SPARC |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b6/Protein_SPARC_PDB_1bmo.png/250px-Protein_SPARC_PDB_1bmo.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BMO, 1NUB, 1SRA, 2V53 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPARC, BM-40, ON, OI17, secreted protein acidic and cysteine rich, ONT |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 182120 MGI: 98373 HomoloGene: 31132 GeneCards: SPARC |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
osteogenesis imperfecta type 17[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix binding • collagen binding • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • platelet alpha granule • endocytic vesicle lumen • nuclear matrix • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • базальна мембрана • cell surface • platelet alpha granule membrane • мітохондрія • platelet alpha granule lumen • клітинне ядро • міжклітинний простір • везикула • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • синапс • collagen-containing extracellular matrix • glutamatergic synapse |
---|
Біологічний процес | • response to cytokine • response to cadmium ion • осифікація • lung development • cellular response to growth factor stimulus • response to peptide hormone • platelet degranulation • extracellular matrix organization • response to L-ascorbic acid • response to glucocorticoid • Загоєння ран • рецептор-опосередкований ендоцитоз • negative regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of endothelial cell migration • response to calcium ion • response to gravity • heart development • response to lipopolysaccharide • response to lead ion • regulation of cell population proliferation • negative regulation of angiogenesis • inner ear development • regulation of cell morphogenesis • response to cAMP • response to ethanol • bone development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • pigmentation • GO:1904739 regulation of synapse organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d3/PBB_GE_SPARC_200665_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SPARC_200665_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b8/PBB_GE_SPARC_212667_at_fs.png/250px-PBB_GE_SPARC_212667_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_003118 NM_001309443 NM_001309444 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001296372 NP_001296373 NP_003109 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 151.66 – 151.69 Mb | Хр. 11: 55.29 – 55.31 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPARC (англ. Secreted protein acidic and cysteine rich) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 303 амінокислот, а молекулярна маса — 34 632[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRAWIFFLLC | | LAGRALAAPQ | | QEALPDETEV | | VEETVAEVTE | | VSVGANPVQV |
EVGEFDDGAE | | ETEEEVVAEN | | PCQNHHCKHG | | KVCELDENNT | | PMCVCQDPTS |
CPAPIGEFEK | | VCSNDNKTFD | | SSCHFFATKC | | TLEGTKKGHK | | LHLDYIGPCK |
YIPPCLDSEL | | TEFPLRMRDW | | LKNVLVTLYE | | RDEDNNLLTE | | KQKLRVKKIH |
ENEKRLEAGD | | HPVELLARDF | | EKNYNMYIFP | | VHWQFGQLDQ | | HPIDGYLSHT |
ELAPLRAPLI | | PMEHCTTRFF | | ETCDLDNDKY | | IALDEWAGCF | | GIKQKDIDKD |
LVI |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Lankat-Buttgereit B., Mann K., Deutzmann R., Timpl R., Krieg T. (1988). Cloning and complete amino acid sequences of human and murine basement membrane protein BM-40 (SPARC, osteonectin). FEBS Lett. 236: 352—356. PMID 3410046 DOI:10.1016/0014-5793(88)80054-1
- Swaroop A., Hogan B.L.M., Francke U. (1988). Molecular analysis of the cDNA for human SPARC/osteonectin/BM-40: sequence, expression, and localization of the gene to chromosome 5q31-q33. Genomics. 2: 37—47. PMID 2838412 DOI:10.1016/0888-7543(88)90107-3
- Villarreal X.C., Mann K.G., Long G.L. (1989). Structure of human osteonectin based upon analysis of cDNA and genomic sequences. Biochemistry. 28: 6483—6491. PMID 2790009 DOI:10.1021/bi00441a049
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hunzelmann N., Hafner M., Anders S., Krieg T., Nischt R. (1998). BM-40 (osteonectin, SPARC) is expressed both in the epidermal and in the dermal compartment of adult human skin. J. Invest. Dermatol. 110: 122—126. PMID 9457905 DOI:10.1046/j.1523-1747.1998.00094.x
- Hohenester E., Maurer P., Timpl R. (1997). Crystal structure of a pair of follistatin-like and EF-hand calcium-binding domains in BM-40. EMBO J. 16: 3778—3786. PMID 9233787 DOI:10.1093/emboj/16.13.3778
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPARC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11219 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P09486 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |