RRP1B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RRP1B, KIAA0179, NNP1L, Nnp1, PPP1R136, RRP1, ribosomal RNA processing 1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610654 MGI: 1919712 HomoloGene: 57086 GeneCards: RRP1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • RNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • GO:0035328 Гетерохроматин • preribosome, small subunit precursor • гіалоплазма • GO:0035327 Еухроматин • ядерце • клітинне ядро • preribosome, large subunit precursor • granular component • нуклеоплазма • хромосома |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of phosphatase activity • rRNA processing • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • positive regulation of apoptotic process • regulation of RNA splicing • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to virus • mRNA processing • GO:0097285 апоптоз • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 21: 43.66 – 43.7 Mb | Хр. 17: 32.26 – 32.28 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RRP1B (англ. Ribosomal RNA processing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 758 амінокислот, а молекулярна маса — 84 428[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPAMQPAEI | | QFAQRLASSE | | KGIRDRAVKK | | LRQYISVKTQ | | RETGGFSQEE |
LLKIWKGLFY | | CMWVQDEPLL | | QEELANTIAQ | | LVHAVNNSAA | | QHLFIQTFWQ |
TMNREWKGID | | RLRLDKYYML | | IRLVLRQSFE | | VLKRNGWEES | | RIKVFLDVLM |
KEVLCPESQS | | PNGVRFHFID | | IYLDELSKVG | | GKELLADQNL | | KFIDPFCKIA |
AKTKDHTLVQ | | TIARGVFEAI | | VDQSPFVPEE | | TMEEQKTKVG | | DGDLSAEEIP |
ENEVSLRRAV | | SKKKTALGKN | | HSRKDGLSDE | | RGRDDCGTFE | | DTGPLLQFDY |
KAVADRLLEM | | TSRKNTPHFN | | RKRLSKLIKK | | FQDLSEGSSI | | SQLSFAEDIS |
ADEDDQILSQ | | GKHKKKGNKL | | LEKTNLEKEK | | GSRVFCVEEE | | DSESSLQKRR |
RKKKKKHHLQ | | PENPGPGGAA | | PSLEQNRGRE | | PEASGLKALK | | ARVAEPGAEA |
TSSTGEESGS | | EHPPAVPMHN | | KRKRPRKKSP | | RAHREMLESA | | VLPPEDMSQS |
GPSGSHPQGP | | RGSPTGGAQL | | LKRKRKLGVV | | PVNGSGLSTP | | AWPPLQQEGP |
PTGPAEGANS | | HTTLPQRRRL | | QKKKAGPGSL | | ELCGLPSQKT | | ASLKKRKKMR |
VMSNLVEHNG | | VLESEAGQPQ | | ALGSSGTCSS | | LKKQKLRAES | | DFVKFDTPFL |
PKPLFFRRAK | | SSTATHPPGP | | AVQLNKTPSS | | SKKVTFGLNR | | NMTAEFKKTD |
KSILVSPTGP | | SRVAFDPEQK | | PLHGVLKTPT | | SSPASSPLVA | | KKPLTTTPRR |
RPRAMDFF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23818 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14684 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |