SGSM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SGSM1, RUTBC2, small G protein signaling modulator 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611417 MGI: 107320 HomoloGene: 64485 GeneCards: SGSM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • комплекс Ґольджі • мембрана • цитоплазма • cytoplasmic vesicle membrane • гіалоплазма • система ендомембран • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • intracellular protein transport • regulation of vesicle fusion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_133454 NM_001039948 NM_001098497 NM_001098498 |
| | NM_001162965 NM_001254731 NM_172718 NM_001309526 NM_001309528 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001035037 NP_001091967 NP_001091968 NP_597711 |
| | NP_001156437 NP_001241660 NP_001296455 NP_001296457 NP_766306 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 24.81 – 24.93 Mb | Хр. 5: 113.39 – 113.46 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SGSM1 (англ. Small G protein signaling modulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 148 амінокислот, а молекулярна маса — 129 718[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASAPAEAET | | RQRLLRTVKK | | EVKQIMEEAV | | TRKFVHEDSS | | HIISFCAAVE |
ACVLHGLRRR | | AAGFLRSNKI | | AALFMKVGKN | | FPPAEDLSRK | | VQDLEQLIES |
ARNQIQGLQE | | NVRKLPKLPN | | LSPLAIKHLW | | IRTALFEKVL | | DKIVHYLVEN |
SSKYYEKEAL | | LMDPVDGPIL | | ASLLVGPCAL | | EYTKMKTADH | | FWTDPSADEL |
VQRHRIHSSH | | VRQDSPTKRP | | ALCIQKRHSS | | GSMDDRPSLS | | ARDYVESLHQ |
NSRATLLYGK | | NNVLVQPRDD | | MEAVPGYLSL | | HQTADVMTLK | | WTPNQLMNGS |
VGDLDYEKSV | | YWDYAMTIRL | | EEIVYLHCHQ | | QVDSGGTVVL | | VSQDGIQRPP |
FRFPKGGHLL | | QFLSCLENGL | | LPHGQLDPPL | | WSQRGKGKVF | | PKLRKRSPQG |
SAESTSSDKD | | DDEATDYVFR | | IIYPGMQSEF | | VAPDFLGSTS | | SVSVGPAWMM |
VPAGRSMLVV | | ARGSQWEPAR | | WDTTLPTPSP | | KEQPPMPQDL | | MDVSVSNLPS |
LWQPSPRKSS | | CSSCSQSGSA | | DGSSTNGCNH | | ERAPLKLLCD | | NMKYQILSRA |
FYGWLAYCRH | | LSTVRTHLSA | | LVNHMIVSPD | | LPCDAGQGLT | | ARIWEQYLHD |
STSYEEQELL | | RLIYYGGIQP | | EIRKAVWPFL | | LGHYQFGMTE | | TERKEVDEQI |
HACYAQTMAE | | WLGCEAIVRQ | | RERESHAAAL | | AKCSSGASLD | | SHLHRMLHRD |
STISNESSQS | | CSSGRQNIRL | | HSDSSSSTQV | | FESVDEVEQV | | EAEGRLEEKQ |
PKIPNGNLVN | | GTCSPDSGHP | | SSHNFSSGLS | | EHSEPSLSTE | | DSVLDAQRNT |
PTVLRPRDGS | | VDDRQSSEAT | | TSQDEAPREE | | LAVQDSLESD | | LLANESMDEF |
MSITGSLDMA | | LPEKDDVVME | | GWRSSETEKH | | GQADSEDNLS | | EEPEMESLFP |
ALASLAVTTS | | ANEVSPVSSS | | GVTYSPELLD | | LYTVNLHRIE | | KDVQRCDRNY |
WYFTPANLEK | | LRNIMCSYIW | | QHIEIGYVQG | | MCDLLAPLLV | | ILDDEALAFS |
CFTELMKRMN | | QNFPHGGAMD | | THFANMRSLI | | QILDSELFEL | | MHQNGDYTHF |
YFCYRWFLLD | | FKRELVYDDV | | FLVWETIWAA | | KHVSSAHYVL | | FIALALVEVY |
RDIILENNMD | | FTDIIKFFNE | | MAERHNTKQV | | LKLARDLVYK | | VQTLIENK |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
- Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29410 (англ.) . Архів оригіналу за 3 червня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q2NKQ1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |