SZT2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SZT2, C1orf84, EIEE18, KIAA0467, SZT2A, SZT2B, seizure threshold 2 homolog (mouse), KICSTOR complex subunit, SZT2 subunit KICSTOR complex, SZT2 subunit of KICSTOR complex, DEE18, KICS1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615463 MGI: 3033336 HomoloGene: 49413 GeneCards: SZT2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція |
---|
Клітинна компонента | • GATOR2 complex • KICSTOR complex • GATOR1 complex • пероксисома • лізосома • lysosomal membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • pigmentation • corpus callosum morphogenesis • central nervous system development • regulation of superoxide dismutase activity • post-embryonic development • cellular response to glucose starvation • protein localization to lysosome • negative regulation of TORC1 signaling • response to nutrient levels • cellular response to amino acid starvation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001012960 NM_001012961 NM_015284 NM_182518 NM_001365999 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 43.39 – 43.45 Mb | Хр. 4: 118.22 – 118.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SZT2 (англ. SZT2, KICSTOR complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 432 амінокислот, а молекулярна маса — 378 029[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASERPEPEV | | EEAGQVFLLM | | KKDYRISRNV | | RLAWFLSHLH | | QTVQATPQEM |
LLQSEQELEV | | LSVLPPGWQP | | DEPVVPRPFL | | LVPSTRVTFL | | AWQYRFVIEL |
DLSPSTGIVD | | DSTGEILFDE | | VFHALSRCLG | | GLLRPFRVPG | | SCIDFQPEIY |
VTIQAYSSII | | GLQSHQVLVQ | | GCLLDPSQRE | | VFLQQIYEQL | | CLFEDKVATM |
LQQQYDPQSQ | | AEDQSPDSGD | | LLGRKVGVSM | | VTADLGLVSM | | IRQGILALQL |
LPSNSSAGII | | VITDGVTSVP | | DVAVCETLLN | | QLRSGTVACS | | FVQVGGVYSY |
DCSFGHVPNV | | ELMKFIAMAT | | FGSYLSTCPE | | PEPGNLGLTV | | YHRAFLLYSF |
LRSGEALNPE | | YYCGSQHRLF | | NEHLVSASSN | | PALALRRKKH | | TEKEVPADLV |
STVSVRLREG | | YSVREVTLAK | | GGSQLEVKLV | | LLWKHNMRIE | | YVAMAPWPLE |
PEGPRVTRVE | | VTMEGGYDIL | | HDVSCALRQP | | IRSLYRTHVI | | RRFWNTLQSI |
NQTDQMLAHL | | QSFSSVPEHF | | TLPDSTKSGV | | PLFYIPPGST | | TPVLSLQPSG |
SDSSHAQFAA | | YWKPVLSMDA | | NSWQRWLHMH | | RLVLILEHDT | | PIPKHLHTPG |
SNGRYSTIQC | | RISHSSLTSL | | LRDWSSFVLV | | EGYSYVKLLS | | SAPDQPPNSF |
YMVRIISKAP | | CMVLRLGFPI | | GTPAPARHKI | | VSGLREEILR | | LRFPHRVQSK |
EPTPKVKRKG | | LGGAGGGSSP | | SKSPPVLGPQ | | QALSDRPCLV | | VLHKPLDKLL |
IRYEKLPLDY | | RAPFLLTLEP | | PGPLPLVSGR | | SASSSLASLS | | RYLYHQRWLW |
SVPSGLAPAL | | PLSAIAQLLS | | ILTEVRLSEG | | FHFACSGEGI | | INMVLELPIQ |
NEPPGQAAAE | | EKHTCVVQYI | | LFPPHSTSTK | | DSFSTDDDND | | VEVEALEGDS |
ELNLVTEVWV | | EPQYGRVGPG | | PGIWKHLQDL | | TYSEIPQALH | | PRDAACIGSM |
LSFEYLIQLC | | QSKEWGPLPP | | EPRVSDGLDQ | | GGDTCVHEIP | | FHFDLMGLLP |
QCQQLQMFFL | | LLAREPEGVP | | FAEGSCPAND | | MVLCLLHSCL | | GQELSDREIP |
LTPVDQAAFL | | SEVLRRTCHV | | PGAEGPLLGV | | HGIPKEQAVG | | STQATGDSAF |
TSLSVGLPET | | LKPLISAQPP | | QWRCYARLVN | | PQHVFLTFLP | | ATFSDVQRLA |
ACGLEGPPQE | | ETKPKFGDWS | | GAPSLKDLGG | | TGIKATKSHV | | PVLSVTLASD |
NAQNQGELSP | | PFRRDLQAYA | | GRQASQTESA | | DGPRTRCPVY | | IYSCSLEALR |
EQMVGMQPPQ | | APRDLIFRTQ | | FLDHPSPSSA | | WMEPRYKEAA | | NHCALLQEHA |
QRCYVRGLFR | | SLQQAQSVTS | | QDLLTAVDAC | | EELLQEIDIT | | PFLLALCGHT |
WGLPHAPPSP | | GPLSPGPFSS | | SMEEGAEPRE | | RAILASESSI | | ETEDLSEPEF |
QSTRVPGIPD | | PGPEISLTDV | | CQLRGEAHGA | | LHSVIQEKFL | | EISRLHFRTV |
PSNPHYFFYC | | PPSSRREDEG | | PRDTVDRKIS | | DLEFSEAELM | | GEEGDTSACC |
VVTESDPELE | | VEYRESRESD | | LGPAGLDSAS | | LSDVDTVNPD | | EDSFSILGGD |
SPTGPESFLH | | DLPPLFLHLT | | CSVRLRGQHS | | SVPVCSLPTC | | LGQVLSSLEG |
PPVGGRVPLR | | DLSVTLDVFM | | LTLPLEVELP | | TASDPQHHRS | | TSESSASFPR |
SPGQPSSLRS | | DDGLGPPLPP | | PEEERHPGLS | | NLATPHRLAI | | ETTMNEIRWL |
LEDEMVGALR | | RGGIPQSPAL | | HRAAAHIHSS | | PGRSTCLRQT | | LPLSFVFGPE |
RSLTQFKEEF | | RRLHLPGHVL | | LEDPDSGFFF | | VAAGQQPGGS | | HGEPSSAAWA |
WHSHEDRAEG | | IEGETLTASP | | QAPGSPEDSE | | GVPLISLPRV | | PQGGSQPGPS |
RGLSLMSSQG | | SVDSDHLGYD | | GGSSGSDSEG | | PNDTLGEKAP | | FTLRTPPGPA |
PPQPSLSGLP | | GPCLPDFWLI | | VRVLQDRVEV | | YAHARSLIRE | | DGGPGTECRH |
LQQLLVRRVG | | EICREVNQRL | | LLQDLHDSHV | | CNSLLVAESE | | EDLWRSETPF |
HSRQRAPLPS | | DDYAADESCA | | PRGYLAATMQ | | FVPGHFSCDV | | VWGTVIRVHS |
RLKMGPSMGV | | SRAIQALRSV | | LNAFSVVNRK | | NMFVYQERAT | | KAVYYLRLLE |
TSCSDRPWKG | | DALPPSLALS | | RSQEPIYSEE | | ASGPRSPLDM | | VSSRSSDAAR |
PVGQVDRHIQ | | LLVHGVGQAG | | PEITDELVRV | | LCRRLDEATL | | DVITVMLVRN |
CKLTPADVEF | | IQPPGSLPSE | | VLHLALPTSC | | RPWLPALAWY | | LRQNLLIFLH |
SPKYTDSNSR | | NHFQHPLPPQ | | GGLPDLDIYL | | YNKPGGQGTG | | GKGVACITLA |
FVDEGGAPLS | | LALWPPSSPG | | PPDPLREEEF | | EQLTQVIRCP | | VVVDSSSAQN |
GAPRLRLDVW | | EKGNISIVQL | | EEKLRGAARQ | | ALADAIIELQ | | LLPASLCTED |
TPTGSLRNGS | | LETKSSAGRA | | STFPPAPVPG | | EPVTPPSKAG | | RRSFWDMLSK |
TECGDLGSPK | | TTDDIVLDRP | | EDTRGRRRHK | | TESVRTPGGA | | ERAPGSDSGA |
QRQKRRTTQL | | EEGEVGTLHP | | VFARVAQRWM | | EFMVQIGCAS | | VSRSSAHMVS |
RFLLPSILSE | | FTALVTSMAG | | DTSVRIFEQH | | LGSEPEIFGP | | CSPGQLGPSP |
RPAAERHLLL | | LGRNFLQWRR | | PTQQAAKAMQ | | RFEPGGDGSS | | GRNAPRQRLL |
LLEVVDKKLQ | | LLTYNWAPDL | | GAALGRALVR | | LVQWQNARAH | | LIFCLLSQKL |
GLFHHYGQLD | | FPVRDEKEPN | | PFLLPTMEVE | | TLIRSASPPL | | SREQGRLSGS |
SRGGGPLPLD | | TFPFDEALRD | | ITAARPSSVL | | GPVPRPPDPV | | TYHGQQFLEI |
KMAERRELER | | QMKMENLFVT | | WQQRSTPATM | | PISAGELETL | | KQSSRLVHYC |
ATAMLFDPAA | | WLHGPPETSG | | PPDGQRRHRP | | ESGSGSREAP | | TSCESLDVSP |
PGAREEPWLK | | ELSLAFLQQY | | VQYLQSIGFV | | LVPLRPPSPA | | RSTSRPRAMA |
ILGTEGRGSF | | SCPKTKTDGS | | PKSTSSPVTT | | YHLQRALPGG | | IILMELAFQG |
CYFCVKQFAL | | ECSRIPMGQA | | VNSQLSMLFT | | EECDKVRDLM | | HVHSFSYDFH |
LRLVHQHVLG | | AHLVLRHGYH | | LTTFLRHFLA | | HHPDGPHFGR | | NHIYQGTLEL |
PTPLIAAHQL | | YNYVADHASS | | YHMKPLRMAR | | PGGPEHNEYA | | LVSAWHSSGS |
YLDSEGLRHQ | | DDFDVSLLVC | | HCAAPFEEQG | | EAERHVLRLQ | | FFVVLTSQRE |
LFPRLTADMR | | RFRKPPRLPP | | EPEAPGSSAG | | SPGEASGLIL | | APGPAPLFPP |
LAAEVGMARA | | RLAQLVRLAG | | GHCRRDTLWK | | RLFLLEPPGP | | DRLRLGGRLA |
LAELEELLEA | | VHAKSIGDID | | PQLDCFLSMT | | VSWYQSLIKV | | LLSRFPQSCR |
HFQSPDLGTQ | | YLVVLNQKFT | | DCFVLVFLDS | | HLGKTSLTVV | | FREPFPVQPQ |
DSESPPAQLV | | STYHHLESVI | | NTACFTLWTR | | LL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі, пероксисомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Peng M., Yin N., Li M.O. (2017). SZT2 dictates GATOR control of mTORC1 signalling. Nature. 543: 433—437. PMID 28199315 DOI:10.1038/nature21378
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29040 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q5T011 (англ.) . Архів оригіналу за 8 березня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |