SYT7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D8K

Ідентифікатори

Символи

SYT7, IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7

Зовнішні ІД

OMIM: 604146 MGI: 1859545 HomoloGene: 20889 GeneCards: SYT7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • syntaxin binding • clathrin binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • calcium-dependent phospholipid binding • calmodulin binding • phosphatidylserine binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • terminal bouton • dense core granule • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • transport vesicle membrane • гіалоплазма • Синаптичні бульбашки • presynaptic membrane • лізосома • пероксисома • peroxisomal membrane • phagocytic vesicle membrane • клітинна мембрана • lysosomal membrane • early phagosome • дендрит (нейробіологія) • neuronal cell body • axon terminus • аксон • neuron projection • exocytic vesicle • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic membrane
Біологічний процес	• regulation of insulin secretion • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • екзоцитоз • regulation of bone remodeling • plasma membrane repair • calcium-ion regulated exocytosis • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of glucagon secretion • phagosome-lysosome fusion • synaptic vesicle recycling • vesicle-mediated cholesterol transport • regulation of phagocytosis • vesicle fusion • calcium ion regulated lysosome exocytosis • Фагоцитоз • regulation of dopamine secretion • short-term synaptic potentiation • vesicle-mediated transport • cellular response to calcium ion • calcium-dependent activation of synaptic vesicle fusion • regulation of synaptic vesicle endocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9066


54525

Ensembl


ENSG00000011347


ENSMUSG00000024743

UniProt


O43581


Q9R0N7

RefSeq (мРНК)

NM_001252065 NM_001300773 NM_004200 NM_001365809 NM_001370210
NM_001370211


NM_018801 NM_173067 NM_173068 NM_001373944

RefSeq (білок)

NP_001238994 NP_001287702 NP_004191 NP_001352738 NP_001357139
NP_001357140


NP_061271 NP_775090 NP_775091

Локус (UCSC)

Хр. 11: 61.51 – 61.58 Mb

Хр. 19: 10.37 – 10.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT7 (англ. Synaptotagmin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 45 501^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYRDPEAASP	GAPSRDVLLV	SAIITVSLSV	TVVLCGLCHW	CQRKLGKRYK
NSLETVGTPD	SGRGRSEKKA	IKLPAGGKAV	NTAPVPGQTP	HDESDRRTEP
RSSVSDLVNS	LTSEMLMLSP	GSEEDEAHEG	CSRENLGRIQ	FSVGYNFQES
TLTVKIMKAQ	ELPAKDFSGT	SDPFVKIYLL	PDKKHKLETK	VKRKNLNPHW
NETFLFEGFP	YEKVVQRILY	LQVLDYDRFS	RNDPIGEVSI	PLNKVDLTQM
QTFWKDLKPC	SDGSGSRGEL	LLSLCYNPSA	NSIIVNIIKA	RNLKAMDIGG
TSDPYVKVWL	MYKDKRVEKK	KTVTMKRNLN	PIFNESFAFD	IPTEKLRETT
IIITVMDKDK	LSRNDVIGKI	YLSWKSGPGE	VKHWKDMIAR	PRQPVAQWHQ
LKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, пероксисомах, синапсах.

Література

Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes. Genomics. 49: 419—429. PMID 9615227 DOI:10.1006/geno.1998.5291
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Caler E.V., Chakrabarti S., Fowler K.T., Rao S., Andrews N.W. (2001). The Exocytosis-regulatory protein synaptotagmin VII mediates cell invasion by Trypanosoma cruzi. J. Exp. Med. 193: 1097—1104. PMID 11342594 DOI:10.1084/jem.193.9.1097
Fukuda M., Ogata Y., Saegusa C., Kanno E., Mikoshiba K. (2002). Alternative splicing isoforms of synaptotagmin VII in the mouse, rat and human. Biochem. J. 365: 173—180. PMID 12071850 DOI:10.1042/BJ20011877
Chakrabarti S., Andrade L.O., Andrews N.W. (2005). Trypanosoma cruzi invades synaptotagmin VII-deficient cells by a PI-3 kinase independent pathway. Mol. Biochem. Parasitol. 141: 125—128. PMID 15811535 DOI:10.1016/j.molbiopara.2005.01.016
Brandt D.S., Coffman M.D., Falke J.J., Knight J.D. (2012). Hydrophobic contributions to the membrane docking of synaptotagmin 7 C2A domain: mechanistic contrast between isoforms 1 and 7. Biochemistry. 51: 7654—7664. PMID 22966849 DOI:10.1021/bi3007115

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11514 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O43581 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.