SP100

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H5P, 5FB0, 5FB1

Ідентифікатори

Символи

SP100, lysp100b, SP100 nuclear antigen

Зовнішні ІД

OMIM: 604585 MGI: 109561 HomoloGene: 90788 GeneCards: SP100

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • chromo shadow domain binding • identical protein binding • protein homodimerization activity • kinase binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein dimerization activity
Клітинна компонента	• ядерце • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро • PML body • Mre11 complex • nuclear periphery • ядерні тільця
Біологічний процес	• negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • response to cytokine • transcription, DNA-templated • negative regulation of endothelial cell migration • negative regulation of viral transcription • regulation of angiogenesis • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • negative regulation of DNA binding • negative regulation of protein export from nucleus • GO:0022415 viral process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • telomere maintenance • response to type I interferon • regulation of Fas signaling pathway • retinoic acid receptor signaling pathway • response to retinoic acid • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to interferon-gamma • type I interferon signaling pathway • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • interferon-gamma-mediated signaling pathway • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • maintenance of protein location
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6672


20684

Ensembl


ENSG00000067066


ENSMUSG00000026222

UniProt


P23497


O35892

RefSeq (мРНК)

NM_003113 NM_001080391 NM_001206701 NM_001206702 NM_001206703
NM_001206704

NM_013673 NM_001313712 NM_001313713 NM_001313714 NM_001372231
NM_001372232

RefSeq (білок)

NP_001073860 NP_001193630 NP_001193631 NP_001193632 NP_001193633
NP_003104

NP_001300641 NP_001300642 NP_001300643 NP_038701 NP_001359160
NP_001359161

Локус (UCSC)

Хр. 2: 230.42 – 230.55 Mb

Хр. 1: 85.58 – 85.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SP100 (англ. SP100 nuclear antigen) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 879 амінокислот, а молекулярна маса — 100 417^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGGGGDLST	RRLNECISPV	ANEMNHLPAH	SHDLQRMFTE	DQGVDDRLLY
DIVFKHFKRN	KVEISNAIKK	TFPFLEGLRD	RDLITNKMFE	DSQDSCRNLV
PVQRVVYNVL	SELEKTFNLP	VLEALFSDVN	MQEYPDLIHI	YKGFENVIHD
KLPLQESEEE	EREERSGLQL	SLEQGTGENS	FRSLTWPPSG	SPSHAGTTPP
ENGLSEHPCE	TEQINAKRKD	TTSDKDDSLG	SQQTNEQCAQ	KAEPTESCEQ
IAVQVNNGDA	GREMPCPLPC	DEESPEAELH	NHGIQINSCS	VRLVDIKKEK
PFSNSKVECQ	AQARTHHNQA	SDIIVISSED	SEGSTDVDEP	LEVFISAPRS
EPVINNDNPL	ESNDEKEGQE	ATCSRPQIVP	EPMDFRKLST	FRESFKKRVI
GQDHDFSESS	EEEAPAEASS	GALRSKHGEK	APMTSRSTST	WRIPSRKRRF
SSSDFSDLSN	GEELQETCSS	SLRRGSGSQP	QEPENKKCSC	VMCFPKGVPR
SQEARTESSQ	ASDMMDTMDV	ENNSTLEKHS	GKRRKKRRHR	SKVNGLQRGR
KKDRPRKHLT	LNNKVQKKRW	QQRGRKANTR	PLKRRRKRGP	RIPKDENINF
KQSELPVTCG	EVKGTLYKER	FKQGTSKKCI	QSEDKKWFTP	REFEIEGDRG
ASKNWKLSIR	CGGYTLKVLM	ENKFLPEPPS	TRKKRILESH	NNTLVDPCEE
HKKKNPDASV	KFSEFLKKCS	ETWKTIFAKE	KGKFEDMAKA	DKAHYEREMK
TYIPPKGEKK	KKFKDPNAPK	RPPLAFFLFC	SEYRPKIKGE	HPGLSIDDVV
KKLAGMWNNT	AAADKQFYEK	KAAKLKEKYK	KDIAAYRAKG	KPNSAKKRVV
KAEKSKKKKE	EEEDEEDEQE	EENEEDDDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Seeler J.-S., Marchio A., Sitterlin D., Transy C., Dejean A. (1998). Interaction of SP100 with HP1 proteins: a link between the promyelocytic leukemia-associated nuclear bodies and the chromatin compartment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7316—7321. PMID 9636146 DOI:10.1073/pnas.95.13.7316
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Groetzinger T., Jensen K., Will H. (1996). The interferon (IFN)-stimulated gene Sp100 promoter contains an IFN-gamma activation site and an imperfect IFN-stimulated response element which mediate type I IFN inducibility. J. Biol. Chem. 271: 25253—25260. PMID 8810287 DOI:10.1074/jbc.271.41.25253
Rogalla P., Kazmierczak B., Flohr A.M., Hauke S., Bullerdiek J. (2000). Back to the roots of a new exon-the molecular archaeology of a SP100 splice variant. Genomics. 63: 117—122. PMID 10766566 DOI:10.1006/geno.1999.6008
Devor E.J. (2001). Molecular archeology of an SP100 splice variant revisited: dating the retrotranscription and Alu insertion events. Genome Biol. 2: RESEARCH0040.1—RESEARCH0040.6. PMID 11574059 DOI:10.1186/gb-2001-2-9-research0040
Sternsdorf T., Jensen K., Will H. (1997). Evidence for covalent modification of the nuclear dot-associated proteins PML and Sp100 by PIC1/SUMO-1. J. Cell Biol. 139: 1621—1634. PMID 9412458 DOI:10.1083/jcb.139.7.1621

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11206 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P23497 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.