ROS1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3ZBF, 4UXL | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ROS1, MCF3, ROS, c-ros-1, ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 165020 MGI: 97999 HomoloGene: 2207 GeneCards: ROS1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
entrectinib[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase activity • protein phosphatase binding • ATP binding • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • integral component of plasma membrane • receptor complex |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • regulation of TOR signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of phosphate transport • negative regulation of gene expression • protein phosphorylation • Сперматогенез • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • проліферація • columnar/cuboidal epithelial cell development • regulation of cell growth • negative regulation of signal transduction • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/26/PBB_GE_ROS1_207569_at_fs.png/250px-PBB_GE_ROS1_207569_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_002944 NM_001378891 NM_001378902 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_002935 NP_001365820 NP_001365831 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 117.29 – 117.43 Mb | Хр. 10: 51.92 – 52.07 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ROS1 (англ. ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 347 амінокислот, а молекулярна маса — 263 915[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKNIYCLIPK | | LVNFATLGCL | | WISVVQCTVL | | NSCLKSCVTN | | LGQQLDLGTP |
HNLSEPCIQG | | CHFWNSVDQK | | NCALKCRESC | | EVGCSSAEGA | | YEEEVLENAD |
LPTAPFASSI | | GSHNMTLRWK | | SANFSGVKYI | | IQWKYAQLLG | | SWTYTKTVSR |
PSYVVKPLHP | | FTEYIFRVVW | | IFTAQLQLYS | | PPSPSYRTHP | | HGVPETAPLI |
RNIESSSPDT | | VEVSWDPPQF | | PGGPILGYNL | | RLISKNQKLD | | AGTQRTSFQF |
YSTLPNTIYR | | FSIAAVNEVG | | EGPEAESSIT | | TSSSAVQQEE | | QWLFLSRKTS |
LRKRSLKHLV | | DEAHCLRLDA | | IYHNITGISV | | DVHQQIVYFS | | EGTLIWAKKA |
ANMSDVSDLR | | IFYRGSGLIS | | SISIDWLYQR | | MYFIMDELVC | | VCDLENCSNI |
EEITPPSISA | | PQKIVADSYN | | GYVFYLLRDG | | IYRADLPVPS | | GRCAEAVRIV |
ESCTLKDFAI | | KPQAKRIIYF | | NDTAQVFMST | | FLDGSASHLI | | LPRIPFADVK |
SFACENNDFL | | VTDGKVIFQQ | | DALSFNEFIV | | GCDLSHIEEF | | GFGNLVIFGS |
SSQLHPLPGR | | PQELSVLFGS | | HQALVQWKPP | | ALAIGANVIL | | ISDIIELFEL |
GPSAWQNWTY | | EVKVSTQDPP | | EVTHIFLNIS | | GTMLNVPELQ | | SAMKYKVSVR |
ASSPKRPGPW | | SEPSVGTTLV | | PASEPPFIMA | | VKEDGLWSKP | | LNSFGPGEFL |
SSDIGNVSDM | | DWYNNSLYYS | | DTKGDVFVWL | | LNGTDISENY | | HLPSIAGAGA |
LAFEWLGHFL | | YWAGKTYVIQ | | RQSVLTGHTD | | IVTHVKLLVN | | DMVVDSVGGY |
LYWTTLYSVE | | STRLNGESSL | | VLQTQPWFSG | | KKVIALTLDL | | SDGLLYWLVQ |
DSQCIHLYTA | | VLRGQSTGDT | | TITEFAAWST | | SEISQNALMY | | YSGRLFWING |
FRIITTQEIG | | QKTSVSVLEP | | ARFNQFTIIQ | | TSLKPLPGNF | | SFTPKVIPDS |
VQESSFRIEG | | NASSFQILWN | | GPPAVDWGVV | | FYSVEFSAHS | | KFLASEQHSL |
PVFTVEGLEP | | YALFNLSVTP | | YTYWGKGPKT | | SLSLRAPETV | | PSAPENPRIF |
ILPSGKCCNK | | NEVVVEFRWN | | KPKHENGVLT | | KFEIFYNISN | | QSITNKTCED |
WIAVNVTPSV | | MSFQLEGMSP | | RCFIAFQVRA | | FTSKGPGPYA | | DVVKSTTSEI |
NPFPHLITLL | | GNKIVFLDMD | | QNQVVWTFSA | | ERVISAVCYT | | ADNEMGYYAE |
GDSLFLLHLH | | NRSSSELFQD | | SLVFDITVIT | | IDWISRHLYF | | ALKESQNGMQ |
VFDVDLEHKV | | KYPREVKIHN | | RNSTIISFSV | | YPLLSRLYWT | | EVSNFGYQMF |
YYSIISHTLH | | RILQPTATNQ | | QNKRNQCSCN | | VTEFELSGAM | | AIDTSNLEKP |
LIYFAKAQEI | | WAMDLEGCQC | | WRVITVPAML | | AGKTLVSLTV | | DGDLIYWIIT |
AKDSTQIYQA | | KKGNGAIVSQ | | VKALRSRHIL | | AYSSVMQPFP | | DKAFLSLASD |
TVEPTILNAT | | NTSLTIRLPL | | AKTNLTWYGI | | TSPTPTYLVY | | YAEVNDRKNS |
SDLKYRILEF | | QDSIALIEDL | | QPFSTYMIQI | | AVKNYYSDPL | | EHLPPGKEIW |
GKTKNGVPEA | | VQLINTTVRS | | DTSLIISWRE | | SHKPNGPKES | | VRYQLAISHL |
ALIPETPLRQ | | SEFPNGRLTL | | LVTRLSGGNI | | YVLKVLACHS | | EEMWCTESHP |
VTVEMFNTPE | | KPYSLVPENT | | SLQFNWKAPL | | NVNLIRFWVE | | LQKWKYNEFY |
HVKTSCSQGP | | AYVCNITNLQ | | PYTSYNVRVV | | VVYKTGENST | | SLPESFKTKA |
GVPNKPGIPK | | LLEGSKNSIQ | | WEKAEDNGCR | | ITYYILEIRK | | STSNNLQNQN |
LRWKMTFNGS | | CSSVCTWKSK | | NLKGIFQFRV | | VAANNLGFGE | | YSGISENIIL |
VGDDFWIPET | | SFILTIIVGI | | FLVVTIPLTF | | VWHRRLKNQK | | SAKEGVTVLI |
NEDKELAELR | | GLAAGVGLAN | | ACYAIHTLPT | | QEEIENLPAF | | PREKLTLRLL |
LGSGAFGEVY | | EGTAVDILGV | | GSGEIKVAVK | | TLKKGSTDQE | | KIEFLKEAHL |
MSKFNHPNIL | | KQLGVCLLNE | | PQYIILELME | | GGDLLTYLRK | | ARMATFYGPL |
LTLVDLVDLC | | VDISKGCVYL | | ERMHFIHRDL | | AARNCLVSVK | | DYTSPRIVKI |
GDFGLARDIY | | KNDYYRKRGE | | GLLPVRWMAP | | ESLMDGIFTT | | QSDVWSFGIL |
IWEILTLGHQ | | PYPAHSNLDV | | LNYVQTGGRL | | EPPRNCPDDL | | WNLMTQCWAQ |
EPDQRPTFHR | | IQDQLQLFRN | | FFLNSIYKSR | | DEANNSGVIN | | ESFEGEDGDV |
ICLNSDDIMP | | VALMETKNRE | | GLNYMVLATE | | CGQGEEKSEG | | PLGSQESESC |
GLRKEEKEPH | | ADKDFCQEKQ | | VAYCPSGKPE | | GLNYACLTHS | | GYGDGSD |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Birchmeier C., O'Neill K., Riggs M., Wigler M. (1990). Characterization of ROS1 cDNA from a human glioblastoma cell line. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4799—4803. PMID 2352949 DOI:10.1073/pnas.87.12.4799
- Matsushime H., Wang L.-H., Shibuya M. (1986). Human c-ros-1 gene homologous to the v-ros sequence of UR2 sarcoma virus encodes for a transmembrane receptorlike molecule. Mol. Cell. Biol. 6: 3000—3004. PMID 3023956 DOI:10.1128/MCB.6.8.3000
- Birchmeier C., Birnbaum D., Waitches G., Fasano O., Wigler M. (1986). Characterization of an activated human ros gene. Mol. Cell. Biol. 6: 3109—3116. PMID 3785223 DOI:10.1128/MCB.6.9.3109
- Watkins D., Dion F., Poisson M., Delattre J.Y., Rouleau G.A. (1994). Analysis of oncogene expression in primary human gliomas: evidence for increased expression of the ros oncogene. Cancer Genet. Cytogenet. 72: 130—136. PMID 8143271 DOI:10.1016/0165-4608(94)90128-7
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10261 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P08922 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |