TRAF6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1LB4, 1LB5, 1LB6, 2ECI, 2JMD, 3HCS, 3HCT, 3HCU, 4Z8M | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAF6, MGC:3310, RNF85, TNF receptor associated factor 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602355 MGI: 108072 HomoloGene: 3395 GeneCards: TRAF6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein N-terminus binding • histone deacetylase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • protein kinase binding • protein kinase B binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • identical protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • lipid droplet • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • cell cortex • endosome membrane • CD40 receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • response to interleukin-1 • toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • odontogenesis of dentin-containing tooth • animal organ morphogenesis • T-helper 1 type immune response • toll-like receptor 9 signaling pathway • regulation of apoptotic process • осифікація • cytokine-mediated signaling pathway • osteoclast differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • кісткова резорбція • JNK cascade • membrane protein intracellular domain proteolysis • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of T cell proliferation • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein autoubiquitination • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-2 production • positive regulation of T cell cytokine production • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • розвиток клітин • protein K63-linked ubiquitination • myeloid dendritic cell differentiation • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • neural tube closure • bone remodeling • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cellular response to lipopolysaccharide • T cell receptor signaling pathway • activation of protein kinase activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 36.48 – 36.51 Mb | Хр. 2: 101.51 – 101.53 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAF6 (англ. TNF receptor associated factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 573[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLLNCENSC | | GSSQSESDCC | | VAMASSCSAV | | TKDDSVGGTA | | STGNLSSSFM |
EEIQGYDVEF | | DPPLESKYEC | | PICLMALREA | | VQTPCGHRFC | | KACIIKSIRD |
AGHKCPVDNE | | ILLENQLFPD | | NFAKREILSL | | MVKCPNEGCL | | HKMELRHLED |
HQAHCEFALM | | DCPQCQRPFQ | | KFHINIHILK | | DCPRRQVSCD | | NCAASMAFED |
KEIHDQNCPL | | ANVICEYCNT | | ILIREQMPNH | | YDLDCPTAPI | | PCTFSTFGCH |
EKMQRNHLAR | | HLQENTQSHM | | RMLAQAVHSL | | SVIPDSGYIS | | EVRNFQETIH |
QLEGRLVRQD | | HQIRELTAKM | | ETQSMYVSEL | | KRTIRTLEDK | | VAEIEAQQCN |
GIYIWKIGNF | | GMHLKCQEEE | | KPVVIHSPGF | | YTGKPGYKLC | | MRLHLQLPTA |
QRCANYISLF | | VHTMQGEYDS | | HLPWPFQGTI | | RLTILDQSEA | | PVRQNHEEIM |
DAKPELLAFQ | | RPTIPRNPKG | | FGYVTFMHLE | | ALRQRTFIKD | | DTLLVRCEVS |
TRFDMGSLRR | | EGFQPRSTDA | | GV |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, пошкодження ДНК, убіквітинування білків, остеогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ліпідних краплях.
Література
- Cao Z., Xiong J., Takeuchi M., Kurama T., Goeddel D.V. (1996). TRAF6 is a signal transducer for interleukin-1. Nature. 383: 443—446. PMID 8837778 DOI:10.1038/383443a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Malinin N.L., Boldin M.P., Kovalenko A.V., Wallach D. (1997). MAP3K-related kinase involved in NF-kappaB induction by TNF, CD95 and IL-1. Nature. 385: 540—544. PMID 9020361 DOI:10.1038/385540a0
- Muzio M., Ni J., Feng P., Dixit V.M. (1997). IRAK (Pelle) family member IRAK-2 and MyD88 as proximal mediators of IL-1 signaling. Science. 278: 1612—1615. PMID 9374458 DOI:10.1126/science.278.5343.1612
- McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968
- Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999). Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6. J. Biol. Chem. 274: 2597—2600. PMID 9915784 DOI:10.1074/jbc.274.5.2597
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12036 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y4K3 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |