TGS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3EGI, 3GDH

Ідентифікатори

Символи

TGS1, NCOA6IP, PIMT, PIPMT, trimethylguanosine synthase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606461 MGI: 2151797 HomoloGene: 32608 GeneCards: TGS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • RNA trimethylguanosine synthase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA methyltransferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • Тільце Кахаля • нуклеоплазма • ядерце • small nuclear ribonucleoprotein complex • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • spliceosomal snRNP assembly • Метилювання • 7-methylguanosine RNA capping • 7-methylguanosine cap hypermethylation • ribonucleoprotein complex biogenesis • RNA methylation • regulation of lipid metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


96764


116940

Ensembl


ENSG00000137574


ENSMUSG00000028233

UniProt


Q96RS0


Q923W1

RefSeq (мРНК)


NM_024831 NM_001317902 NM_001363184


NM_054089

RefSeq (білок)


NP_001304831 NP_079107 NP_001350113


NP_473430

Локус (UCSC)

Хр. 8: 55.77 – 55.83 Mb

Хр. 4: 3.57 – 3.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TGS1 (англ. Trimethylguanosine synthase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 96 620^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCCEKWSRVA	EMFLFIEERE	DCKILCLCSR	AFVEDRKLYN	LGLKGYYIRD
SGNNSGDQAT	EEEEGGYSCG	TAESHDSKGI	GLDESELDSE	AELMRSMGLP
LQFGRITAHK	DFEVSMNTRN	KVKIKKKKHQ	KKYLDEIVQE	SWRKEYEEDD
ILASDDPSSI	EQYENTRTYE	LQSKKDTETE	NPPVENTLSP	KLEITEKWEK
YWNEYGGGLL	WQSWQEKHPG	QALSSEPWNF	PDTKEEWEQH	YSQLYWYYLE
QFQYWEAQGW	TFDASQSCDT	DTYTSKTEAD	DKNDEKCMKV	DLVSFPSSPI
MVDNDSSGTS	DKDHSEILDG	ISNIKLNSEE	VTQSQLDSCT	SHDGHQQLSE
VSSKRECPAS	GQSEPRNGGT	NEESNSSGNT	NTDPPAEDSQ	KSSGANTSKD
RPHASGTDGD	ESEEDPPEHK	PSKLKRSHEL	DIDENPASDF	DDSGSLLGFK
YGSGQKYGGI	PNFSHRQVRY	LEKNVKLKSK	YLDMRRQIKM	KNKHIFFTKE
SEKPFFKKSK	ILSKVEKFLT	WVNKPMDEEA	SQESSSHDNV	HDASTSSDSE
EQDMSVKKGD	DLLETNNPEP	EKCQSVSSAG	ELETENYERD	SLLATVPDEQ
DCVTQEVPDS	RQAETEAEVK	KKKNKKKNKK	VNGLPPEIAA	VPELAKYWAQ
RYRLFSRFDD	GIKLDREGWF	SVTPEKIAEH	IAGRVSQSFK	CDVVVDAFCG
VGGNTIQFAL	TGMRVIAIDI	DPVKIALARN	NAEVYGIADK	IEFICGDFLL
LASFLKADVV	FLSPPWGGPD	YATAETFDIR	TMMSPDGFEI	FRLSKKITNN
IVYFLPRNAD	IDQVASLAGP	GGQVEIEQNF	LNNKLKTITA	YFGDLIRRPA
SET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Monecke T., Dickmanns A., Strasser A., Ficner R. (2009). Structure analysis of the conserved methyltransferase domain of human trimethylguanosine synthase TGS1. Acta Crystallogr. D. 65: 332—338. PMID 19307714 DOI:10.1107/S0907444909003102
Monecke T., Dickmanns A., Ficner R. (2009). Structural basis for m7G-cap hypermethylation of small nuclear, small nucleolar and telomerase RNA by the dimethyltransferase TGS1. Nucleic Acids Res. 37: 3865—3877. PMID 19386620 DOI:10.1093/nar/gkp249

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17843 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96RS0 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.