SYT6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SYT6, sytVI, synaptotagmin 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607718 MGI: 1859544 HomoloGene: 10301 GeneCards: SYT6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
рак молочної залози[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • protein homodimerization activity • clathrin binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • phosphatidylserine binding • SNARE binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • perinuclear endoplasmic reticulum • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • extrinsic component of membrane • glutamatergic synapse • integral component of synaptic membrane • exocytic vesicle |
---|
Біологічний процес | • acrosomal vesicle exocytosis • акросомна реакція • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • vesicle fusion • presynaptic dense core vesicle exocytosis • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001253772 NM_001270805 NM_205848 NM_001366223 NM_001366224
| NM_001366225 NM_001366226 |
| NM_001276676 NM_001276677 NM_001276679 NM_001276680 NM_001276681
| NM_018800 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001257734 NP_995320 NP_001240701 NP_001353152 NP_001353153
| NP_001353154 NP_001353155 |
| NP_001263605 NP_001263606 NP_001263608 NP_001263609 NP_001263610
| NP_061270 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 114.09 – 114.15 Mb | Хр. 3: 103.48 – 103.55 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SYT6 (англ. Synaptotagmin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 57 325[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGVWGAGGP | | RCQEALAVLA | | SLCRARPPPL | | GLDVETCRSF | | ELQPPERSPS |
AAGAGTSVSL | | LAVVVIVCGV | | ALVAVFLFLF | | WKLCWMPWRN | | KEASSPSSAN |
PPLEALQSPS | | FRGNMADKLK | | DPSTLGFLEA | | AVKISHTSPD | | IPAEVQMSVK |
EHIMRHTRLQ | | RQTTEPASST | | RHTSFKRHLP | | RQMHVSSVDY | | GNELPPAAEQ |
PTSIGRIKPE | | LYKQKSVDGE | | DAKSEATKSC | | GKINFSLRYD | | YETETLIVRI |
LKAFDLPAKD | | FCGSSDPYVK | | IYLLPDRKCK | | LQTRVHRKTL | | NPTFDENFHF |
PVPYEELADR | | KLHLSVFDFD | | RFSRHDMIGE | | VILDNLFEAS | | DLSRETSIWK |
DIQYATSESV | | DLGEIMFSLC | | YLPTAGRLTL | | TVIKCRNLKA | | MDITGYSDPY |
VKVSLLCDGR | | RLKKKKTTIK | | KNTLNPVYNE | | AIIFDIPPEN | | MDQVSLLISV |
MDYDRVGHNE | | IIGVCRVGIT | | AEGLGRDHWN | | EMLAYPRKPI | | AHWHSLVEVK |
KSFKEGNPRL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.
Література
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SYT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18638 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q5T7P8 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |