RRP9 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4J0W, 4JXM | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RRP9, RNU3IP2, U3-55K, ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2384313 HomoloGene: 3452 GeneCards: RRP9 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • U3 snoRNA binding • RNA binding • snoRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • small-subunit processome • ядерце • box C/D RNP complex • нуклеоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • rRNA processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 51.93 – 51.94 Mb | Хр. 9: 106.35 – 106.36 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RRP9 (англ. Ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 51 841[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSATAAARKR | | GKPASGAGAG | | AGAGKRRRKA | | DSAGDRGKSK | | GGGKMNEEIS |
SDSESESLAP | | RKPEEEEEEE | | LEETAQEKKL | | RLAKLYLEQL | | RQQEEEKAEA |
RAFEEDQVAG | | RLKEDVLEQR | | GRLQKLVAKE | | IQAPASADIR | | VLRGHQLSIT |
CLVVTPDDSA | | IFSAAKDCSI | | IKWSVESGRK | | LHVIPRAKKG | | AEGKPPGHSS |
HVLCMAISSD | | GKYLASGDRS | | KLILIWEAQS | | CQHLYTFTGH | | RDAVSGLAFR |
RGTHQLYSTS | | HDRSVKVWNV | | AENSYVETLF | | GHQDAVAALD | | ALSRECCVTA |
GGRDGTVRVW | | KIPEESQLVF | | YGHQGSIDCI | | HLINEEHMVS | | GADDGSVALW |
GLSKKRPLAL | | QREAHGLRGE | | PGLEQPFWIS | | SVAALLNTDL | | VATGSHSSCV |
RLWQCGEGFR | | QLDLLCDIPL | | VGFINSLKFS | | SSGDFLVAGV | | GQEHRLGRWW |
RIKEARNSVC | | IIPLRRVPVP | | PAAGS |
Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг рРНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Pluk H., Soffner J., Luehrmann R., van Venrooij W.J. (1998). cDNA cloning and characterization of the human U3 small nucleolar ribonucleoprotein complex-associated 55-kilodalton protein. Mol. Cell. Biol. 18: 488—498. PMID 9418896 DOI:10.1128/MCB.18.1.488
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16829 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43818 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |