SSR2

Ідентифікатори

Символи

SSR2, TLAP, TRAP-BETA, TRAPB, HSD25, signal sequence receptor subunit 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600867 MGI: 1913506 HomoloGene: 2369 GeneCards: SSR2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана
Біологічний процес	• cotranslational protein targeting to membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6746


66256

Ensembl


ENSG00000163479


ENSMUSG00000041355

UniProt


P43308


Q9CPW5

RefSeq (мРНК)


NM_003145


NM_025448

RefSeq (білок)


NP_003136


NP_079724 NP_001343245 NP_001343246 NP_001343247 NP_001343248

Локус (UCSC)

Хр. 1: 156.01 – 156.02 Mb

Хр. 3: 88.58 – 88.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSR2 (англ. Signal sequence receptor subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 183 амінокислот, а молекулярна маса — 20 135^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLSFVVLA	LFAVTQAEEG	ARLLASKSLL	NRYAVEGRDL	TLQYNIYNVG
SSAALDVELS	DDSFPPEDFG	IVSGMLNVKW	DRIAPASNVS	HTVVLRPLKA
GYFNFTSATI	TYLAQEDGPV	VIGSTSAPGQ	GGILAQREFD	RRFSPHFLDW
AAFGVMTLPS	IGIPLLLWYS	SKRKYDTPKT	KKN

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Ishikawa H., Barber G.N. (2008). STING is an endoplasmic reticulum adaptor that facilitates innate immune signalling. Nature. 455: 674—678. PMID 18724357 DOI:10.1038/nature07317
Bodescot M., Brison O. (1994). Cloning and sequence analysis of the beta subunit of the human translocon-associated protein. Biochim. Biophys. Acta. 1217: 101—102. PMID 8286409
Chinen K., Sudo K., Takahashi E., Nakamura Y. (1995). Isolation and mapping of the human beta-signal sequence receptor gene (SSR2). Cytogenet. Cell Genet. 70: 215—217. PMID 7789174

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11324 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P43308 (англ.) . Архів оригіналу за 27 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.