SYT7 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c0/Protein_SYT7_PDB_2d8k.png/250px-Protein_SYT7_PDB_2d8k.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SYT7, IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604146 MGI: 1859545 HomoloGene: 20889 GeneCards: SYT7 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • syntaxin binding • clathrin binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • calcium-dependent phospholipid binding • calmodulin binding • phosphatidylserine binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • terminal bouton • dense core granule • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • transport vesicle membrane • гіалоплазма • Синаптичні бульбашки • presynaptic membrane • лізосома • пероксисома • peroxisomal membrane • phagocytic vesicle membrane • клітинна мембрана • lysosomal membrane • early phagosome • дендрит (нейробіологія) • neuronal cell body • axon terminus • аксон • neuron projection • exocytic vesicle • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic membrane |
---|
Біологічний процес | • regulation of insulin secretion • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • екзоцитоз • regulation of bone remodeling • plasma membrane repair • calcium-ion regulated exocytosis • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of glucagon secretion • phagosome-lysosome fusion • synaptic vesicle recycling • vesicle-mediated cholesterol transport • regulation of phagocytosis • vesicle fusion • calcium ion regulated lysosome exocytosis • Фагоцитоз • regulation of dopamine secretion • short-term synaptic potentiation • vesicle-mediated transport • cellular response to calcium ion • calcium-dependent activation of synaptic vesicle fusion • regulation of synaptic vesicle endocytosis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001252065 NM_001300773 NM_004200 NM_001365809 NM_001370210
| NM_001370211 |
| | NM_018801 NM_173067 NM_173068 NM_001373944 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001238994 NP_001287702 NP_004191 NP_001352738 NP_001357139
| NP_001357140 |
| | NP_061271 NP_775090 NP_775091 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 61.51 – 61.58 Mb | Хр. 19: 10.37 – 10.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SYT7 (англ. Synaptotagmin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 45 501[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYRDPEAASP | | GAPSRDVLLV | | SAIITVSLSV | | TVVLCGLCHW | | CQRKLGKRYK |
NSLETVGTPD | | SGRGRSEKKA | | IKLPAGGKAV | | NTAPVPGQTP | | HDESDRRTEP |
RSSVSDLVNS | | LTSEMLMLSP | | GSEEDEAHEG | | CSRENLGRIQ | | FSVGYNFQES |
TLTVKIMKAQ | | ELPAKDFSGT | | SDPFVKIYLL | | PDKKHKLETK | | VKRKNLNPHW |
NETFLFEGFP | | YEKVVQRILY | | LQVLDYDRFS | | RNDPIGEVSI | | PLNKVDLTQM |
QTFWKDLKPC | | SDGSGSRGEL | | LLSLCYNPSA | | NSIIVNIIKA | | RNLKAMDIGG |
TSDPYVKVWL | | MYKDKRVEKK | | KTVTMKRNLN | | PIFNESFAFD | | IPTEKLRETT |
IIITVMDKDK | | LSRNDVIGKI | | YLSWKSGPGE | | VKHWKDMIAR | | PRQPVAQWHQ |
LKA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, пероксисомах, синапсах.
Література
- Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes. Genomics. 49: 419—429. PMID 9615227 DOI:10.1006/geno.1998.5291
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Caler E.V., Chakrabarti S., Fowler K.T., Rao S., Andrews N.W. (2001). The Exocytosis-regulatory protein synaptotagmin VII mediates cell invasion by Trypanosoma cruzi. J. Exp. Med. 193: 1097—1104. PMID 11342594 DOI:10.1084/jem.193.9.1097
- Fukuda M., Ogata Y., Saegusa C., Kanno E., Mikoshiba K. (2002). Alternative splicing isoforms of synaptotagmin VII in the mouse, rat and human. Biochem. J. 365: 173—180. PMID 12071850 DOI:10.1042/BJ20011877
- Chakrabarti S., Andrade L.O., Andrews N.W. (2005). Trypanosoma cruzi invades synaptotagmin VII-deficient cells by a PI-3 kinase independent pathway. Mol. Biochem. Parasitol. 141: 125—128. PMID 15811535 DOI:10.1016/j.molbiopara.2005.01.016
- Brandt D.S., Coffman M.D., Falke J.J., Knight J.D. (2012). Hydrophobic contributions to the membrane docking of synaptotagmin 7 C2A domain: mechanistic contrast between isoforms 1 and 7. Biochemistry. 51: 7654—7664. PMID 22966849 DOI:10.1021/bi3007115
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11514 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O43581 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |