TOP2B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3QX3, 4G0U, 4G0V, 4G0W, 4J3N | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TOP2B, TOPIIB, top2beta, topoisomerase (DNA) II beta, DNA topoisomerase II beta, BILU |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 126431 MGI: 98791 HomoloGene: 134711 GeneCards: TOP2B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity • nucleotide binding • DNA binding • histone deacetylase binding • chromatin binding • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • DNA topoisomerase activity • protein C-terminus binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • ATP binding • protein kinase C binding • ribonucleoprotein complex binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин • ядерце • клітинне ядро • цитоплазма • Рибонуклеопротеїни • viral integration complex |
---|
Біологічний процес | • resolution of meiotic recombination intermediates • аксоноґенеза • DNA metabolic process • neuron migration • forebrain development • mitotic DNA integrity checkpoint signaling • sister chromatid segregation • DNA topological change • positive regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 25.6 – 25.66 Mb | Хр. 14: 6.03 – 6.1 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TOP2B (англ. Topoisomerase (DNA) II beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 183 267[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAKSGGCGAG | | AGVGGGNGAL | | TWVTLFDQNN | | AAKKEESETA | | NKNDSSKKLS |
VERVYQKKTQ | | LEHILLRPDT | | YIGSVEPLTQ | | FMWVYDEDVG | | MNCREVTFVP |
GLYKIFDEIL | | VNAADNKQRD | | KNMTCIKVSI | | DPESNIISIW | | NNGKGIPVVE |
HKVEKVYVPA | | LIFGQLLTSS | | NYDDDEKKVT | | GGRNGYGAKL | | CNIFSTKFTV |
ETACKEYKHS | | FKQTWMNNMM | | KTSEAKIKHF | | DGEDYTCITF | | QPDLSKFKME |
KLDKDIVALM | | TRRAYDLAGS | | CRGVKVMFNG | | KKLPVNGFRS | | YVDLYVKDKL |
DETGVALKVI | | HELANERWDV | | CLTLSEKGFQ | | QISFVNSIAT | | TKGGRHVDYV |
VDQVVGKLIE | | VVKKKNKAGV | | SVKPFQVKNH | | IWVFINCLIE | | NPTFDSQTKE |
NMTLQPKSFG | | SKCQLSEKFF | | KAASNCGIVE | | SILNWVKFKA | | QTQLNKKCSS |
VKYSKIKGIP | | KLDDANDAGG | | KHSLECTLIL | | TEGDSAKSLA | | VSGLGVIGRD |
RYGVFPLRGK | | ILNVREASHK | | QIMENAEINN | | IIKIVGLQYK | | KSYDDAESLK |
TLRYGKIMIM | | TDQDQDGSHI | | KGLLINFIHH | | NWPSLLKHGF | | LEEFITPIVK |
ASKNKQELSF | | YSIPEFDEWK | | KHIENQKAWK | | IKYYKGLGTS | | TAKEAKEYFA |
DMERHRILFR | | YAGPEDDAAI | | TLAFSKKKID | | DRKEWLTNFM | | EDRRQRRLHG |
LPEQFLYGTA | | TKHLTYNDFI | | NKELILFSNS | | DNERSIPSLV | | DGFKPGQRKV |
LFTCFKRNDK | | REVKVAQLAG | | SVAEMSAYHH | | GEQALMMTIV | | NLAQNFVGSN |
NINLLQPIGQ | | FGTRLHGGKD | | AASPRYIFTM | | LSTLARLLFP | | AVDDNLLKFL |
YDDNQRVEPE | | WYIPIIPMVL | | INGAEGIGTG | | WACKLPNYDA | | REIVNNVRRM |
LDGLDPHPML | | PNYKNFKGTI | | QELGQNQYAV | | SGEIFVVDRN | | TVEITELPVR |
TWTQVYKEQV | | LEPMLNGTDK | | TPALISDYKE | | YHTDTTVKFV | | VKMTEEKLAQ |
AEAAGLHKVF | | KLQTTLTCNS | | MVLFDHMGCL | | KKYETVQDIL | | KEFFDLRLSY |
YGLRKEWLVG | | MLGAESTKLN | | NQARFILEKI | | QGKITIENRS | | KKDLIQMLVQ |
RGYESDPVKA | | WKEAQEKAAE | | EDETQNQHDD | | SSSDSGTPSG | | PDFNYILNMS |
LWSLTKEKVE | | ELIKQRDAKG | | REVNDLKRKS | | PSDLWKEDLA | | AFVEELDKVE |
SQEREDVLAG | | MSGKAIKGKV | | GKPKVKKLQL | | EETMPSPYGR | | RIIPEITAMK |
ADASKKLLKK | | KKGDLDTAAV | | KVEFDEEFSG | | APVEGAGEEA | | LTPSVPINKG |
PKPKREKKEP | | GTRVRKTPTS | | SGKPSAKKVK | | KRNPWSDDES | | KSESDLEETE |
PVVIPRDSLL | | RRAAAERPKY | | TFDFSEEEDD | | DADDDDDDNN | | DLEELKVKAS |
PITNDGEDEF | | VPSDGLDKDE | | YTFSPGKSKA | | TPEKSLHDKK | | SQDFGNLFSF |
PSYSQKSEDD | | SAKFDSNEED | | SASVFSPSFG | | LKQTDKVPSK | | TVAAKKGKPS |
SDTVPKPKRA | | PKQKKVVEAV | | NSDSDSEFGI | | PKKTTTPKGK | | GRGAKKRKAS |
GSENEGDYNP | | GRKTSKTTSK | | KPKKTSFDQD | | SDVDIFPSDF | | PTEPPSLPRT |
GRARKEVKYF | | AESDEEEDDV | | DFAMFN |
Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Austin C.A., Sng J.H., Patel S., Fisher L.M. (1993). Novel HeLa topoisomerase II is the II beta isoform: complete coding sequence and homology with other type II topoisomerases. Biochim. Biophys. Acta. 1172: 283—291. PMID 8383537 DOI:10.1016/0167-4781(93)90215-Y
- Austin C.A., Fisher L.M. (1990). Isolation and characterization of a human cDNA clone encoding a novel DNA topoisomerase II homologue from HeLa cells. FEBS Lett. 266: 115—117. PMID 2163884 DOI:10.1016/0014-5793(90)81520-X
- Yuwen H., Hsia C.C., Nakashima Y., Evangelista A., Tabor E. (1997). Binding of wild-type p53 by topoisomerase II and overexpression of topoisomerase II in human hepatocellular carcinoma. Biochem. Biophys. Res. Commun. 234: 194—197. PMID 9168988 DOI:10.1006/bbrc.1997.6539
- Davies S.L., Jenkins J.R., Hickson I.D. (1993). Human cells express two differentially spliced forms of topoisomerase II beta mRNA. Nucleic Acids Res. 21: 3719—3723. PMID 8396237 DOI:10.1093/nar/21.16.3719
- Mirski S.E., Bielawski J.C., Cole S.P. (2003). Identification of functional nuclear export sequences in human topoisomerase IIalpha and beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 905—911. PMID 12821127 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01077-5
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11990 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q02880 (англ.) . Архів оригіналу за 2 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Помилка Lua: bad argument #1 to 'gsub' (string expected, got boolean).
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |