TRIM9

TRIM9
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2DB8

Ідентифікатори
Символи TRIM9, RNF91, SPRING, tripartite motif containing 9
Зовнішні ІД OMIM: 606555 MGI: 2137354 HomoloGene: 9045 GeneCards: TRIM9
Онтологія гена
Молекулярна функція

• зв'язування з іоном металу
• zinc ion binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein homodimerization activity
• transferase activity
• protein domain specific binding
• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
• SNARE binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• міжклітинні контакти
• дендрит (нейробіологія)
• cell projection
• синапс
• цитоскелет
• Синаптичні бульбашки
• внутрішньоклітинний
• гіалоплазма
• presynaptic cytosol

Біологічний процес

• negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis
• Убіквітин-залежний протеоліз
• negative regulation of SNARE complex assembly
• synaptic vesicle exocytosis
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
114088
94090
Ensembl
ENSG00000100505
ENSMUSG00000021071
UniProt
Q9C026
Q8C7M3
RefSeq (мРНК)
NM_015163
NM_052978
NM_001110202
NM_001110203
NM_001286386
NM_001286387
NM_001286388
NM_053167
RefSeq (білок)
NP_055978
NP_443210
NP_001103672
NP_001103673
NP_001273315
NP_001273316
NP_001273317
NP_444397
NP_001392290
NP_001392291
NP_001392292
NP_001392293
NP_001392294
NP_001392295
NP_001392296
NP_001392297
NP_001392298
NP_001392299
NP_001392300
NP_001392301
NP_001392302
NP_001392303
NP_001392304
NP_001392305
NP_001392306
NP_001392307
NP_001392308
NP_001392309
NP_001392310
NP_001392311
NP_001392312
NP_001392313
NP_001392314
NP_001392315
NP_001392316
Локус (UCSC) Хр. 14: 50.98 – 51.1 Mb Хр. 12: 70.29 – 70.39 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRIM9 (англ. Tripartite motif containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 710 амінокислот, а молекулярна маса — 79 177[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQTPESESPQSH
RAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVR
VFPPAMPPPATHLSPALAPVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRV
LEGVIDRYQQSKAAALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPP
RGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCY
QCLEEGKHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRN
MVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVR
DQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQW
GKGTLTPRMTTDFDLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEE
CCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNGGQFREVYVGKETMCTV
DGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDPGSAHSDII
LSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVAR
MDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVL
LDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGLFFPAVSLNRNVQVTLHTGLPVP
DFYSSRASIA

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16288 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9C026 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.