SNAP29

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4WY4

Ідентифікатори

Символи

SNAP29, CEDNIK, SNAP-29, synaptosome associated protein 29kDa, synaptosome associated protein 29

Зовнішні ІД

OMIM: 604202 MGI: 1914724 HomoloGene: 3512 GeneCards: SNAP29

Пов'язані генетичні захворювання

CEDNIK syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • центросома • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • війка • autophagosome membrane • SNARE complex • ciliary membrane • ciliary pocket membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • presynapse • Golgi membrane • нуклеоплазма • autophagosome • гіалоплазма • azurophil granule membrane • синапс
Біологічний процес	• vesicle targeting • synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane • membrane fusion • автофагія • GO:0000046 autophagosome maturation • cell projection organization • synaptic vesicle priming • protein transport • екзоцитоз • autophagosome membrane docking • neutrophil degranulation • cilium assembly • vesicle fusion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9342


67474

Ensembl


ENSG00000099940


ENSMUSG00000022765

UniProt


O95721


Q9ERB0

RefSeq (мРНК)


NM_004782


NM_023348

RefSeq (білок)


NP_004773


NP_075837

Локус (UCSC)

Хр. 22: 20.86 – 20.89 Mb

Хр. 16: 17.22 – 17.25 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAP29 (англ. Synaptosome associated protein 29) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 28 970^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAYPKSYNP	FDDDGEDEGA	RPAPWRDARD	LPDGPDAPAD	RQQYLRQEVL
RRAEATAAST	SRSLALMYES	EKVGVASSEE	LARQRGVLER	TEKMVDKMDQ
DLKISQKHIN	SIKSVFGGLV	NYFKSKPVET	PPEQNGTLTS	QPNNRLKEAI
STSKEQEAKY	QASHPNLRKL	DDTDPVPRGA	GSAMSTDAYP	KNPHLRAYHQ
KIDSNLDELS	MGLGRLKDIA	LGMQTEIEEQ	DDILDRLTTK	VDKLDVNIKS
TERKVRQL

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, біогенез та деградація війок. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, війках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. (2012). The hairpin-type tail-anchored SNARE syntaxin 17 targets to autophagosomes for fusion with endosomes/lysosomes. Cell. 151: 1256—1269. PMID 23217709 DOI:10.1016/j.cell.2012.11.001

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNAP29 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11133 (англ.) . Архів оригіналу за 9 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O95721 (англ.) . Архів оригіналу за 7 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.