TNFRSF18

Ідентифікатори

Символи

TNFRSF18, AITR, CD357, GITR, GITR-D, tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, TNF receptor superfamily member 18, ENERGEN

Зовнішні ІД

OMIM: 603905 MGI: 894675 HomoloGene: 48270 GeneCards: TNFRSF18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• tumor necrosis factor-activated receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз • multicellular organism development • response to lipopolysaccharide • inflammatory response • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of leukocyte migration • negative regulation of apoptotic process • regulation of apoptotic process • apoptotic signaling pathway • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • regulation of regulatory T cell differentiation • positive regulation of cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8784


21936

Ensembl


ENSG00000186891


ENSMUSG00000041954

UniProt


Q9Y5U5


O35714

RefSeq (мРНК)


NM_148902 NM_004195 NM_148901


NM_009400 NM_021985

RefSeq (білок)


NP_004186 NP_683699 NP_683700


NP_033426 NP_068820

Локус (UCSC)

Хр. 1: 1.2 – 1.21 Mb

Хр. 4: 156.11 – 156.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNFRSF18 (англ. TNF receptor superfamily member 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 241 амінокислот, а молекулярна маса — 26 000^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQHGAMGAF	RALCGLALLC	ALSLGQRPTG	GPGCGPGRLL	LGTGTDARCC
RVHTTRCCRD	YPGEECCSEW	DCMCVQPEFH	CGDPCCTTCR	HHPCPPGQGV
QSQGKFSFGF	QCIDCASGTF	SGGHEGHCKP	WTDCTQFGFL	TVFPGNKTHN
AVCVPGSPPA	EPLGWLTVVL	LAVAACVLLL	TSAQLGLHIW	QLRSQCMWPR
ETQLLLEVPP	STEDARSCQF	PEEERGERSA	EEKGRLGDLW	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11914 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5U5 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.