амінокислот, а молекулярна маса — 104 283^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHRPRRRGTR	PPLLALLAAL	LLAARGAAAQ	ETELSVSAEL	VPTSSWNISS
ELNKDSYLTL	DEPMNNITTS	LGQTAELHCK	VSGNPPPTIR	WFKNDAPVVQ
EPRRLSFRST	IYGSRLRIRN	LDTTDTGYFQ	CVATNGKEVV	SSTGVLFVKF
GPPPTASPGY	SDEYEEDGFC	QPYRGIACAR	FIGNRTVYME	SLHMQGEIEN
QITAAFTMIG	TSSHLSDKCS	QFAIPSLCHY	AFPYCDETSS	VPKPRDLCRD
ECEILENVLC	QTEYIFARSN	PMILMRLKLP	NCEDLPQPES	PEAANCIRIG
IPMADPINKN	HKCYNSTGVD	YRGTVSVTKS	GRQCQPWNSQ	YPHTHTFTAL
RFPELNGGHS	YCRNPGNQKE	APWCFTLDEN	FKSDLCDIPA	CDSKDSKEKN
KMEILYILVP	SVAIPLAIAL	LFFFICVCRN	NQKSSSAPVQ	RQPKHVRGQN
VEMSMLNAYK	PKSKAKELPL	SAVRFMEELG	ECAFGKIYKG	HLYLPGMDHA
QLVAIKTLKD	YNNPQQWTEF	QQEASLMAEL	HHPNIVCLLG	AVTQEQPVCM
LFEYINQGDL	HEFLIMRSPH	SDVGCSSDED	GTVKSSLDHG	DFLHIAIQIA
AGMEYLSSHF	FVHKDLAARN	ILIGEQLHVK	ISDLGLSREI	YSADYYRVQS
KSLLPIRWMP	PEAIMYGKFS	SDSDIWSFGV	VLWEIFSFGL	QPYYGFSNQE
VIEMVRKRQL	LPCSEDCPPR	MYSLMTECWN	EIPSRRPRFK	DIHVRLRSWE
GLSSHTSSTT	PSGGNATTQT	TSLSASPVSN	LSNPRYPNYM	FPSQGITPQG
QIAGFIGPPI	PQNQRFIPIN	GYPIPPGYAA	FPAAHYQPTG	PPRVIQHCPP
PKSRSPSSAS	GSTSTGHVTS	LPSSGSNQEA	NIPLLPHMSI	PNHPGGMGIT
VFGNKSQKPY	KIDSKQASLL	GDANIHGHTE	SMISAEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Masiakowski P., Carroll R.D. (1992). A novel family of cell surface receptors with tyrosine kinase-like domain. J. Biol. Chem. 267: 26181—26190. PMID 1334494
Reddy U.R., Phatak S., Pleasure D. (1996). Human neural tissues express a truncated Ror1 receptor tyrosine kinase, lacking both extracellular and transmembrane domains. Oncogene. 13: 1555—1559. PMID 8875995

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ROR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10256 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q01973 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.