SNX18 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNX18, SH3PX2, SH3PXD3B, SNAG1, sorting nexin 18 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2137642 HomoloGene: 14164 GeneCards: SNX18 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • endosome membrane • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • система ендомембран • clathrin-coated vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ендосома |
---|
Біологічний процес | • cleavage furrow formation • поділ клітини • endosomal transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein transport • клітинний цикл • ендоцитоз • mitotic cytokinesis • GO:0007067 мітоз • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_052870 NM_001102575 NM_001145427 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001096045 NP_001138899 NP_443102 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 54.52 – 54.55 Mb | Хр. 13: 113.73 – 113.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNX18 (англ. Sorting nexin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 628 амінокислот, а молекулярна маса — 68 894[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALRARALYD | | FRSENPGEIS | | LREHEVLSLC | | SEQDIEGWLE | | GVNSRGDRGL |
FPASYVQVIR | | APEPGPAGDG | | GPGAPARYAN | | VPPGGFEPLP | | VAPPASFKPP |
PDAFQALLQP | | QQAPPPSTFQ | | PPGAGFPYGG | | GALQPSPQQL | | YGGYQASQGS |
DDDWDDEWDD | | SSTVADEPGA | | LGSGAYPDLD | | GSSSAGVGAA | | GRYRLSTRSD |
LSLGSRGGSV | | PPQHHPSGPK | | SSATVSRNLN | | RFSTFVKSGG | | EAFVLGEASG |
FVKDGDKLCV | | VLGPYGPEWQ | | ENPYPFQCTI | | DDPTKQTKFK | | GMKSYISYKL |
VPTHTQVPVH | | RRYKHFDWLY | | ARLAEKFPVI | | SVPHLPEKQA | | TGRFEEDFIS |
KRRKGLIWWM | | NHMASHPVLA | | QCDVFQHFLT | | CPSSTDEKAW | | KQGKRKAEKD |
EMVGANFFLT | | LSTPPAAALD | | LQEVESKIDG | | FKCFTKKMDD | | SALQLNHTAN |
EFARKQVTGF | | KKEYQKVGQS | | FRGLSQAFEL | | DQQAFSVGLN | | QAIAFTGDAY |
DAIGELFAEQ | | PRQDLDPVMD | | LLALYQGHLA | | NFPDIIHVQK | | GKAWPLEQVI |
WSVLCRLKGA | | TLTAVPLWVS | | ESYSTGEEAS | | RDVDAWVFSL | | ECKLDCSTGS |
FLLEYLALGN | | EYSFSKVQRV | | PLMTVLSF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Haberg K., Lundmark R., Carlsson S.R. (2008). SNX18 is an SNX9 paralog that acts as a membrane tubulator in AP-1-positive endosomal trafficking. J. Cell Sci. 121: 1495—1505. PMID 18411244 DOI:10.1242/jcs.028530
- Baumann C., Lindholm C.K., Rimoldi D., Levy F. (2010). The E3 ubiquitin ligase Itch regulates sorting nexin 9 through an unconventional substrate recognition domain. FEBS J. 277: 2803—2814. PMID 20491914 DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07698.x
- Ma M.P., Chircop M. (2012). SNX9, SNX18 and SNX33 are required for progression through and completion of mitosis. J. Cell Sci. 125: 4372—4382. PMID 22718350 DOI:10.1242/jcs.105981
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19245 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96RF0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |