SPINK6 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SPINK6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2N52

Ідентифікатори

Символи

SPINK6, BUSI2, UNQ844, serine peptidase inhibitor, Kazal type 6, serine peptidase inhibitor Kazal type 6

Зовнішні ІД

OMIM: 615868 MGI: 3648654 HomoloGene: 89332 GeneCards: SPINK6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity
Клітинна компонента	• extracellular region
Біологічний процес	• negative regulation of peptidase activity • cornification • negative regulation of serine-type endopeptidase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


404203


433180

Ensembl


ENSG00000178172


ENSMUSG00000055095

UniProt


Q6UWN8


Q8BT20

RefSeq (мРНК)


NM_205841 NM_001195290


NM_001013797 NM_001357563 NM_001357564

RefSeq (білок)


NP_001182219 NP_995313


NP_001013819 NP_001344492 NP_001344493

Локус (UCSC)

Хр. 5: 148.2 – 148.22 Mb

Хр. 18: 44.2 – 44.22 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPINK6 (англ. Serine peptidase inhibitor, Kazal type 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 80 амінокислот, а молекулярна маса — 8 585^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLSGMFLLL		SLALFCFLTG		VFSQGGQVDC		GEFQDPKVYC		TRESNPHCGS
DGQTYGNKCA		FCKAIVKSGG		KISLKHPGKC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29486 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6UWN8 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2017. Процитовано 18 вересня 2017.