SNAPC1

Ідентифікатори

Символи

SNAPC1, PTFgamma, SNAP43, small nuclear RNA activating complex polypeptide 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600591 MGI: 1922877 HomoloGene: 2317 GeneCards: SNAPC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• snRNA-activating protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase III • snRNA transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6617


75627

Ensembl


ENSG00000023608


ENSMUSG00000021113

UniProt


Q16533


Q8K0S9

RefSeq (мРНК)


NM_003082


NM_178392

RefSeq (білок)


NP_003073


NP_848479

Локус (UCSC)

Хр. 14: 61.76 – 61.8 Mb

Хр. 12: 74.01 – 74.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAPC1 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 368 амінокислот, а молекулярна маса — 42 994^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTPPGLQTD	CEALLSRFQE	TDSVRFEDFT	ELWRNMKFGT	IFCGRMRNLE
KNMFTKEALA	LAWRYFLPPY	TFQIRVGALY	LLYGLYNTQL	CQPKQKIRVA
LKDWDEVLKF	QQDLVNAQHF	DAAYIFRKLR	LDRAFHFTAM	PKLLSYRMKK
KIHRAEVTEE	FKDPSDRVMK	LITSDVLEEM	LNVHDHYQNM	KHVISVDKSK
PDKALSLIKD	DFFDNIKNIV	LEHQQWHKDR	KNPSLKSKTN	DGEEKMEGNS
QETERCERAE	SLAKIKSKAF	SVVIQASKSR	RHRQVKLDSS	DSDSASGQGQ
VKATRKKEKK	ERLKPAGRKM	SLRNKGNVQN	IHKEDKPLSL	SMPVITEEEE
NESLSGTEFT	ASKKRRKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Henry R.W., Sadowski C.L., Kobayashi R., Hernandez N. (1995). A TBP-TAF complex required for transcription of human snRNA genes by RNA polymerase II and III. Nature. 374: 653—656. PMID 7715707 DOI:10.1038/374653a0
Yoon J.B., Roeder R.G. (1996). Cloning of two proximal sequence element-binding transcription factor subunits (gamma and delta) that are required for transcription of small nuclear RNA genes by RNA polymerases II and III and interact with the TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 16: 1—9. PMID 8524284 DOI:10.1128/MCB.16.1.1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 DOI:10.1074/jbc.M009301200
Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11134 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16533 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.