ROS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3ZBF, 4UXL

Ідентифікатори

Символи

ROS1, MCF3, ROS, c-ros-1, ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase

Зовнішні ІД

OMIM: 165020 MGI: 97999 HomoloGene: 2207 GeneCards: ROS1

Реагує на сполуку

entrectinib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase activity • protein phosphatase binding • ATP binding • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • integral component of plasma membrane • receptor complex
Біологічний процес	• диференціація клітин • regulation of TOR signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of phosphate transport • negative regulation of gene expression • protein phosphorylation • Сперматогенез • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • проліферація • columnar/cuboidal epithelial cell development • regulation of cell growth • negative regulation of signal transduction • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6098


19886

Ensembl


ENSG00000047936


ENSMUSG00000019893

UniProt


P08922


Q78DX7

RefSeq (мРНК)


NM_002944 NM_001378891 NM_001378902


NM_011282

RefSeq (білок)


NP_002935 NP_001365820 NP_001365831


NP_035412

Локус (UCSC)

Хр. 6: 117.29 – 117.43 Mb

Хр. 10: 51.92 – 52.07 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ROS1 (англ. ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 347 амінокислот, а молекулярна маса — 263 915^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKNIYCLIPK	LVNFATLGCL	WISVVQCTVL	NSCLKSCVTN	LGQQLDLGTP
HNLSEPCIQG	CHFWNSVDQK	NCALKCRESC	EVGCSSAEGA	YEEEVLENAD
LPTAPFASSI	GSHNMTLRWK	SANFSGVKYI	IQWKYAQLLG	SWTYTKTVSR
PSYVVKPLHP	FTEYIFRVVW	IFTAQLQLYS	PPSPSYRTHP	HGVPETAPLI
RNIESSSPDT	VEVSWDPPQF	PGGPILGYNL	RLISKNQKLD	AGTQRTSFQF
YSTLPNTIYR	FSIAAVNEVG	EGPEAESSIT	TSSSAVQQEE	QWLFLSRKTS
LRKRSLKHLV	DEAHCLRLDA	IYHNITGISV	DVHQQIVYFS	EGTLIWAKKA
ANMSDVSDLR	IFYRGSGLIS	SISIDWLYQR	MYFIMDELVC	VCDLENCSNI
EEITPPSISA	PQKIVADSYN	GYVFYLLRDG	IYRADLPVPS	GRCAEAVRIV
ESCTLKDFAI	KPQAKRIIYF	NDTAQVFMST	FLDGSASHLI	LPRIPFADVK
SFACENNDFL	VTDGKVIFQQ	DALSFNEFIV	GCDLSHIEEF	GFGNLVIFGS
SSQLHPLPGR	PQELSVLFGS	HQALVQWKPP	ALAIGANVIL	ISDIIELFEL
GPSAWQNWTY	EVKVSTQDPP	EVTHIFLNIS	GTMLNVPELQ	SAMKYKVSVR
ASSPKRPGPW	SEPSVGTTLV	PASEPPFIMA	VKEDGLWSKP	LNSFGPGEFL
SSDIGNVSDM	DWYNNSLYYS	DTKGDVFVWL	LNGTDISENY	HLPSIAGAGA
LAFEWLGHFL	YWAGKTYVIQ	RQSVLTGHTD	IVTHVKLLVN	DMVVDSVGGY
LYWTTLYSVE	STRLNGESSL	VLQTQPWFSG	KKVIALTLDL	SDGLLYWLVQ
DSQCIHLYTA	VLRGQSTGDT	TITEFAAWST	SEISQNALMY	YSGRLFWING
FRIITTQEIG	QKTSVSVLEP	ARFNQFTIIQ	TSLKPLPGNF	SFTPKVIPDS
VQESSFRIEG	NASSFQILWN	GPPAVDWGVV	FYSVEFSAHS	KFLASEQHSL
PVFTVEGLEP	YALFNLSVTP	YTYWGKGPKT	SLSLRAPETV	PSAPENPRIF
ILPSGKCCNK	NEVVVEFRWN	KPKHENGVLT	KFEIFYNISN	QSITNKTCED
WIAVNVTPSV	MSFQLEGMSP	RCFIAFQVRA	FTSKGPGPYA	DVVKSTTSEI
NPFPHLITLL	GNKIVFLDMD	QNQVVWTFSA	ERVISAVCYT	ADNEMGYYAE
GDSLFLLHLH	NRSSSELFQD	SLVFDITVIT	IDWISRHLYF	ALKESQNGMQ
VFDVDLEHKV	KYPREVKIHN	RNSTIISFSV	YPLLSRLYWT	EVSNFGYQMF
YYSIISHTLH	RILQPTATNQ	QNKRNQCSCN	VTEFELSGAM	AIDTSNLEKP
LIYFAKAQEI	WAMDLEGCQC	WRVITVPAML	AGKTLVSLTV	DGDLIYWIIT
AKDSTQIYQA	KKGNGAIVSQ	VKALRSRHIL	AYSSVMQPFP	DKAFLSLASD
TVEPTILNAT	NTSLTIRLPL	AKTNLTWYGI	TSPTPTYLVY	YAEVNDRKNS
SDLKYRILEF	QDSIALIEDL	QPFSTYMIQI	AVKNYYSDPL	EHLPPGKEIW
GKTKNGVPEA	VQLINTTVRS	DTSLIISWRE	SHKPNGPKES	VRYQLAISHL
ALIPETPLRQ	SEFPNGRLTL	LVTRLSGGNI	YVLKVLACHS	EEMWCTESHP
VTVEMFNTPE	KPYSLVPENT	SLQFNWKAPL	NVNLIRFWVE	LQKWKYNEFY
HVKTSCSQGP	AYVCNITNLQ	PYTSYNVRVV	VVYKTGENST	SLPESFKTKA
GVPNKPGIPK	LLEGSKNSIQ	WEKAEDNGCR	ITYYILEIRK	STSNNLQNQN
LRWKMTFNGS	CSSVCTWKSK	NLKGIFQFRV	VAANNLGFGE	YSGISENIIL
VGDDFWIPET	SFILTIIVGI	FLVVTIPLTF	VWHRRLKNQK	SAKEGVTVLI
NEDKELAELR	GLAAGVGLAN	ACYAIHTLPT	QEEIENLPAF	PREKLTLRLL
LGSGAFGEVY	EGTAVDILGV	GSGEIKVAVK	TLKKGSTDQE	KIEFLKEAHL
MSKFNHPNIL	KQLGVCLLNE	PQYIILELME	GGDLLTYLRK	ARMATFYGPL
LTLVDLVDLC	VDISKGCVYL	ERMHFIHRDL	AARNCLVSVK	DYTSPRIVKI
GDFGLARDIY	KNDYYRKRGE	GLLPVRWMAP	ESLMDGIFTT	QSDVWSFGIL
IWEILTLGHQ	PYPAHSNLDV	LNYVQTGGRL	EPPRNCPDDL	WNLMTQCWAQ
EPDQRPTFHR	IQDQLQLFRN	FFLNSIYKSR	DEANNSGVIN	ESFEGEDGDV
ICLNSDDIMP	VALMETKNRE	GLNYMVLATE	CGQGEEKSEG	PLGSQESESC
GLRKEEKEPH	ADKDFCQEKQ	VAYCPSGKPE	GLNYACLTHS	GYGDGSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Birchmeier C., O'Neill K., Riggs M., Wigler M. (1990). Characterization of ROS1 cDNA from a human glioblastoma cell line. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4799—4803. PMID 2352949 DOI:10.1073/pnas.87.12.4799
Matsushime H., Wang L.-H., Shibuya M. (1986). Human c-ros-1 gene homologous to the v-ros sequence of UR2 sarcoma virus encodes for a transmembrane receptorlike molecule. Mol. Cell. Biol. 6: 3000—3004. PMID 3023956 DOI:10.1128/MCB.6.8.3000
Birchmeier C., Birnbaum D., Waitches G., Fasano O., Wigler M. (1986). Characterization of an activated human ros gene. Mol. Cell. Biol. 6: 3109—3116. PMID 3785223 DOI:10.1128/MCB.6.9.3109
Watkins D., Dion F., Poisson M., Delattre J.Y., Rouleau G.A. (1994). Analysis of oncogene expression in primary human gliomas: evidence for increased expression of the ros oncogene. Cancer Genet. Cytogenet. 72: 130—136. PMID 8143271 DOI:10.1016/0165-4608(94)90128-7

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10261 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P08922 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.