STX16

Ідентифікатори

Символи

STX16, SYN16, syntaxin 16, SYN-16

Зовнішні ІД

OMIM: 603666 MGI: 1923396 HomoloGene: 2791 GeneCards: STX16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • Golgi cisterna • focal adhesion • trans-Golgi network • SNARE complex • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • trans-Golgi network membrane • Golgi membrane • система ендомембран • integral component of synaptic vesicle membrane
Біологічний процес	• vesicle docking • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • intracellular protein transport • vesicle fusion • Golgi ribbon formation • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8675


228960

Ensembl


ENSG00000124222


ENSMUSG00000027522

UniProt


O14662


Q8BVI5

RefSeq (мРНК)

NM_001001433 NM_001001434 NM_001134772 NM_001134773 NM_001204868
NM_003763

NM_001102423 NM_001102424 NM_001102425 NM_172675 NM_001363029
NM_001363030 NM_001363031

RefSeq (білок)


NP_001001433 NP_001128244 NP_001128245 NP_001191797 NP_003754

NP_001095893 NP_001095894 NP_001095895 NP_766263 NP_001349958
NP_001349959 NP_001349960

Локус (UCSC)

Хр. 20: 58.65 – 58.68 Mb

Хр. 2: 173.92 – 173.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STX16 (англ. Syntaxin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 37 031^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATRRLTDAF	LLLRNNSIQN	RQLLAEQVSS	HITSSPLHSR	SIAAELDELA
DDRMALVSGI	SLDPEAAIGV	TKRPPPKWVD	GVDEIQYDVG	RIKQKMKELA
SLHDKHLNRP	TLDDSSEEEH	AIEITTQEIT	QLFHRCQRAV	QALPSRARAC
SEQEGRLLGN	VVASLAQALQ	ELSTSFRHAQ	SGYLKRMKNR	EERSQHFFDT
SVPLMDDGDD	NTLYHRGFTE	DQLVLVEQNT	LMVEEREREI	RQIVQSISDL
NEIFRDLGAM	IVEQGTVLDR	IDYNVEQSCI	KTEDGLKQLH	KAEQYQKKNR
KMLVILILFV	IIIVLIVVLV	GVKSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

Tang B.L., Low D.Y.H., Lee S.S., Tan A.E.H., Ho W. (1998). Molecular cloning and localization of human syntaxin 16, a member of the syntaxin family of SNARE proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 242: 673—679. PMID 9464276 DOI:10.1006/bbrc.1997.8029
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Linglart A., Gensure R.C., Olney R.C., Jueppner H., Bastepe M. (2005). A novel STX16 deletion in autosomal dominant pseudohypoparathyroidism type Ib redefines the boundaries of a cis-acting imprinting control element of GNAS. Am. J. Hum. Genet. 76: 804—814. PMID 15800843 DOI:10.1086/429932
Ganley I.G., Espinosa E., Pfeffer S.R. (2008). A syntaxin 10-SNARE complex distinguishes two distinct transport routes from endosomes to the trans-Golgi in human cells. J. Cell Biol. 180: 159—172. PMID 18195106 DOI:10.1083/jcb.200707136
Simonsen A., Bremnes B., Ronning E., Aasland R., Stenmark H. (1998). Syntaxin-16, a putative Golgi t-SNARE. Eur. J. Cell Biol. 75: 223—231. PMID 9587053

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11431 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O14662 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.