TRA2B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/44/Protein_SFRS10_PDB_2cqc.png/250px-Protein_SFRS10_PDB_2cqc.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CQC, 2KXN, 2RRA, 2RRB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRA2B, Htra2-beta, PPP1R156, SFRS10, SRFS10, TRA2-BETA, TRAN2B, transformer 2 beta homolog (Drosophila), transformer 2 beta homolog |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602719 MGI: 106016 HomoloGene: 20965 GeneCards: TRA2B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly-purine tract binding • RNA binding • protein domain specific binding • pre-mRNA binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • nuclear inner membrane • нуклеоплазма • spliceosomal complex • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • RNA splicing, via transesterification reactions • Сплайсинг РНК • cerebral cortex regionalization • mRNA processing • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • embryonic brain development • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • regulation of RNA splicing • protein complex oligomerization • cellular response to glucose stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8b/PBB_GE_SFRS10_200893_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS10_200893_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2d/PBB_GE_SFRS10_200892_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS10_200892_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d7/PBB_GE_SFRS10_210180_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SFRS10_210180_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_009186 NM_001330554 NM_001330555 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001317483 NP_001317484 NP_033212 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 185.91 – 185.94 Mb | Хр. 16: 22.06 – 22.08 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRA2B (англ. Transformer 2 beta homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 33 666[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSDSGEQNYG | | ERESRSASRS | | GSAHGSGKSA | | RHTPARSRSK | | EDSRRSRSKS |
RSRSESRSRS | | RRSSRRHYTR | | SRSRSRSHRR | | SRSRSYSRDY | | RRRHSHSHSP |
MSTRRRHVGN | | RANPDPNCCL | | GVFGLSLYTT | | ERDLREVFSK | | YGPIADVSIV |
YDQQSRRSRG | | FAFVYFENVD | | DAKEAKERAN | | GMELDGRRIR | | VDFSITKRPH |
TPTPGIYMGR | | PTYGSSRRRD | | YYDRGYDRGY | | DDRDYYSRSY | | RGGGGGGGGW |
RAAQDRDQIY | | RRRSPSPYYS | | RGGYRSRSRS | | RSYSPRRY |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Nayler O., Cap C., Stamm S. (1998). Human transformer-2-beta gene (SFRS10): complete nucleotide sequence, chromosomal localization, and generation of a tissue-specific isoform. Genomics. 53: 191—202. PMID 9790768 DOI:10.1006/geno.1998.5471
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tacke R., Tohyama M., Ogawa S., Manley J.L. (1998). Human Tra2 proteins are sequence-specific activators of pre-mRNA splicing. Cell. 93: 139—148. PMID 9546399 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81153-8
- Eldridge A.G., Li Y., Sharp P.A., Blencowe B.J. (1999). The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6125—6130. PMID 10339552 DOI:10.1073/pnas.96.11.6125
- Hofmann Y., Wirth B. (2002). hnRNP-G promotes exon 7 inclusion of survival motor neuron (SMN) via direct interaction with Htra2-beta1. Hum. Mol. Genet. 11: 2037—2049. PMID 12165565 DOI:10.1093/hmg/11.17.2037
- Nasim M.T., Chernova T.K., Chowdhury H.M., Yue B.G., Eperon I.C. (2003). HnRNP G and Tra2beta: opposite effects on splicing matched by antagonism in RNA binding. Hum. Mol. Genet. 12: 1337—1348. PMID 12761049 DOI:10.1093/hmg/ddg136
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10781 (англ.) . Архів оригіналу за 19 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P62995 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |