TCEA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1TFI, 3NDQ, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8, 5IYC | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TCEA1, GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, transcription elongation factor A1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601425 MGI: 1196624 HomoloGene: 55984 GeneCards: TCEA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription factor TFIID complex |
---|
Біологічний процес | • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of exoribonuclease activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001159750 NM_001159751 NM_011541 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001153222 NP_001153223 NP_035671 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 53.97 – 54.02 Mb | Хр. 1: 4.93 – 4.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TCEA1 (англ. Transcription elongation factor A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 33 970[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEDEVVRFAK | | KMDKMVQKKN | | AAGALDLLKE | | LKNIPMTLEL | | LQSTRIGMSV |
NAIRKQSTDE | | EVTSLAKSLI | | KSWKKLLDGP | | STEKDLDEKK | | KEPAITSQNS |
PEAREESTSS | | GNVSNRKDET | | NARDTYVSSF | | PRAPSTSDSV | | RLKCREMLAA |
ALRTGDDYIA | | IGADEEELGS | | QIEEAIYQEI | | RNTDMKYKNR | | VRSRISNLKD |
AKNPNLRKNV | | LCGNIPPDLF | | ARMTAEEMAS | | DELKEMRKNL | | TKEAIREHQM |
AKTGGTQTDL | | FTCGKCKKKN | | CTYTQVQTRS | | ADEPMTTFVV | | CNECGNRWKF |
C |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Chen H.C., England L., Kane C.M. (1992). Characterization of a HeLa cDNA clone encoding the human SII protein, an elongation factor for RNA polymerase II. Gene. 116: 253—258. PMID 1378807 DOI:10.1016/0378-1119(92)90522-Q
- Park H.R., Baek K.H., Jeon C.J., Agarwal K., Yoo O. (1994). Characterization of the gene encoding the human transcriptional elongation factor TFIIS. Gene. 139: 263—267. PMID 8112616 DOI:10.1016/0378-1119(94)90767-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Qian X., Jeon C., Yoon H., Agarwal K., Weiss M.A. (1993). Structure of a new nucleic-acid-binding motif in eukaryotic transcriptional elongation factor TFIIS. Nature. 365: 277—279. PMID 7626141 DOI:10.1038/365277a0
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11612 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P23193 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |