TARBP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CPN, 3ADL, 3LLH, 4WYQ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TARBP2, LOQS, TRBP, TRBP1, TRBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, TARBP2 subunit of RISC loading complex |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605053 MGI: 103027 HomoloGene: 7562 GeneCards: TARBP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • siRNA binding • RNA binding • enzyme binding • pre-mRNA binding • double-stranded RNA binding • identical protein binding • protein homodimerization activity • pre-miRNA binding • miRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • RISC-loading complex • RISC |
---|
Біологічний процес | • regulation of viral transcription • negative regulation of protein kinase activity • multicellular organism growth • positive regulation of translation • single fertilization • negative regulation of defense response to virus by host • spermatid development • positive regulation of viral genome replication • regulation of translation • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • GO:0061715 miRNA metabolic process • Сайленсинг генів • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • pre-miRNA processing • regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of muscle cell differentiation • neural precursor cell proliferation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004178 NM_134323 NM_134324 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_004169 NP_599150 NP_599151 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 53.5 – 53.51 Mb | Хр. 15: 102.43 – 102.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TARBP2 (англ. TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 39 039[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSEEEQGSGT | | TTGCGLPSIE | | QMLAANPGKT | | PISLLQEYGT | | RIGKTPVYDL |
LKAEGQAHQP | | NFTFRVTVGD | | TSCTGQGPSK | | KAAKHKAAEV | | ALKHLKGGSM |
LEPALEDSSS | | FSPLDSSLPE | | DIPVFTAAAA | | ATPVPSVVLT | | RSPPMELQPP |
VSPQQSECNP | | VGALQELVVQ | | KGWRLPEYTV | | TQESGPAHRK | | EFTMTCRVER |
FIEIGSGTSK | | KLAKRNAAAK | | MLLRVHTVPL | | DARDGNEVEP | | DDDHFSIGVG |
SRLDGLRNRG | | PGCTWDSLRN | | SVGEKILSLR | | SCSLGSLGAL | | GPACCRVLSE |
LSEEQAFHVS | | YLDIEELSLS | | GLCQCLVELS | | TQPATVCHGS | | ATTREAARGE |
AARRALQYLK | | IMAGSK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Gatignol A., Buckler-White A.J., Berkhout B., Jeang K.T. (1991). Characterization of a human TAR RNA-binding protein that activates the HIV-1 LTR. Science. 251: 1597—1600. PMID 2011739 DOI:10.1126/science.2011739
- Kozak C.A., Gatignol A., Graham K., Jeang K.T., McBride O.W. (1995). Genetic mapping in human and mouse of the locus encoding TRBP, a protein that binds the TAR region of the human immunodeficiency virus (HIV-1). Genomics. 25: 66—72. PMID 7774957 DOI:10.1016/0888-7543(95)80110-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gatignol A., Buckler C., Jeang K.T. (1993). Relatedness of an RNA-binding motif in human immunodeficiency virus type 1 TAR RNA-binding protein TRBP to human P1/dsI kinase and Drosophila staufen. Mol. Cell. Biol. 13: 2193—2202. PMID 8455607 DOI:10.1128/MCB.13.4.2193
- Gregory R.I., Chendrimada T.P., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). Human RISC couples microRNA biogenesis and posttranscriptional gene silencing. Cell. 123: 631—640. PMID 16271387 DOI:10.1016/j.cell.2005.10.022
- Maniataki E., Mourelatos Z. (2005). A human, ATP-independent, RISC assembly machine fueled by pre-miRNA. Genes Dev. 19: 2979—2990. PMID 16357216 DOI:10.1101/gad.1384005
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11569 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q15633 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |